More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0834 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0834  Citrate (Si)-synthase  100 
 
 
377 aa  753    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0520  citrate (Si)-synthase  78.8 
 
 
368 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.341938  normal  0.0162418 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33820  citrate synthase 2  80.35 
 
 
389 aa  540  9.999999999999999e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.655288  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1005  Citrate (Si)-synthase  77.94 
 
 
368 aa  540  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5025  citrate synthase 2  74.86 
 
 
371 aa  523  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10908  citrate synthase 2  74.79 
 
 
373 aa  518  1e-146  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0247  citrate synthase 2  75.07 
 
 
368 aa  520  1e-146  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.32184  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1262  Citrate (Si)-synthase  74.72 
 
 
375 aa  519  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0509  citrate synthase 2  76.59 
 
 
371 aa  514  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0830  Citrate (Si)-synthase  75.71 
 
 
374 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0733  citrate synthase 2  70.6 
 
 
368 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8787  citrate synthase 2  74.08 
 
 
378 aa  512  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.901315 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0511  citrate synthase 2  70.79 
 
 
368 aa  513  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.043222  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1726  citrate synthase 2  75.28 
 
 
373 aa  508  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0423  citrate synthase 2  71.63 
 
 
368 aa  498  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4841  citrate synthase 2  73.65 
 
 
376 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.169021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4459  citrate synthase 2  73.37 
 
 
376 aa  494  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4546  citrate synthase 2  73.37 
 
 
376 aa  494  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591553  normal  0.862054 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1016  Citrate (Si)-synthase  70.74 
 
 
366 aa  494  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.525155  hitchhiker  0.00235766 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0115  citrate synthase 2  70.51 
 
 
368 aa  485  1e-136  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7229  citrate synthase 2  70.94 
 
 
364 aa  474  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0081  citrate synthase 2  70.66 
 
 
369 aa  472  1e-132  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5814  Citrate (Si)-synthase  70.03 
 
 
361 aa  471  1e-132  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00482398 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4708  citrate synthase 2  72.65 
 
 
370 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0848  Citrate (Si)-synthase  64.47 
 
 
368 aa  447  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3748  Citrate (Si)-synthase  42.51 
 
 
388 aa  253  5.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0881  citrate synthase 2  49.52 
 
 
351 aa  238  9e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.154658  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6150  Citrate (Si)-synthase  38.29 
 
 
391 aa  226  6e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.153659 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3561  Citrate (Si)-synthase  37.6 
 
 
387 aa  220  3.9999999999999997e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141515  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4948  citrate synthase 2  40.27 
 
 
364 aa  218  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.257238  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3093  Citrate (Si)-synthase  36.39 
 
 
378 aa  213  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.832749 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  37.2 
 
 
395 aa  211  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2557  citrate synthase  40.66 
 
 
391 aa  207  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1830  citrate synthase 2  37.57 
 
 
362 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.011311 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2103  citrate synthase 2  37.23 
 
 
364 aa  193  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2027  citrate synthase 2  35.58 
 
 
362 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2539  Citrate (Si)-synthase  36.9 
 
 
374 aa  189  9e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.64966  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4146  citrate (Si)-synthase  34.82 
 
 
375 aa  187  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7568  citrate synthase 2  35.64 
 
 
362 aa  187  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.708852 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1729  Citrate (Si)-synthase  34.25 
 
 
373 aa  186  5e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.120294  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.24 
 
 
378 aa  185  9e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  32.63 
 
 
378 aa  182  7e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2423  Citrate (Si)-synthase  32.97 
 
 
377 aa  180  2.9999999999999997e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.42 
 
 
430 aa  180  4e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2420  Citrate synthase  33.33 
 
 
481 aa  177  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.04 
 
 
387 aa  178  2e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  32.98 
 
 
387 aa  177  4e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  32.62 
 
 
378 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.23 
 
 
373 aa  176  8e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  34.96 
 
 
373 aa  176  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0857  citrate (Si)-synthase  38.9 
 
 
390 aa  174  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1035  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.4 
 
 
375 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.4 
 
 
378 aa  173  5e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0612  citrate synthase  33.33 
 
 
386 aa  173  5e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.148892  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  33.78 
 
 
375 aa  172  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.55 
 
 
377 aa  172  7.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  32.27 
 
 
386 aa  172  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  32.27 
 
 
386 aa  172  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0154  citrate synthase  34.84 
 
 
374 aa  171  1e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.649155 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  34.66 
 
 
397 aa  172  1e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  29.84 
 
 
373 aa  171  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  33.51 
 
 
375 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  33.69 
 
 
381 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2821  putative 2-methylcitrate synthase  30.75 
 
 
374 aa  171  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.702751  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  33.42 
 
 
381 aa  170  4e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  33.42 
 
 
381 aa  170  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2321  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.71 
 
 
384 aa  170  4e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  32.88 
 
 
378 aa  170  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0279  citrate synthase  33.87 
 
 
396 aa  169  5e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1420  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.59 
 
 
374 aa  169  5e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1858  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.43 
 
 
374 aa  169  5e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2112  2-methylcitrate synthase  30.89 
 
 
374 aa  169  8e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.08 
 
 
382 aa  169  8e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  32.17 
 
 
389 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  32.89 
 
 
381 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0072  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.07 
 
 
372 aa  168  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2498  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.32 
 
 
374 aa  167  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0246552 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1821  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.79 
 
 
374 aa  166  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1665  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.79 
 
 
374 aa  166  5e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.42 
 
 
385 aa  166  5e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1580  citrate synthase  31.54 
 
 
383 aa  166  6.9999999999999995e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2401  2-methylcitrate synthase  32.78 
 
 
371 aa  166  9e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.612256  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3065  citrate synthase  31.02 
 
 
386 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2672  citrate synthase  31.02 
 
 
386 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.530506  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0622  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.15 
 
 
367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0115525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0647  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.15 
 
 
367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.029125  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  31.79 
 
 
370 aa  165  2.0000000000000002e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3826  methylcitrate synthase  31.32 
 
 
375 aa  164  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0344  methylcitrate synthase  31.09 
 
 
375 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3295  methylcitrate synthase  32.13 
 
 
378 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4048  methylcitrate synthase  30.85 
 
 
375 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4022  methylcitrate synthase  30.85 
 
 
375 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3946  methylcitrate synthase  30.85 
 
 
375 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4141  methylcitrate synthase  30.85 
 
 
379 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3645  methylcitrate synthase  30.59 
 
 
375 aa  162  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.36 
 
 
382 aa  161  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2420  2-methylcitrate synthase  30.97 
 
 
375 aa  161  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0822163  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3630  methylcitrate synthase  31.05 
 
 
375 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1868  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.08 
 
 
376 aa  161  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.650369  normal  0.135048 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  30.21 
 
 
373 aa  161  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>