More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4477 on replicon NC_008243
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008243  Meso_4477  citrate synthase  100 
 
 		 250 aa  511  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5380  citrate synthase  47.37 
 
 		 261 aa  218  8.999999999999998e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4823  citrate synthase  48.37 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2009  citrate synthase  40.16 
 
 		 261 aa  202  4e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.884105 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0799  citrate synthase  46.72 
 
 		 261 aa  201  7e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6318  citrate synthase  40.17 
 
 		 249 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4697  citrate synthase  45.23 
 
 		 259 aa  198  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.405969  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0986  citrate synthase  44.96 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.879919 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1313  citrate synthase  39.34 
 
 		 262 aa  185  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4268  citrate synthase  38.71 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.245417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4946  citrate synthase  40.5 
 
 		 252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.094047  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5653  citrate synthase  35.63 
 
 		 268 aa  156  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0675936  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2022  citrate synthase  32.16 
 
 		 267 aa  152  5e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.275146  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4677  citrate synthase  33.88 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3867  citrate synthase  32.65 
 
 		 259 aa  151  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1379  citrate synthase  34.55 
 
 		 257 aa  145  5e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1039  citrate synthase  31.25 
 
 		 255 aa  135  8e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6294  citrate synthase  32.27 
 
 		 302 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1194  citrate synthase  35.55 
 
 		 267 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0045  citrate synthase  32.06 
 
 		 286 aa  121  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4826  citrate synthase  33.62 
 
 		 271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.538489  normal  0.968705 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4144  citrate synthase  33.33 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00479182  normal  0.482128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2128  citrate synthase  31.14 
 
 		 286 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2728  citrate synthase  29.57 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4959  citrate synthase  32.34 
 
 		 282 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4013  citrate synthase  30.67 
 
 		 274 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6289  citrate synthase  31.47 
 
 		 270 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0980026  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1832  Citrate synthase  34.11 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0399593  normal  0.514801 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4041  citrate synthase  32.19 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4153  citrate synthase  32.19 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.595412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3119  citrate synthase  27.83 
 
 		 254 aa  103  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8311  citrate synthase  32.68 
 
 		 277 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173148  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4159  citrate synthase  31.06 
 
 		 275 aa  96.3  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0447  Citrate synthase-like protein  27.95 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000621018  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  28.35 
 
 		 380 aa  78.6  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1821  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  26.26 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  26.87 
 
 		 378 aa  69.3  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2105  citrate (Si)-synthase  26.26 
 
 		 397 aa  68.9  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414267  normal  0.0115455 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1665  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  25.38 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  24.39 
 
 		 382 aa  68.2  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2321  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  24.87 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2112  2-methylcitrate synthase  24.37 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2031  citrate (Si)-synthase  26.07 
 
 		 473 aa  67  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602388  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  26.26 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2498  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  23.98 
 
 		 374 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0246552 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  28.28 
 
 		 378 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  28.86 
 
 		 378 aa  65.9  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  28.14 
 
 		 389 aa  65.5  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3295  methylcitrate synthase  25.25 
 
 		 378 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1665  methylcitrate synthase  25.53 
 
 		 377 aa  65.1  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  25.38 
 
 		 378 aa  65.5  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2208  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.98 
 
 		 374 aa  65.1  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.539974  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1090  ATP-citrate lyase/succinyl-CoA ligase  25.2 
 
 		 610 aa  64.7  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02396  methylcitrate synthase  23.4 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1420  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  24.37 
 
 		 374 aa  64.7  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  25.87 
 
 		 378 aa  64.7  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  28.08 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  27.36 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1858  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  24.87 
 
 		 374 aa  64.3  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  25.85 
 
 		 382 aa  63.5  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  25.35 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1351  ATP-citrate lyase/succinyl-CoA ligase  25.2 
 
 		 610 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1063  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.43 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  30.77 
 
 		 395 aa  63.5  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  27 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  28.64 
 
 		 373 aa  63.2  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2821  putative 2-methylcitrate synthase  23.47 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.702751  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  28.64 
 
 		 373 aa  63.2  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  27.85 
 
 		 386 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  27.85 
 
 		 386 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  23.9 
 
 		 382 aa  62.8  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  27 
 
 		 381 aa  62.4  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2401  2-methylcitrate synthase  25.73 
 
 		 371 aa  62.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.612256  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2335  methylcitrate synthase  27.27 
 
 		 375 aa  62  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218689  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0072  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  26.96 
 
 		 372 aa  62  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  29.12 
 
 		 397 aa  62  0.000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3435  methylcitrate synthase  27.27 
 
 		 375 aa  62  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01089  normal  0.171025 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1936  methylcitrate synthase  27.27 
 
 		 375 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686847  hitchhiker  0.000000858753 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1035  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  25.81 
 
 		 375 aa  62  0.000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1868  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  24.35 
 
 		 376 aa  62  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.650369  normal  0.135048 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0344  methylcitrate synthase  24.87 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4723  methylcitrate synthase  26.26 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1071  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.35 
 
 		 373 aa  61.2  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.66322  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  26.5 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53950  methylcitrate synthase  26.26 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.282102  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2288  2-methylcitrate synthase  25.74 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.037213  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1776  methylcitrate synthase  27.18 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549839  hitchhiker  0.000461346 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00800  conserved hypothetical protein  24.62 
 
 		 1149 aa  60.8  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  26 
 
 		 381 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  26 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3630  methylcitrate synthase  24.87 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0314  methylcitrate synthase  24.87 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3826  methylcitrate synthase  24.87 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1111  methylcitrate synthase  26.15 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0848  Citrate (Si)-synthase  28.65 
 
 		 368 aa  60.1  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5753  Citrate synthase  28.76 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.149777  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0845  citrate synthase  30.34 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.627781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26921  citrate synthase  30.27 
 
 		 396 aa  60.1  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0115  citrate synthase 2  27.78 
 
 		 368 aa  60.5  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2086  methylcitrate synthase  26.73 
 
 		 375 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.440425  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>