More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2234 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0713  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  75.81 
 
 		 404 aa  654    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.756288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2234  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  100 
 
 		 409 aa  840    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.709963 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0563  citrate synthase  79.95 
 
 		 412 aa  707    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1692  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  83.86 
 
 		 409 aa  733    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.141022  normal  0.100865 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  60 
 
 		 397 aa  502  1e-141  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.8 
 
 		 385 aa  332  9e-90  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  44.56 
 
 		 370 aa  322  9.999999999999999e-87  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.66 
 
 		 379 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0398  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.59 
 
 		 377 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0419831  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.67 
 
 		 377 aa  308  2.0000000000000002e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.91 
 
 		 382 aa  306  5.0000000000000004e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  43.59 
 
 		 372 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.89 
 
 		 378 aa  306  5.0000000000000004e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.13 
 
 		 379 aa  305  7e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.26 
 
 		 382 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  43.59 
 
 		 378 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.97 
 
 		 380 aa  303  3.0000000000000004e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.86 
 
 		 382 aa  301  2e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  43.08 
 
 		 372 aa  300  4e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  41.19 
 
 		 397 aa  298  9e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  40.41 
 
 		 381 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0647  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.16 
 
 		 367 aa  298  2e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.029125  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  40.41 
 
 		 378 aa  298  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0622  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.16 
 
 		 367 aa  298  2e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0115525  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  40.16 
 
 		 381 aa  296  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  40.16 
 
 		 381 aa  296  5e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  40.67 
 
 		 381 aa  296  6e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.69 
 
 		 430 aa  295  1e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0279  citrate synthase  40.16 
 
 		 396 aa  294  2e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1580  citrate synthase  40.31 
 
 		 383 aa  294  2e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.55 
 
 		 390 aa  293  4e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.79 
 
 		 378 aa  290  2e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  41.79 
 
 		 386 aa  288  9e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  39.64 
 
 		 375 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  39.64 
 
 		 375 aa  287  2e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26921  citrate synthase  40.41 
 
 		 396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0281  citrate synthase  41.03 
 
 		 378 aa  283  6.000000000000001e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.160338  normal  0.143922 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  40.51 
 
 		 382 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  40.51 
 
 		 382 aa  282  9e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  40.51 
 
 		 371 aa  282  9e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2224  citrate synthase I  39.86 
 
 		 425 aa  281  1e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  40.26 
 
 		 382 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.07 
 
 		 387 aa  281  2e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  40.26 
 
 		 371 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  40.26 
 
 		 371 aa  281  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  40.26 
 
 		 371 aa  281  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  40.26 
 
 		 371 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0995  citrate synthase I  38.64 
 
 		 434 aa  281  2e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.655069 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  40.26 
 
 		 382 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  42.46 
 
 		 380 aa  280  3e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0350  citrate synthase  39.33 
 
 		 391 aa  279  6e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1187  citrate synthase  40.1 
 
 		 431 aa  278  1e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  40 
 
 		 371 aa  278  1e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.05 
 
 		 380 aa  277  2e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0100  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.33 
 
 		 377 aa  277  3e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0612  citrate synthase  40.62 
 
 		 386 aa  277  3e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.148892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1301  Citrate (Si)-synthase  40.31 
 
 		 431 aa  276  4e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.115082  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1132  citrate synthase  40 
 
 		 431 aa  276  4e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  38.14 
 
 		 386 aa  276  5e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  38.14 
 
 		 386 aa  276  5e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  39.8 
 
 		 395 aa  275  8e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1275  citrate synthase  40.56 
 
 		 427 aa  275  9e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.152797  normal  0.229785 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  38.86 
 
 		 389 aa  274  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1422  type II citrate synthase  39.22 
 
 		 428 aa  273  3e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000689188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0586  citrate synthase  39.95 
 
 		 430 aa  273  4.0000000000000004e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1570  citrate (Si)-synthase  39.95 
 
 		 430 aa  273  4.0000000000000004e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00021591  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2335  methylcitrate synthase  38.92 
 
 		 375 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218689  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3435  methylcitrate synthase  38.92 
 
 		 375 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01089  normal  0.171025 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  40.05 
 
 		 387 aa  273  6e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2023  citrate synthase I  38.48 
 
 		 429 aa  272  7e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0344  methylcitrate synthase  39.44 
 
 		 375 aa  271  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1936  methylcitrate synthase  38.4 
 
 		 375 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686847  hitchhiker  0.000000858753 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1676  citrate synthase  39.64 
 
 		 445 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308594  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33600  citrate synthase  40.46 
 
 		 437 aa  270  2.9999999999999997e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3630  methylcitrate synthase  39.19 
 
 		 375 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.79 
 
 		 373 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3295  methylcitrate synthase  39.53 
 
 		 378 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0072  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.95 
 
 		 372 aa  270  4e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1776  methylcitrate synthase  38.66 
 
 		 375 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549839  hitchhiker  0.000461346 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0314  methylcitrate synthase  39.19 
 
 		 375 aa  270  4e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1964  citrate synthase I  40.2 
 
 		 427 aa  270  4e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148224  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3826  methylcitrate synthase  39.19 
 
 		 375 aa  270  4e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2672  citrate synthase  39.64 
 
 		 386 aa  269  5e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.530506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3065  citrate synthase  39.64 
 
 		 386 aa  269  5e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53950  methylcitrate synthase  39.03 
 
 		 375 aa  269  5e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.282102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  39.12 
 
 		 373 aa  269  7e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4723  methylcitrate synthase  38.78 
 
 		 375 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2422  type II citrate synthase  41.03 
 
 		 436 aa  268  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5222  citrate synthase I  36.8 
 
 		 429 aa  268  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.827577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1088  citrate synthase I  40.36 
 
 		 443 aa  268  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.864155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3716  citrate synthase I  40 
 
 		 430 aa  268  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364105  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5022  type II citrate synthase  40.81 
 
 		 434 aa  267  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834357 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4838  type II citrate synthase  40.36 
 
 		 434 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.782916  normal  0.17167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4456  type II citrate synthase  40.36 
 
 		 434 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1794  citrate synthase I  38.54 
 
 		 426 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000880013  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3181  citrate synthase I  39.29 
 
 		 438 aa  267  2.9999999999999995e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.270593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4543  type II citrate synthase  40.36 
 
 		 434 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701189 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4048  methylcitrate synthase  39.28 
 
 		 375 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1841  citrate synthase  38.73 
 
 		 430 aa  266  5e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.040491 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3584  citrate synthase I  38.02 
 
 		 425 aa  266  5e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887444 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>