More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1262 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10908  citrate synthase 2  85.75 
 
 		 373 aa  648    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1262  Citrate (Si)-synthase  100 
 
 		 375 aa  756    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5025  citrate synthase 2  86.03 
 
 		 371 aa  643    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4841  citrate synthase 2  86.34 
 
 		 376 aa  624  1e-178  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.169021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4459  citrate synthase 2  86.07 
 
 		 376 aa  623  1e-177  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1726  citrate synthase 2  85.22 
 
 		 373 aa  624  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4546  citrate synthase 2  86.07 
 
 		 376 aa  623  1e-177  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591553  normal  0.862054 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0830  Citrate (Si)-synthase  79.23 
 
 		 374 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0509  citrate synthase 2  79.67 
 
 		 371 aa  567  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0511  citrate synthase 2  71.94 
 
 		 368 aa  550  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.043222  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0848  Citrate (Si)-synthase  72.22 
 
 		 368 aa  535  1e-151  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8787  citrate synthase 2  72.16 
 
 		 378 aa  529  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.901315 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0423  citrate synthase 2  71.67 
 
 		 368 aa  529  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33820  citrate synthase 2  75.41 
 
 		 389 aa  530  1e-149  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.655288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1016  Citrate (Si)-synthase  72.18 
 
 		 366 aa  528  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.525155  hitchhiker  0.00235766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1005  Citrate (Si)-synthase  72.53 
 
 		 368 aa  526  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0834  Citrate (Si)-synthase  74.72 
 
 		 377 aa  519  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0733  citrate synthase 2  69.75 
 
 		 368 aa  508  1e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0520  citrate (Si)-synthase  70.14 
 
 		 368 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.341938  normal  0.0162418 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0247  citrate synthase 2  69.02 
 
 		 368 aa  500  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.32184  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7229  citrate synthase 2  71.99 
 
 		 364 aa  485  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0081  citrate synthase 2  71.15 
 
 		 369 aa  479  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0115  citrate synthase 2  69.53 
 
 		 368 aa  479  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4708  citrate synthase 2  69.42 
 
 		 370 aa  466  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5814  Citrate (Si)-synthase  69.64 
 
 		 361 aa  461  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00482398 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0881  citrate synthase 2  52.73 
 
 		 351 aa  266  5.999999999999999e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.154658  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3748  Citrate (Si)-synthase  39.47 
 
 		 388 aa  238  9e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6150  Citrate (Si)-synthase  36.77 
 
 		 391 aa  216  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.153659 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4948  citrate synthase 2  40.74 
 
 		 364 aa  210  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.257238  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3561  Citrate (Si)-synthase  35.6 
 
 		 387 aa  207  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141515  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  36.12 
 
 		 395 aa  205  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2557  citrate synthase  36.97 
 
 		 391 aa  204  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2103  citrate synthase 2  37.6 
 
 		 364 aa  203  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1830  citrate synthase 2  36.81 
 
 		 362 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.011311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3093  Citrate (Si)-synthase  34.15 
 
 		 378 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.832749 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2027  citrate synthase 2  34.34 
 
 		 362 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3946  methylcitrate synthase  32.53 
 
 		 375 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4141  methylcitrate synthase  32.53 
 
 		 379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4022  methylcitrate synthase  32.53 
 
 		 375 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4048  methylcitrate synthase  32.8 
 
 		 375 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1420  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.27 
 
 		 374 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3645  methylcitrate synthase  32.27 
 
 		 375 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.13 
 
 		 377 aa  182  7e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0344  methylcitrate synthase  32.8 
 
 		 375 aa  181  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  33.68 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4146  citrate (Si)-synthase  33.78 
 
 		 375 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7568  citrate synthase 2  43.96 
 
 		 362 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.708852 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2112  2-methylcitrate synthase  31.02 
 
 		 374 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3295  methylcitrate synthase  33.42 
 
 		 378 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1821  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32 
 
 		 374 aa  179  9e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2423  Citrate (Si)-synthase  33.51 
 
 		 377 aa  179  9e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1198  methylcitrate synthase  31.82 
 
 		 376 aa  178  1e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1729  Citrate (Si)-synthase  33.33 
 
 		 373 aa  179  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.120294  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2321  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.2 
 
 		 384 aa  177  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2498  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.48 
 
 		 374 aa  177  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0246552 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3826  methylcitrate synthase  32.71 
 
 		 375 aa  176  5e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3630  methylcitrate synthase  32.71 
 
 		 375 aa  176  6e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0314  methylcitrate synthase  32.71 
 
 		 375 aa  176  7e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.78 
 
 		 430 aa  176  8e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.62 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1665  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.65 
 
 		 374 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2420  2-methylcitrate synthase  32.46 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0822163  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1858  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.95 
 
 		 374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1665  methylcitrate synthase  31.27 
 
 		 377 aa  172  7.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2420  Citrate synthase  32.44 
 
 		 481 aa  171  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0072  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.01 
 
 		 372 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2821  putative 2-methylcitrate synthase  29.46 
 
 		 374 aa  171  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.702751  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03371  methylcitrate synthase  32.35 
 
 		 373 aa  171  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2604  2-methylcitrate synthase  32.35 
 
 		 374 aa  169  7e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.121252  hitchhiker  0.000290432 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  33.24 
 
 		 386 aa  169  9e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1868  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.2 
 
 		 376 aa  169  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.650369  normal  0.135048 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  31.75 
 
 		 378 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  31.03 
 
 		 380 aa  167  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2401  2-methylcitrate synthase  32.1 
 
 		 371 aa  168  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.612256  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0154  citrate synthase  32.89 
 
 		 374 aa  167  4e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.649155 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.81 
 
 		 378 aa  166  5e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  33.07 
 
 		 378 aa  166  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  31.66 
 
 		 381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4723  methylcitrate synthase  31.55 
 
 		 375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53950  methylcitrate synthase  31.55 
 
 		 375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.282102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  31 
 
 		 374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1347  methylcitrate synthase  32.56 
 
 		 389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  31.4 
 
 		 381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  31.4 
 
 		 381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2539  Citrate (Si)-synthase  34.97 
 
 		 374 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.64966  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  32.64 
 
 		 372 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  28.35 
 
 		 375 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0647  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.62 
 
 		 367 aa  163  6e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.029125  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0715  citrate synthase  30.11 
 
 		 355 aa  162  6e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0622  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.62 
 
 		 367 aa  163  6e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0115525  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1310  methylcitrate synthase  31.28 
 
 		 375 aa  162  6e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  31.75 
 
 		 373 aa  162  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  32.44 
 
 		 372 aa  162  9e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3584  citrate synthase I  31.06 
 
 		 425 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887444 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.28 
 
 		 380 aa  162  1e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3065  citrate synthase  30.49 
 
 		 386 aa  162  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  29.89 
 
 		 386 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  29.89 
 
 		 386 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2208  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.91 
 
 		 374 aa  162  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.539974  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2672  citrate synthase  30.49 
 
 		 386 aa  162  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.530506  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>