More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3971 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3971  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  100 
 
 
300 aa  598  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.373268  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3682  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  98 
 
 
300 aa  589  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0024  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  88.33 
 
 
300 aa  541  1e-153  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1925  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  91.33 
 
 
300 aa  525  1e-148  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1853  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  91 
 
 
300 aa  524  1e-148  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0932  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  91.33 
 
 
300 aa  525  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238727  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4124  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  88.33 
 
 
300 aa  520  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2942  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  88.67 
 
 
300 aa  513  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3397  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  85.38 
 
 
303 aa  498  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2818  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  84.44 
 
 
302 aa  479  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2229  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  78.26 
 
 
296 aa  461  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1299  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  77.33 
 
 
294 aa  457  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.825438  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2163  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  77 
 
 
294 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.612608  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1181  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  77.59 
 
 
296 aa  456  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115705  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0394  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  76.92 
 
 
294 aa  455  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  normal  0.205798 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0539  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  77 
 
 
294 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0230  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  74.67 
 
 
294 aa  456  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0185  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  76.92 
 
 
294 aa  454  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1125  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  76.33 
 
 
294 aa  454  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0337157  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0921  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  76.33 
 
 
294 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.324584 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1585  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  76 
 
 
294 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0491  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  76 
 
 
294 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0155  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  76 
 
 
294 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.941694  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0279  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  76.59 
 
 
294 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0600383 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1927  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  74.92 
 
 
295 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0416872  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1645  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  74.92 
 
 
295 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.277929  normal  0.44525 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0421  succinyl-CoA ligase, alpha subunit  74.58 
 
 
294 aa  444  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0192  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  75.59 
 
 
294 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0543  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  74.25 
 
 
294 aa  442  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3606  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  71.91 
 
 
294 aa  434  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0496602 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2503  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  75 
 
 
294 aa  419  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.90761 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0966  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  70.47 
 
 
294 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2626  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  70.47 
 
 
294 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.639809  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0078  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  69.8 
 
 
294 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.815822  normal  0.735177 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0827  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  66.78 
 
 
293 aa  395  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.623831 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2882  succinyl-CoA ligase [ADP-forming] subunit alpha  66.11 
 
 
293 aa  396  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1453  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  69 
 
 
291 aa  393  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.33077  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0558  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  70.13 
 
 
294 aa  394  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3512  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  67.69 
 
 
295 aa  382  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1624  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  64.55 
 
 
291 aa  379  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.392007  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1100  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  63.55 
 
 
300 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0979666  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1376  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  62.21 
 
 
299 aa  371  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4692  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  65.96 
 
 
278 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.243539  normal  0.0624727 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3877  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  62.21 
 
 
300 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000526587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3686  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  62.21 
 
 
300 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0387134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3576  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  62.21 
 
 
300 aa  370  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0154825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3594  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  62.21 
 
 
300 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.372712  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3658  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  61.2 
 
 
300 aa  367  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000316664  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1310  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  62.21 
 
 
300 aa  370  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000061731  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3882  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  62.21 
 
 
300 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000124479  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2487  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  62.21 
 
 
300 aa  370  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000153221  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3847  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  62.21 
 
 
300 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3973  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  62.21 
 
 
300 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00161204  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1993  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  62.21 
 
 
300 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3933  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  62.21 
 
 
300 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000608067  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3397  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  63.67 
 
 
293 aa  370  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.891805 
 
 
-
 
NC_002978  WD1209  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  60.87 
 
 
291 aa  365  1e-100  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1888  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  63.27 
 
 
292 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1212  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  65.22 
 
 
292 aa  362  6e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1465  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  60.54 
 
 
308 aa  360  2e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0250  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  60.74 
 
 
290 aa  360  2e-98  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1373  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  60.93 
 
 
293 aa  358  5e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1670  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  61.95 
 
 
290 aa  357  1.9999999999999998e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2548  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  59 
 
 
290 aa  356  2.9999999999999997e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.12229 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2788  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  59.53 
 
 
308 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0956  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  60.4 
 
 
290 aa  355  6.999999999999999e-97  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0714  succinyl-CoA ligase, alpha subunit  58.39 
 
 
291 aa  353  2e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000108729  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01358  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  60.61 
 
 
290 aa  353  2e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004109  succinyl-CoA ligase [ADP-forming] alpha chain  60.27 
 
 
290 aa  352  2.9999999999999997e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0895  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  59.53 
 
 
289 aa  352  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0404555  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0772  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  59.53 
 
 
289 aa  352  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0798  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  59.53 
 
 
289 aa  352  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0283915  normal  0.188512 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0862  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  59.53 
 
 
289 aa  352  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0472557 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2249  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  60.61 
 
 
290 aa  352  4e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0833  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  59.2 
 
 
289 aa  352  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0260305  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1239  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  59.73 
 
 
290 aa  350  2e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.961959  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3097  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  59.73 
 
 
290 aa  350  2e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1430  succinyl-CoA synthetase alpha chain  60.47 
 
 
290 aa  350  2e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.204322  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2512  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  60.54 
 
 
290 aa  349  3e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.498228  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2625  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  60.54 
 
 
290 aa  349  3e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000598296  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1791  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  60.2 
 
 
290 aa  349  3e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.66969  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2505  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  60.54 
 
 
290 aa  349  3e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00526313  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1839  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  60.54 
 
 
290 aa  349  3e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00249209  normal  0.0388751 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1305  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  57.53 
 
 
302 aa  349  4e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0212377  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0810  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  59.4 
 
 
288 aa  348  4e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.674167  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1330  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  57.53 
 
 
302 aa  349  4e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4348  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  58.86 
 
 
291 aa  348  5e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.265556  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2180  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  59.86 
 
 
290 aa  348  5e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1158  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  59.93 
 
 
290 aa  348  8e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0814  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  56.86 
 
 
302 aa  347  9e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0497664  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0156  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  58.19 
 
 
290 aa  346  2e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.852217  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1041  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  58.19 
 
 
290 aa  346  2e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.201704 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3485  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  58.19 
 
 
290 aa  346  2e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.622532  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2811  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  59.52 
 
 
290 aa  346  2e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1229  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  58.53 
 
 
289 aa  347  2e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0849  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  59.6 
 
 
290 aa  347  2e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4358  succinyl-CoA synthetase, subunit alpha  63.55 
 
 
290 aa  346  3e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.122556 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1147  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  58.53 
 
 
290 aa  345  4e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1658  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  59.52 
 
 
290 aa  345  4e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0294249  normal  0.471073 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0598  succinyl-CoA synthetase alpha chain  58.92 
 
 
294 aa  345  4e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>