More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0715 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0715  citrate synthase  100 
 
 
355 aa  737    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  48 
 
 
377 aa  340  2.9999999999999998e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  46.57 
 
 
385 aa  314  9.999999999999999e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.79 
 
 
390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  42.94 
 
 
373 aa  281  9e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  43.44 
 
 
372 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.29 
 
 
378 aa  280  3e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.06 
 
 
378 aa  280  3e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  41.09 
 
 
373 aa  279  6e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.67 
 
 
397 aa  279  7e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  43.96 
 
 
372 aa  279  7e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.19 
 
 
382 aa  279  7e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.32 
 
 
430 aa  278  1e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  41.26 
 
 
373 aa  277  2e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  41.26 
 
 
373 aa  277  2e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  41.95 
 
 
380 aa  277  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  42.61 
 
 
386 aa  275  7e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  42.61 
 
 
386 aa  275  7e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  43.77 
 
 
378 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  41.86 
 
 
397 aa  273  5.000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  42.61 
 
 
378 aa  272  7e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26921  citrate synthase  43.31 
 
 
396 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  42.9 
 
 
389 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  42.07 
 
 
370 aa  270  2e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.35 
 
 
373 aa  269  7e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  41.74 
 
 
375 aa  267  2e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  41 
 
 
386 aa  267  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2105  citrate (Si)-synthase  40.9 
 
 
397 aa  267  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414267  normal  0.0115455 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  41.21 
 
 
375 aa  265  7e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  41 
 
 
371 aa  265  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  41 
 
 
371 aa  265  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  41.74 
 
 
378 aa  265  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.66 
 
 
382 aa  264  2e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  40.72 
 
 
371 aa  264  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  40.72 
 
 
371 aa  263  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  40.72 
 
 
371 aa  263  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  40.06 
 
 
375 aa  263  2e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  40.72 
 
 
371 aa  264  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  40.72 
 
 
382 aa  264  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  40.72 
 
 
382 aa  263  3e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  40.72 
 
 
382 aa  263  3e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.81 
 
 
379 aa  263  3e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  40.72 
 
 
382 aa  263  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0279  citrate synthase  40.7 
 
 
396 aa  263  4e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1035  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.31 
 
 
375 aa  262  6.999999999999999e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.13 
 
 
382 aa  261  1e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.79 
 
 
379 aa  261  1e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0154  citrate synthase  40.87 
 
 
374 aa  260  2e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.649155 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0612  citrate synthase  42.49 
 
 
386 aa  261  2e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.148892  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1580  citrate synthase  41.74 
 
 
383 aa  260  3e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  41.21 
 
 
381 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  41.21 
 
 
381 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  41.21 
 
 
381 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.48 
 
 
380 aa  257  2e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0398  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.03 
 
 
377 aa  257  3e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0419831  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  39.77 
 
 
374 aa  257  3e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.6 
 
 
387 aa  256  5e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  41.21 
 
 
381 aa  255  8e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.47 
 
 
380 aa  251  1e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2031  citrate (Si)-synthase  38.73 
 
 
473 aa  250  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602388  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1063  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.52 
 
 
393 aa  249  4e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1765  methylcitrate synthase  39.23 
 
 
375 aa  246  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.924616  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0622  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.48 
 
 
367 aa  246  6e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0115525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0647  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.48 
 
 
367 aa  246  6e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.029125  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4723  methylcitrate synthase  38.26 
 
 
375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2234  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.61 
 
 
409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.709963 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53950  methylcitrate synthase  38.26 
 
 
375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.282102  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0924  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.18 
 
 
379 aa  243  3e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2672  citrate synthase  39.49 
 
 
386 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.530506  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2367  citrate synthase 3  39.2 
 
 
373 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3065  citrate synthase  39.49 
 
 
386 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2188  citrate synthase 3  39.2 
 
 
372 aa  242  6e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.685723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2125  citrate synthase 3  39.2 
 
 
372 aa  242  6e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.306637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2348  citrate synthase 3  39.2 
 
 
372 aa  242  6e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2604  2-methylcitrate synthase  38.68 
 
 
374 aa  242  6e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.121252  hitchhiker  0.000290432 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2156  citrate synthase 3  39.2 
 
 
373 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2450  citrate synthase 3  39.2 
 
 
373 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0697754  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3010  citrate synthase 3  39.2 
 
 
373 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2335  methylcitrate synthase  38.35 
 
 
375 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218689  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3435  methylcitrate synthase  38.35 
 
 
375 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01089  normal  0.171025 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  36.84 
 
 
395 aa  241  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2111  citrate synthase 3  38.92 
 
 
372 aa  241  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1936  methylcitrate synthase  37.98 
 
 
375 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686847  hitchhiker  0.000000858753 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1724  citrate synthase 3  39.2 
 
 
372 aa  241  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.992858  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1776  methylcitrate synthase  37.69 
 
 
375 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549839  hitchhiker  0.000461346 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2315  citrate synthase 3  38.92 
 
 
373 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0281  citrate synthase  38.98 
 
 
378 aa  239  4e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.160338  normal  0.143922 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1496  2-methylcitrate synthase  39.94 
 
 
372 aa  238  9e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2288  2-methylcitrate synthase  37.97 
 
 
375 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.037213  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1487  2-methylcitrate synthase  39.94 
 
 
372 aa  237  2e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1071  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.51 
 
 
373 aa  237  2e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.66322  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0563  citrate synthase  38.46 
 
 
412 aa  236  3e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0072  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.46 
 
 
372 aa  235  7e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0713  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.19 
 
 
404 aa  235  7e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.756288  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0350  citrate synthase  37.11 
 
 
391 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1533  citrate (Si)-synthase  35.88 
 
 
396 aa  235  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2376  citrate synthase 3  39.2 
 
 
372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.151245  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1692  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.01 
 
 
409 aa  233  3e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.141022  normal  0.100865 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2821  putative 2-methylcitrate synthase  37.46 
 
 
374 aa  233  5e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.702751  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1198  methylcitrate synthase  37.76 
 
 
376 aa  232  9e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>