More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0733 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0733  citrate synthase 2  100 
 
 		 368 aa  741    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1005  Citrate (Si)-synthase  72.85 
 
 		 368 aa  533  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0520  citrate (Si)-synthase  72.85 
 
 		 368 aa  525  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.341938  normal  0.0162418 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0511  citrate synthase 2  69.89 
 
 		 368 aa  525  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.043222  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0834  Citrate (Si)-synthase  71.43 
 
 		 377 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8787  citrate synthase 2  73.7 
 
 		 378 aa  516  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.901315 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0830  Citrate (Si)-synthase  72.47 
 
 		 374 aa  513  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1262  Citrate (Si)-synthase  69.75 
 
 		 375 aa  508  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1016  Citrate (Si)-synthase  70.72 
 
 		 366 aa  509  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.525155  hitchhiker  0.00235766 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10908  citrate synthase 2  70.03 
 
 		 373 aa  508  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0423  citrate synthase 2  70.72 
 
 		 368 aa  510  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0247  citrate synthase 2  70.08 
 
 		 368 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.32184  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5025  citrate synthase 2  70.03 
 
 		 371 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0509  citrate synthase 2  72.47 
 
 		 371 aa  498  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4841  citrate synthase 2  68.63 
 
 		 376 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.169021 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1726  citrate synthase 2  69.75 
 
 		 373 aa  484  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5814  Citrate (Si)-synthase  71.23 
 
 		 361 aa  486  1e-136  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00482398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4459  citrate synthase 2  68.35 
 
 		 376 aa  485  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4546  citrate synthase 2  68.35 
 
 		 376 aa  485  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591553  normal  0.862054 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7229  citrate synthase 2  70.95 
 
 		 364 aa  483  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0081  citrate synthase 2  70.11 
 
 		 369 aa  479  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0115  citrate synthase 2  67.86 
 
 		 368 aa  478  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33820  citrate synthase 2  69.01 
 
 		 389 aa  476  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.655288  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0848  Citrate (Si)-synthase  60.5 
 
 		 368 aa  449  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4708  citrate synthase 2  65.35 
 
 		 370 aa  432  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0881  citrate synthase 2  49.04 
 
 		 351 aa  243  3.9999999999999997e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.154658  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3748  Citrate (Si)-synthase  41.24 
 
 		 388 aa  240  2e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6150  Citrate (Si)-synthase  39.05 
 
 		 391 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.153659 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  40.91 
 
 		 395 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3561  Citrate (Si)-synthase  37.89 
 
 		 387 aa  222  7e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141515  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4948  citrate synthase 2  38.77 
 
 		 364 aa  219  7.999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.257238  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2557  citrate synthase  40.59 
 
 		 391 aa  219  7.999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3093  Citrate (Si)-synthase  35.66 
 
 		 378 aa  207  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.832749 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7568  citrate synthase 2  38.27 
 
 		 362 aa  203  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.708852 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4146  citrate (Si)-synthase  35.92 
 
 		 375 aa  203  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2423  Citrate (Si)-synthase  34.95 
 
 		 377 aa  197  3e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2027  citrate synthase 2  35.54 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1830  citrate synthase 2  37.33 
 
 		 362 aa  192  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.011311 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2103  citrate synthase 2  35.42 
 
 		 364 aa  192  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.42 
 
 		 382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1729  Citrate (Si)-synthase  34.41 
 
 		 373 aa  185  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.120294  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2401  2-methylcitrate synthase  35.92 
 
 		 371 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.612256  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.86 
 
 		 378 aa  182  8.000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.57 
 
 		 385 aa  181  1e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0154  citrate synthase  37.2 
 
 		 374 aa  179  4.999999999999999e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.649155 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.8 
 
 		 430 aa  177  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.79 
 
 		 373 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1035  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.1 
 
 		 375 aa  178  2e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  34.22 
 
 		 373 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  33.07 
 
 		 378 aa  176  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.11 
 
 		 382 aa  176  6e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0857  citrate (Si)-synthase  36.97 
 
 		 390 aa  176  6e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.6 
 
 		 382 aa  176  6e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.69 
 
 		 380 aa  176  7e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1310  methylcitrate synthase  34.21 
 
 		 375 aa  176  8e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  32.74 
 
 		 387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2420  2-methylcitrate synthase  34.22 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0822163  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.07 
 
 		 378 aa  174  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1111  methylcitrate synthase  33.95 
 
 		 379 aa  172  5.999999999999999e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.98 
 
 		 379 aa  171  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1868  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.7 
 
 		 376 aa  172  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.650369  normal  0.135048 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  33.95 
 
 		 372 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3630  methylcitrate synthase  32.45 
 
 		 375 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  32.1 
 
 		 373 aa  171  3e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0344  methylcitrate synthase  33.24 
 
 		 375 aa  170  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  31.83 
 
 		 386 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  33.33 
 
 		 380 aa  170  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0314  methylcitrate synthase  32.45 
 
 		 375 aa  171  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3295  methylcitrate synthase  31.47 
 
 		 378 aa  170  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  31.83 
 
 		 386 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1665  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.18 
 
 		 374 aa  169  5e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2604  2-methylcitrate synthase  33.42 
 
 		 374 aa  169  5e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.121252  hitchhiker  0.000290432 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0072  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.24 
 
 		 372 aa  169  7e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3826  methylcitrate synthase  32.7 
 
 		 375 aa  169  7e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4141  methylcitrate synthase  32.45 
 
 		 379 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  32.81 
 
 		 381 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4022  methylcitrate synthase  32.45 
 
 		 375 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1198  methylcitrate synthase  31.23 
 
 		 376 aa  168  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3946  methylcitrate synthase  32.45 
 
 		 375 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  32.72 
 
 		 378 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  32.81 
 
 		 378 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1420  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.12 
 
 		 374 aa  167  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.85 
 
 		 377 aa  167  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  33.95 
 
 		 372 aa  168  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3645  methylcitrate synthase  32.18 
 
 		 375 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2539  Citrate (Si)-synthase  36.07 
 
 		 374 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.64966  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  32.81 
 
 		 381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4048  methylcitrate synthase  32.18 
 
 		 375 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  32.81 
 
 		 381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0421  methylcitrate synthase  34.48 
 
 		 389 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0258062 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0403  methylcitrate synthase  34.48 
 
 		 389 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0409  methylcitrate synthase  34.48 
 
 		 389 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000027346 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1176  2-methylcitrate synthase  32.22 
 
 		 372 aa  166  5e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.831059  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4355  methylcitrate synthase  32.27 
 
 		 391 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0820  2-methylcitrate synthase  32.22 
 
 		 372 aa  166  5e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6707  methylcitrate synthase  32.27 
 
 		 389 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0622  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.52 
 
 		 367 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0115525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0647  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.52 
 
 		 367 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.029125  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03371  methylcitrate synthase  32.55 
 
 		 373 aa  165  9e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  30.65 
 
 		 373 aa  165  9e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>