More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11154 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11154  citrate synthase  100 
 
 
393 aa  811    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0574  citrate synthase  60.93 
 
 
378 aa  445  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1523  citrate synthase  60.27 
 
 
379 aa  443  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000149405 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1523  citrate synthase  60.37 
 
 
379 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.836356  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14160  citrate synthase  60.27 
 
 
381 aa  436  1e-121  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0100  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  57.18 
 
 
377 aa  429  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1658  citrate synthase  54.57 
 
 
373 aa  411  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.617148  normal  0.567466 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12020  citrate synthase  56.58 
 
 
389 aa  409  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.555378  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0109  citrate synthase  59.35 
 
 
372 aa  397  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.373645  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2480  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  54.57 
 
 
380 aa  394  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388889  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1815  Citrate synthase  76.76 
 
 
419 aa  378  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  44.35 
 
 
372 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.8 
 
 
377 aa  311  2e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  44.08 
 
 
372 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.7 
 
 
379 aa  296  6e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.5 
 
 
378 aa  291  1e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  41.14 
 
 
386 aa  291  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  40.93 
 
 
371 aa  288  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  40.93 
 
 
371 aa  287  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  40.66 
 
 
371 aa  286  4e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  40.66 
 
 
371 aa  286  4e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  40.66 
 
 
371 aa  286  5e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  40.66 
 
 
371 aa  286  5e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  40.66 
 
 
382 aa  286  5e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  40.66 
 
 
382 aa  286  5e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  40.88 
 
 
382 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  40.88 
 
 
382 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.29 
 
 
382 aa  280  4e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  40 
 
 
373 aa  277  2e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0072  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.98 
 
 
372 aa  276  4e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.64 
 
 
380 aa  276  4e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.48 
 
 
430 aa  276  5e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.05 
 
 
390 aa  275  1.0000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.91 
 
 
382 aa  274  2.0000000000000002e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  39.01 
 
 
373 aa  273  3e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  39.01 
 
 
373 aa  273  3e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1665  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.02 
 
 
374 aa  270  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.78 
 
 
385 aa  271  2e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0344  methylcitrate synthase  41.99 
 
 
375 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  39.89 
 
 
374 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  39.89 
 
 
380 aa  268  1e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3295  methylcitrate synthase  42.74 
 
 
378 aa  268  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3630  methylcitrate synthase  42.09 
 
 
375 aa  267  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3826  methylcitrate synthase  42.09 
 
 
375 aa  267  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0798  citrate synthase 3  40.67 
 
 
370 aa  267  2e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.036744  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0314  methylcitrate synthase  42.09 
 
 
375 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.27 
 
 
382 aa  266  5e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2321  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.78 
 
 
384 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.61 
 
 
379 aa  265  8e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.36 
 
 
397 aa  265  8e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2335  methylcitrate synthase  42.18 
 
 
375 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218689  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.44 
 
 
373 aa  265  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1936  methylcitrate synthase  41.9 
 
 
375 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686847  hitchhiker  0.000000858753 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3435  methylcitrate synthase  42.18 
 
 
375 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01089  normal  0.171025 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  37.5 
 
 
370 aa  265  1e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2498  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.61 
 
 
374 aa  264  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0246552 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2112  2-methylcitrate synthase  40.83 
 
 
374 aa  264  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1496  2-methylcitrate synthase  41.6 
 
 
372 aa  263  3e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1776  methylcitrate synthase  41.62 
 
 
375 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549839  hitchhiker  0.000461346 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1071  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.38 
 
 
373 aa  263  4e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.66322  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1487  2-methylcitrate synthase  41.6 
 
 
372 aa  263  4e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1765  methylcitrate synthase  41.44 
 
 
375 aa  263  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.924616  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.77 
 
 
380 aa  263  4e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1420  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.06 
 
 
374 aa  262  6e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2208  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.65 
 
 
374 aa  262  8.999999999999999e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.539974  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1310  methylcitrate synthase  41.99 
 
 
375 aa  262  8.999999999999999e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03371  methylcitrate synthase  42.27 
 
 
373 aa  261  1e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4141  methylcitrate synthase  40.71 
 
 
379 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2821  putative 2-methylcitrate synthase  40.83 
 
 
374 aa  260  3e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.702751  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1858  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.78 
 
 
374 aa  260  3e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3645  methylcitrate synthase  40.96 
 
 
375 aa  260  3e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4048  methylcitrate synthase  40.96 
 
 
375 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4022  methylcitrate synthase  40.96 
 
 
375 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3946  methylcitrate synthase  40.96 
 
 
375 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1176  2-methylcitrate synthase  40.61 
 
 
372 aa  258  1e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.831059  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0820  2-methylcitrate synthase  40.61 
 
 
372 aa  258  1e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1821  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.38 
 
 
374 aa  258  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1111  methylcitrate synthase  42.78 
 
 
379 aa  257  2e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53950  methylcitrate synthase  40.93 
 
 
375 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.282102  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4723  methylcitrate synthase  40.93 
 
 
375 aa  256  5e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2604  2-methylcitrate synthase  40.78 
 
 
374 aa  256  6e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.121252  hitchhiker  0.000290432 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1508  methylcitrate synthase  39.62 
 
 
386 aa  256  6e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  40.17 
 
 
373 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0142  methylcitrate synthase  39.18 
 
 
390 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482229  normal  0.590891 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2188  citrate synthase 3  37.85 
 
 
372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.685723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2125  citrate synthase 3  37.85 
 
 
372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.306637  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  37.85 
 
 
378 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  38.54 
 
 
387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2348  citrate synthase 3  37.85 
 
 
372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2367  citrate synthase 3  37.85 
 
 
373 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2111  citrate synthase 3  37.85 
 
 
372 aa  254  3e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2086  methylcitrate synthase  40.33 
 
 
375 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.440425  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4841  methylcitrate synthase  38.9 
 
 
390 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.994856  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5388  methylcitrate synthase  38.9 
 
 
390 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  39.18 
 
 
375 aa  253  6e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3029  methylcitrate synthase  38.32 
 
 
385 aa  253  6e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2450  citrate synthase 3  37.57 
 
 
373 aa  252  7e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0697754  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5345  methylcitrate synthase  38.9 
 
 
390 aa  252  7e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.417928  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5516  methylcitrate synthase  38.9 
 
 
390 aa  252  7e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272926  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3010  citrate synthase 3  37.57 
 
 
373 aa  252  7e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.569361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>