85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4826 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4826  citrate synthase  100 
 
 		 271 aa  557  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.538489  normal  0.968705 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6289  citrate synthase  53.7 
 
 		 270 aa  290  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0980026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1039  citrate synthase  33.2 
 
 		 255 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1379  citrate synthase  31.9 
 
 		 257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6318  citrate synthase  32.88 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4477  citrate synthase  33.62 
 
 		 250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3119  citrate synthase  30.17 
 
 		 254 aa  107  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2728  citrate synthase  32.92 
 
 		 255 aa  104  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3867  citrate synthase  30.9 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4159  citrate synthase  28.4 
 
 		 275 aa  95.5  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4959  citrate synthase  28.86 
 
 		 282 aa  94.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4013  citrate synthase  27.98 
 
 		 274 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6294  citrate synthase  29.91 
 
 		 302 aa  94  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2022  citrate synthase  29.22 
 
 		 267 aa  90.5  3e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.275146  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4153  citrate synthase  28.86 
 
 		 284 aa  90.1  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.595412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4041  citrate synthase  28.86 
 
 		 284 aa  90.1  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4697  citrate synthase  31.05 
 
 		 259 aa  90.1  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.405969  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1832  Citrate synthase  30.2 
 
 		 289 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0399593  normal  0.514801 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2009  citrate synthase  25.42 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.884105 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0986  citrate synthase  30.47 
 
 		 259 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.879919 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8311  citrate synthase  26.97 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173148  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1194  citrate synthase  30.58 
 
 		 267 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4144  citrate synthase  27.24 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00479182  normal  0.482128 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1313  citrate synthase  27.46 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2128  citrate synthase  26.29 
 
 		 286 aa  82.8  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5653  citrate synthase  28.22 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0675936  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4823  citrate synthase  30.13 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4946  citrate synthase  31.72 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.094047  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4268  citrate synthase  27.05 
 
 		 265 aa  75.5  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.245417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0799  citrate synthase  28.81 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4677  citrate synthase  28.12 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5380  citrate synthase  28.03 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0045  citrate synthase  28.38 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0447  Citrate synthase-like protein  28.25 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000621018  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4948  citrate synthase 2  32.27 
 
 		 364 aa  65.1  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.257238  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2027  citrate synthase 2  26.7 
 
 		 362 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  27.39 
 
 		 380 aa  53.9  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  27.27 
 
 		 373 aa  52.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  27.27 
 
 		 373 aa  52.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6150  Citrate (Si)-synthase  27.27 
 
 		 391 aa  52.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.153659 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  25.32 
 
 		 373 aa  52.4  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  23.21 
 
 		 371 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  22.78 
 
 		 371 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  24.23 
 
 		 370 aa  49.3  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  26.92 
 
 		 373 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  22.78 
 
 		 371 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  22.78 
 
 		 371 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  22.78 
 
 		 371 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  22.78 
 
 		 371 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  22.78 
 
 		 382 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  22.78 
 
 		 382 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  22.78 
 
 		 382 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  22.78 
 
 		 382 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0511  citrate synthase 2  26.73 
 
 		 368 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.043222  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1351  ATP-citrate lyase/succinyl-CoA ligase  23.58 
 
 		 610 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0154  citrate synthase  43.75 
 
 		 374 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.649155 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4146  citrate (Si)-synthase  25 
 
 		 375 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0733  citrate synthase 2  31.82 
 
 		 368 aa  47.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1830  citrate synthase 2  26.73 
 
 		 362 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.011311 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7568  citrate synthase 2  25.93 
 
 		 362 aa  47  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.708852 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0423  citrate synthase 2  26.27 
 
 		 368 aa  46.6  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  26.48 
 
 		 377 aa  46.6  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  25.84 
 
 		 387 aa  46.2  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  24.28 
 
 		 373 aa  45.8  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1267  hypothetical protein  23.18 
 
 		 266 aa  45.4  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0247  citrate synthase 2  27.63 
 
 		 368 aa  45.4  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.32184  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  24.88 
 
 		 374 aa  45.4  0.0009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1113  hypothetical protein  25.22 
 
 		 268 aa  45.4  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0798  citrate synthase 3  29.14 
 
 		 370 aa  45.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.036744  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1306  ATP citrate lyase subunit 2  21.81 
 
 		 610 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.205597  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0520  citrate (Si)-synthase  32.71 
 
 		 368 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.341938  normal  0.0162418 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3561  Citrate (Si)-synthase  26.9 
 
 		 387 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141515  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0715  citrate synthase  23.98 
 
 		 355 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1016  Citrate (Si)-synthase  26.29 
 
 		 366 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.525155  hitchhiker  0.00235766 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0834  Citrate (Si)-synthase  27.32 
 
 		 377 aa  43.9  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1005  Citrate (Si)-synthase  30.63 
 
 		 368 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  23.08 
 
 		 386 aa  43.9  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1090  ATP-citrate lyase/succinyl-CoA ligase  23.53 
 
 		 610 aa  43.5  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  24.11 
 
 		 372 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2103  citrate synthase 2  27.88 
 
 		 364 aa  43.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2420  Citrate synthase  24.09 
 
 		 481 aa  43.1  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2962  2-methylcitrate synthase  26.43 
 
 		 373 aa  42.4  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  25.89 
 
 		 372 aa  42.4  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0571  ATP-dependent citrate lyase alpha subunit  24.06 
 
 		 604 aa  42.4  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5814  Citrate (Si)-synthase  26.89 
 
 		 361 aa  42  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00482398 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>