More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0509 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0509  citrate synthase 2  100 
 
 		 371 aa  735    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1262  Citrate (Si)-synthase  79.67 
 
 		 375 aa  592  1e-168  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5025  citrate synthase 2  79.34 
 
 		 371 aa  588  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10908  citrate synthase 2  78.3 
 
 		 373 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33820  citrate synthase 2  81.06 
 
 		 389 aa  568  1e-161  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.655288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4841  citrate synthase 2  78.85 
 
 		 376 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.169021 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1726  citrate synthase 2  79.83 
 
 		 373 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4459  citrate synthase 2  78.57 
 
 		 376 aa  560  1e-158  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4546  citrate synthase 2  78.57 
 
 		 376 aa  560  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591553  normal  0.862054 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0830  Citrate (Si)-synthase  77.41 
 
 		 374 aa  554  1e-157  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0511  citrate synthase 2  73.41 
 
 		 368 aa  550  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.043222  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1005  Citrate (Si)-synthase  74.24 
 
 		 368 aa  538  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0423  citrate synthase 2  73.68 
 
 		 368 aa  536  1e-151  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0834  Citrate (Si)-synthase  76.59 
 
 		 377 aa  536  1e-151  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0247  citrate synthase 2  73.89 
 
 		 368 aa  528  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.32184  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1016  Citrate (Si)-synthase  72.93 
 
 		 366 aa  529  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.525155  hitchhiker  0.00235766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8787  citrate synthase 2  74.73 
 
 		 378 aa  528  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.901315 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0520  citrate (Si)-synthase  73.68 
 
 		 368 aa  526  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.341938  normal  0.0162418 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0733  citrate synthase 2  72.47 
 
 		 368 aa  518  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0848  Citrate (Si)-synthase  69.36 
 
 		 368 aa  502  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0115  citrate synthase 2  73.26 
 
 		 368 aa  498  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7229  citrate synthase 2  72.19 
 
 		 364 aa  489  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0081  citrate synthase 2  72.68 
 
 		 369 aa  487  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4708  citrate synthase 2  72.27 
 
 		 370 aa  477  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5814  Citrate (Si)-synthase  71.43 
 
 		 361 aa  472  1e-132  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00482398 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0881  citrate synthase 2  55.31 
 
 		 351 aa  274  2.0000000000000002e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.154658  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3748  Citrate (Si)-synthase  42.62 
 
 		 388 aa  242  7.999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4948  citrate synthase 2  41.05 
 
 		 364 aa  227  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.257238  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  40.87 
 
 		 395 aa  225  8e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2557  citrate synthase  41.62 
 
 		 391 aa  221  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6150  Citrate (Si)-synthase  36.89 
 
 		 391 aa  216  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.153659 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3561  Citrate (Si)-synthase  37.81 
 
 		 387 aa  213  4.9999999999999996e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141515  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3093  Citrate (Si)-synthase  35.44 
 
 		 378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.832749 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2027  citrate synthase 2  37.26 
 
 		 362 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1830  citrate synthase 2  38.9 
 
 		 362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.011311 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2103  citrate synthase 2  37.7 
 
 		 364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7568  citrate synthase 2  48.77 
 
 		 362 aa  197  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.708852 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1729  Citrate (Si)-synthase  35.44 
 
 		 373 aa  191  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.120294  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2423  Citrate (Si)-synthase  44.75 
 
 		 377 aa  189  5.999999999999999e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4146  citrate (Si)-synthase  35.62 
 
 		 375 aa  188  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.96 
 
 		 373 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2539  Citrate (Si)-synthase  37.77 
 
 		 374 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.64966  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  34.19 
 
 		 387 aa  179  4.999999999999999e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1420  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.51 
 
 		 374 aa  179  9e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.24 
 
 		 385 aa  178  1e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2401  2-methylcitrate synthase  34.49 
 
 		 371 aa  178  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.612256  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  34.62 
 
 		 373 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2821  putative 2-methylcitrate synthase  30.77 
 
 		 374 aa  176  6e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.702751  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2112  2-methylcitrate synthase  31.02 
 
 		 374 aa  176  6e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0154  citrate synthase  35.9 
 
 		 374 aa  175  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.649155 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.79 
 
 		 378 aa  174  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  31.22 
 
 		 380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1198  methylcitrate synthase  30.81 
 
 		 376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2498  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.38 
 
 		 374 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0246552 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1858  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.93 
 
 		 374 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2321  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.69 
 
 		 384 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.47 
 
 		 378 aa  173  5e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1665  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.32 
 
 		 374 aa  173  5e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2420  Citrate synthase  31.66 
 
 		 481 aa  172  5.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.53 
 
 		 430 aa  172  6.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2420  2-methylcitrate synthase  31.82 
 
 		 375 aa  171  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0822163  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4723  methylcitrate synthase  30.89 
 
 		 375 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53950  methylcitrate synthase  31.22 
 
 		 375 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.282102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1821  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.76 
 
 		 374 aa  171  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  32.88 
 
 		 378 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1035  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.73 
 
 		 375 aa  170  3e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3295  methylcitrate synthase  30.49 
 
 		 378 aa  169  6e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2288  2-methylcitrate synthase  31.95 
 
 		 375 aa  169  8e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.037213  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0072  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.69 
 
 		 372 aa  169  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.86 
 
 		 382 aa  168  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.55 
 
 		 377 aa  167  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  31.77 
 
 		 378 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1868  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.23 
 
 		 376 aa  168  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.650369  normal  0.135048 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4141  methylcitrate synthase  30.05 
 
 		 379 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.07 
 
 		 382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3946  methylcitrate synthase  30.05 
 
 		 375 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4022  methylcitrate synthase  30.05 
 
 		 375 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2081  methylcitrate synthase  33.42 
 
 		 404 aa  166  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.847456  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2672  citrate synthase  30.93 
 
 		 386 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.530506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3065  citrate synthase  30.93 
 
 		 386 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0344  methylcitrate synthase  30.97 
 
 		 375 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0647  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.5 
 
 		 367 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.029125  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1111  methylcitrate synthase  30.93 
 
 		 379 aa  166  6.9999999999999995e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2604  2-methylcitrate synthase  32.1 
 
 		 374 aa  166  6.9999999999999995e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.121252  hitchhiker  0.000290432 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3826  methylcitrate synthase  30.69 
 
 		 375 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0622  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.5 
 
 		 367 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0115525  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  31.88 
 
 		 386 aa  166  8e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1310  methylcitrate synthase  30.23 
 
 		 375 aa  165  9e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3630  methylcitrate synthase  30.67 
 
 		 375 aa  166  9e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0314  methylcitrate synthase  30.67 
 
 		 375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3029  methylcitrate synthase  33.08 
 
 		 385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4048  methylcitrate synthase  29.79 
 
 		 375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3645  methylcitrate synthase  30.34 
 
 		 375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  31.64 
 
 		 386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  31.36 
 
 		 375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  32.02 
 
 		 378 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  31.64 
 
 		 386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03371  methylcitrate synthase  30.71 
 
 		 373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2335  methylcitrate synthase  30.29 
 
 		 375 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218689  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3435  methylcitrate synthase  30.29 
 
 		 375 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01089  normal  0.171025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>