More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1090 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1351  ATP-citrate lyase/succinyl-CoA ligase  89.67 
 
 
610 aa  1145    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1393  ATP-citrate lyase/succinyl-CoA ligase  83.28 
 
 
610 aa  1063    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.025075  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1062  citrate lyase, subunit 2  83.93 
 
 
610 aa  1075    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1231  ATP-citrate lyase/succinyl-CoA ligase  81.97 
 
 
610 aa  1049    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0797  citrate lyase, subunit 2  81.97 
 
 
610 aa  1049    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1090  ATP-citrate lyase/succinyl-CoA ligase  100 
 
 
610 aa  1242    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1306  ATP citrate lyase subunit 2  83.93 
 
 
610 aa  1074    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.205597  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1055  ATP-citrate lyase/succinyl-CoA ligase  37.95 
 
 
616 aa  400  9.999999999999999e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.140026  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54477  atp-citrate synthase  37.38 
 
 
1082 aa  366  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02436  ATP citrate lyase, subunit 1, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10650)  35.97 
 
 
655 aa  361  2e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00800  conserved hypothetical protein  36.38 
 
 
1149 aa  359  9.999999999999999e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0571  ATP-dependent citrate lyase alpha subunit  36.41 
 
 
604 aa  357  3.9999999999999996e-97  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1376  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  35.74 
 
 
299 aa  164  5.0000000000000005e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3723  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  34.23 
 
 
329 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.793133  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3222  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  34.91 
 
 
290 aa  157  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1100  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  34.8 
 
 
300 aa  157  6e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0979666  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1041  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  34.59 
 
 
290 aa  157  7e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.201704 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2487  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  33.86 
 
 
300 aa  156  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000153221  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1993  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  34.17 
 
 
300 aa  156  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0192  CoA-binding domain protein  36.18 
 
 
292 aa  156  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3658  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  32.92 
 
 
300 aa  155  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000316664  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2183  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  35.44 
 
 
339 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1840  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  32.05 
 
 
290 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00135274  normal  0.0561968 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3877  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  33.23 
 
 
300 aa  154  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000526587  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1310  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  33.23 
 
 
300 aa  154  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000061731  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3686  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  33.23 
 
 
300 aa  154  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0387134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3576  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  33.23 
 
 
300 aa  154  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0154825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3594  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  33.23 
 
 
300 aa  154  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.372712  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3882  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  33.23 
 
 
300 aa  154  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000124479  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3973  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  33.23 
 
 
300 aa  154  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00161204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3847  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  33.23 
 
 
300 aa  154  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3933  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  33.23 
 
 
300 aa  154  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000608067  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0814  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  34.86 
 
 
302 aa  154  5e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0497664  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2811  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  33.01 
 
 
290 aa  154  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2180  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  32.69 
 
 
290 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1791  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  33.01 
 
 
290 aa  152  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.66969  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3485  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  33.65 
 
 
290 aa  151  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.622532  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0156  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  33.65 
 
 
290 aa  151  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.852217  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0517  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  31.21 
 
 
294 aa  151  3e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2260  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  33.75 
 
 
291 aa  150  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.237246  hitchhiker  0.0000000231889 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1702  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  31.37 
 
 
293 aa  150  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.358906 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1465  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  33.44 
 
 
308 aa  150  7e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2068  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  34.07 
 
 
296 aa  150  9e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000768235  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1330  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  35.17 
 
 
302 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2796  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  32.17 
 
 
290 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.623771 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1305  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  35.17 
 
 
302 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0212377  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1658  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  31.73 
 
 
290 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0294249  normal  0.471073 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0024  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  33.99 
 
 
300 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0966  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  35.41 
 
 
294 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2626  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  35.41 
 
 
294 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.639809  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1147  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  31.53 
 
 
290 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0078  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  37.18 
 
 
294 aa  147  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.815822  normal  0.735177 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0288  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  35.74 
 
 
290 aa  147  8.000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0155  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  36.08 
 
 
294 aa  146  9e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.941694  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0491  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  36.08 
 
 
294 aa  146  9e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1430  succinyl-CoA synthetase alpha chain  30.99 
 
 
290 aa  146  9e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.204322  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0849  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  30.89 
 
 
290 aa  146  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0543  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  32.48 
 
 
294 aa  146  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2788  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  32.49 
 
 
308 aa  145  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1933  succinyl-CoA synthase, alpha subunit  31.41 
 
 
290 aa  145  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2102  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  31.65 
 
 
290 aa  145  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.174971  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1715  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  34.1 
 
 
296 aa  145  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0421  succinyl-CoA ligase, alpha subunit  35.6 
 
 
294 aa  145  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2266  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  31.41 
 
 
290 aa  144  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1221  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  32.38 
 
 
292 aa  144  4e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0392735  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3971  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  31.69 
 
 
300 aa  144  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.373268  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2222  succinyl-CoA synthase, alpha subunit  31.95 
 
 
290 aa  144  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0851667  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2911  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  33.72 
 
 
290 aa  144  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.861372  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1239  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  31.01 
 
 
290 aa  144  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.961959  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3097  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  31.01 
 
 
290 aa  144  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1638  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  31.41 
 
 
290 aa  144  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0190398  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1713  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  31.41 
 
 
290 aa  144  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1713  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  31.41 
 
 
290 aa  144  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0092181  normal  0.0855349 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0270  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  32.18 
 
 
291 aa  144  6e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2625  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  30.77 
 
 
290 aa  143  7e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000598296  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1839  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  30.77 
 
 
290 aa  143  7e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00249209  normal  0.0388751 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2512  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  30.77 
 
 
290 aa  143  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.498228  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2505  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  30.77 
 
 
290 aa  143  7e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00526313  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2498  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  34.44 
 
 
292 aa  143  8e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4348  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  31.76 
 
 
291 aa  143  9e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.265556  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01358  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  30.89 
 
 
290 aa  143  9e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0192  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  34.94 
 
 
294 aa  143  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01878  Succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  31.43 
 
 
290 aa  143  9e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004109  succinyl-CoA ligase [ADP-forming] alpha chain  30.57 
 
 
290 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1221  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  31.85 
 
 
290 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0987  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  32.59 
 
 
288 aa  142  1.9999999999999998e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000000000000173889  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00688  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  30.38 
 
 
289 aa  141  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2907  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  30.38 
 
 
289 aa  141  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398696  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0821  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  30.38 
 
 
289 aa  141  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0755  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  30.38 
 
 
289 aa  141  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00677  hypothetical protein  30.38 
 
 
289 aa  141  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3682  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  31.08 
 
 
300 aa  141  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0741  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  30.38 
 
 
289 aa  141  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0648  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  30.38 
 
 
289 aa  141  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2340  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  30.77 
 
 
290 aa  141  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.516028  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0394  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  34.41 
 
 
294 aa  141  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  normal  0.205798 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0776  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  30.38 
 
 
289 aa  141  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2927  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  30.38 
 
 
289 aa  141  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2249  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  30.7 
 
 
290 aa  141  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1158  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  31.53 
 
 
290 aa  141  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>