More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3291 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3291  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  100 
 
 
293 aa  592  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.055129  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0675  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  98.63 
 
 
293 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0444  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  94.88 
 
 
293 aa  554  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.822048 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0647  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  94.2 
 
 
293 aa  551  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360097  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2569  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  93.52 
 
 
293 aa  547  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0814  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  93.52 
 
 
309 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0818  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  93.52 
 
 
309 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.364811  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5975  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  93.52 
 
 
293 aa  547  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0290439 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2677  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  93.52 
 
 
293 aa  547  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2037  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  93.52 
 
 
293 aa  547  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2695  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  93.52 
 
 
293 aa  547  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208552  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0654  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  93.52 
 
 
293 aa  548  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2648  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  93.52 
 
 
293 aa  547  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0276  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  92.83 
 
 
293 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2400  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  92.83 
 
 
309 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0977  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  92.83 
 
 
309 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2676  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  92.83 
 
 
309 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638427  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0013  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  92.83 
 
 
309 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0475  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  89.08 
 
 
293 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0459  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  88.74 
 
 
293 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0531  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  90.44 
 
 
293 aa  536  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0369144  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0470  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  89.76 
 
 
293 aa  535  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0555  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  88.74 
 
 
293 aa  531  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1830  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  82.49 
 
 
297 aa  503  1e-141  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.218486  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3952  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  84.51 
 
 
298 aa  503  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.087179 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3363  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  83.16 
 
 
297 aa  498  1e-140  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4681  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  83.5 
 
 
297 aa  495  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.690207  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0071  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  82.49 
 
 
297 aa  494  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.657725  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1546  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  81.82 
 
 
297 aa  497  1e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.273523  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2700  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  82.49 
 
 
297 aa  489  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0712833 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3944  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  81.48 
 
 
297 aa  489  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1592  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0494  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  82.49 
 
 
297 aa  489  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00647129 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5191  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  82.15 
 
 
297 aa  486  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4683  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  81.48 
 
 
298 aa  485  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0868  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  81.48 
 
 
297 aa  483  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4046  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  80.81 
 
 
297 aa  483  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0920  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  82.15 
 
 
297 aa  483  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3391  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  80.47 
 
 
297 aa  481  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.248138  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2729  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  80.47 
 
 
298 aa  449  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4481  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  72.01 
 
 
299 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1995  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  70.31 
 
 
292 aa  434  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1376  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  64.51 
 
 
299 aa  380  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1100  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  63.82 
 
 
300 aa  371  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0979666  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0156  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  62.63 
 
 
290 aa  364  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.852217  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3485  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  62.63 
 
 
290 aa  364  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.622532  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3882  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  62.46 
 
 
300 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000124479  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3877  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  62.46 
 
 
300 aa  366  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000526587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3686  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  62.46 
 
 
300 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0387134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3576  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  62.46 
 
 
300 aa  366  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0154825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3594  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  62.46 
 
 
300 aa  366  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.372712  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2487  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  62.8 
 
 
300 aa  367  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000153221  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0730  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  61.77 
 
 
291 aa  364  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000463051  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1993  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  62.8 
 
 
300 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3973  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  62.46 
 
 
300 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00161204  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3933  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  62.46 
 
 
300 aa  366  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000608067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3847  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  62.46 
 
 
300 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1310  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  62.46 
 
 
300 aa  366  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000061731  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1041  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  62.98 
 
 
290 aa  363  1e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.201704 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3658  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  62.12 
 
 
300 aa  364  1e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000316664  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2788  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  61.59 
 
 
308 aa  363  2e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1465  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  61.94 
 
 
308 aa  362  3e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3222  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  62.63 
 
 
290 aa  362  6e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1305  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  61.94 
 
 
302 aa  360  1e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0212377  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2260  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  62.63 
 
 
291 aa  360  1e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.237246  hitchhiker  0.0000000231889 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1330  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  61.94 
 
 
302 aa  360  1e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4348  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  60.9 
 
 
291 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.265556  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2068  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  61.59 
 
 
296 aa  355  3.9999999999999996e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000768235  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0814  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  60.55 
 
 
302 aa  354  7.999999999999999e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0497664  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2718  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  63.48 
 
 
290 aa  352  5e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3999  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  61.43 
 
 
297 aa  349  3e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00447347  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2183  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  59.86 
 
 
339 aa  344  8.999999999999999e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0024  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  57.95 
 
 
300 aa  343  2e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1059  succinyl-CoA synthase, alpha subunit  60.75 
 
 
291 aa  342  4e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0924  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  56.31 
 
 
291 aa  342  4e-93  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000794119  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0244  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  60.75 
 
 
298 aa  340  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00287524 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0259  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  60.41 
 
 
298 aa  339  2.9999999999999998e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0619  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  58.02 
 
 
293 aa  338  5.9999999999999996e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000506874  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1453  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  57.14 
 
 
291 aa  336  2.9999999999999997e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.33077  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1624  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  57.48 
 
 
291 aa  334  9e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.392007  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3971  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  56.29 
 
 
300 aa  330  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.373268  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3682  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  55.63 
 
 
300 aa  328  7e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2405  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  56.12 
 
 
300 aa  327  1.0000000000000001e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.861166  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1181  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  56.57 
 
 
296 aa  326  2.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115705  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1715  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  56.49 
 
 
296 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2039  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  54.27 
 
 
291 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0078  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  55.89 
 
 
294 aa  326  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.815822  normal  0.735177 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1299  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  57.24 
 
 
294 aa  326  3e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.825438  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2229  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  56.23 
 
 
296 aa  326  3e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0966  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  55.22 
 
 
294 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2626  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  55.22 
 
 
294 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.639809  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5148  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  56.76 
 
 
293 aa  325  4.0000000000000003e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004109  succinyl-CoA ligase [ADP-forming] alpha chain  55.86 
 
 
290 aa  325  5e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0849  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  55.82 
 
 
290 aa  325  6e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0250  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  53.4 
 
 
290 aa  325  6e-88  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01358  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  55.86 
 
 
290 aa  325  6e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2498  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  55.63 
 
 
292 aa  325  6e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1888  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  54.83 
 
 
292 aa  324  1e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0598  succinyl-CoA synthetase alpha chain  55.05 
 
 
294 aa  322  5e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04878  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  55.29 
 
 
291 aa  322  6e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.917375  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1702  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  53.79 
 
 
293 aa  321  8e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.358906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>