More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1055 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001307  ANIA_02436  ATP citrate lyase, subunit 1, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10650)  54.23 
 
 
655 aa  687    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00800  conserved hypothetical protein  53.04 
 
 
1149 aa  650    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0571  ATP-dependent citrate lyase alpha subunit  65.03 
 
 
604 aa  822    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54477  atp-citrate synthase  54.89 
 
 
1082 aa  676    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1055  ATP-citrate lyase/succinyl-CoA ligase  100 
 
 
616 aa  1251    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.140026  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1090  ATP-citrate lyase/succinyl-CoA ligase  37.95 
 
 
610 aa  400  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1231  ATP-citrate lyase/succinyl-CoA ligase  39.23 
 
 
610 aa  396  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1306  ATP citrate lyase subunit 2  39.06 
 
 
610 aa  395  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.205597  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1393  ATP-citrate lyase/succinyl-CoA ligase  38.93 
 
 
610 aa  395  1e-108  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.025075  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0797  citrate lyase, subunit 2  38.49 
 
 
610 aa  390  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1062  citrate lyase, subunit 2  37.96 
 
 
610 aa  384  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1351  ATP-citrate lyase/succinyl-CoA ligase  37.19 
 
 
610 aa  384  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2911  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  29.35 
 
 
290 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.861372  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1221  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  29.55 
 
 
290 aa  120  9e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00688  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  29.17 
 
 
289 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2907  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  29.17 
 
 
289 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398696  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1147  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  29.03 
 
 
290 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0821  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  29.17 
 
 
289 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0648  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  29.17 
 
 
289 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0741  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  29.17 
 
 
289 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0755  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  29.17 
 
 
289 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0776  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  29.17 
 
 
289 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2927  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  29.17 
 
 
289 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00677  hypothetical protein  29.17 
 
 
289 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1229  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  28.71 
 
 
289 aa  117  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1270  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  28.39 
 
 
290 aa  117  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.531627  hitchhiker  0.00241286 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3097  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  29.03 
 
 
290 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1239  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  29.03 
 
 
290 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.961959  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2878  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  28.39 
 
 
290 aa  116  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3685  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  29.37 
 
 
295 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1387  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  28.39 
 
 
290 aa  116  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.341558  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43940  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  29.37 
 
 
295 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2965  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  28.39 
 
 
290 aa  116  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0895  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  28.06 
 
 
289 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0404555  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0772  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  28.06 
 
 
289 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0862  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  28.06 
 
 
289 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0472557 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0798  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  28.06 
 
 
289 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0283915  normal  0.188512 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0833  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  28.06 
 
 
289 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0260305  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4185  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  28.84 
 
 
294 aa  114  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3508  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  28.84 
 
 
294 aa  114  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.214073  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3756  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  28.84 
 
 
294 aa  114  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1669  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  28.84 
 
 
294 aa  114  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.212959  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2796  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  30.62 
 
 
290 aa  113  8.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.623771 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1221  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  29.13 
 
 
292 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0392735  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2203  succinyl-CoA synthase, alpha subunit  28.71 
 
 
293 aa  110  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0467601  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1618  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  28.38 
 
 
294 aa  110  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.161145  normal  0.222045 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2499  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  28.38 
 
 
295 aa  110  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.285546  normal  0.123009 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2013  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  28.38 
 
 
293 aa  109  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143561  normal  0.801568 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1430  succinyl-CoA synthetase alpha chain  27.6 
 
 
290 aa  109  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.204322  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2222  succinyl-CoA synthase, alpha subunit  28.89 
 
 
290 aa  108  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0851667  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0987  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  30.59 
 
 
288 aa  107  4e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000000000000173889  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1658  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  27.27 
 
 
290 aa  107  7e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0294249  normal  0.471073 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1373  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  28.72 
 
 
293 aa  106  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2180  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  27.18 
 
 
290 aa  106  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1702  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  32.93 
 
 
293 aa  106  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.358906 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2102  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  29.84 
 
 
290 aa  106  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.174971  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1638  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  28.34 
 
 
290 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0190398  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1713  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  28.34 
 
 
290 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1713  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  28.34 
 
 
290 aa  105  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0092181  normal  0.0855349 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2811  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  28.03 
 
 
290 aa  105  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0192  CoA-binding domain protein  31.64 
 
 
292 aa  104  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3291  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  29.75 
 
 
293 aa  104  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.055129  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29730  Succinyl-CoA ligase, alpha subunit  27.39 
 
 
295 aa  104  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2266  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  28.34 
 
 
290 aa  104  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1791  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  29.6 
 
 
290 aa  103  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.66969  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1933  succinyl-CoA synthase, alpha subunit  28.03 
 
 
290 aa  103  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01878  Succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  27.27 
 
 
290 aa  102  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1802  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  28.05 
 
 
290 aa  103  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.155061  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2249  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  28.79 
 
 
290 aa  102  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0444  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  29.07 
 
 
293 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.822048 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2505  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  28.03 
 
 
290 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00526313  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1840  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  27.39 
 
 
290 aa  102  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00135274  normal  0.0561968 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2625  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  28.03 
 
 
290 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000598296  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2512  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  28.03 
 
 
290 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.498228  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2183  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  28.75 
 
 
339 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1670  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  28.79 
 
 
290 aa  102  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1839  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  28.03 
 
 
290 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00249209  normal  0.0388751 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2677  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  28.94 
 
 
293 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2569  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  28.94 
 
 
293 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5975  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  28.94 
 
 
293 aa  101  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0290439 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0475  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  28.12 
 
 
293 aa  102  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2334  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit / succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  27.38 
 
 
700 aa  101  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.530303  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4215  CoA-binding domain protein  32.69 
 
 
307 aa  102  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.279293 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2037  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  28.94 
 
 
293 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2695  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  28.94 
 
 
293 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2648  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  28.94 
 
 
293 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0459  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  28.12 
 
 
293 aa  102  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1741  succinyl-CoA synthase, alpha subunit  33.33 
 
 
300 aa  101  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.147192  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1266  CoA-binding domain protein  29.73 
 
 
329 aa  101  5e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01358  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  26.64 
 
 
290 aa  100  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0647  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  28.62 
 
 
293 aa  100  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360097  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2395  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  29.34 
 
 
290 aa  100  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000306055  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0098  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  30.23 
 
 
294 aa  100  7e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.126064  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0818  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  28.62 
 
 
309 aa  100  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.364811  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0654  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  28.62 
 
 
293 aa  100  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0814  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  28.62 
 
 
309 aa  100  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0276  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  28.62 
 
 
293 aa  100  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3723  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  28.85 
 
 
329 aa  100  9e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.793133  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0977  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  28.62 
 
 
309 aa  100  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0675  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  29.11 
 
 
293 aa  100  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.477108 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>