More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2962 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2962  2-methylcitrate synthase  100 
 
 		 373 aa  746    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1936  methylcitrate synthase  30.68 
 
 		 375 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686847  hitchhiker  0.000000858753 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2335  methylcitrate synthase  30.68 
 
 		 375 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218689  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3435  methylcitrate synthase  30.68 
 
 		 375 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01089  normal  0.171025 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1776  methylcitrate synthase  30.96 
 
 		 375 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549839  hitchhiker  0.000461346 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.71 
 
 		 382 aa  158  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.16 
 
 		 377 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1765  methylcitrate synthase  29.32 
 
 		 375 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.924616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  29.23 
 
 		 372 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.65 
 
 		 430 aa  154  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0072  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.02 
 
 		 372 aa  151  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  28.14 
 
 		 372 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.01 
 
 		 378 aa  149  5e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  29.12 
 
 		 373 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  29.12 
 
 		 373 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0142  methylcitrate synthase  29.06 
 
 		 390 aa  146  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482229  normal  0.590891 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.84 
 
 		 397 aa  146  5e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.62 
 
 		 385 aa  146  6e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.11 
 
 		 373 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  27.55 
 
 		 373 aa  145  9e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5388  methylcitrate synthase  28.77 
 
 		 390 aa  145  9e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1508  methylcitrate synthase  30.14 
 
 		 386 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.83 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02719  methylcitrate synthase  29.31 
 
 		 384 aa  145  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.966086  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4841  methylcitrate synthase  28.77 
 
 		 390 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.994856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53950  methylcitrate synthase  28.69 
 
 		 375 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.282102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1198  methylcitrate synthase  27.47 
 
 		 376 aa  145  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0878  methylcitrate synthase  29.06 
 
 		 390 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1869  methylcitrate synthase  29.06 
 
 		 390 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1737  methylcitrate synthase  29.06 
 
 		 390 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2142  methylcitrate synthase  29.06 
 
 		 390 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0866  methylcitrate synthase  30.23 
 
 		 391 aa  145  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0289  methylcitrate synthase  29.06 
 
 		 390 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4723  methylcitrate synthase  28.69 
 
 		 375 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5345  methylcitrate synthase  28.57 
 
 		 390 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.417928  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1165  methylcitrate synthase  29.06 
 
 		 390 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0383  methylcitrate synthase  29.06 
 
 		 390 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679335  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5516  methylcitrate synthase  28.57 
 
 		 390 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23220  methylcitrate synthase  28.65 
 
 		 387 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4756  methylcitrate synthase  28.57 
 
 		 390 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.394349  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1487  2-methylcitrate synthase  28.17 
 
 		 372 aa  144  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1665  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.07 
 
 		 374 aa  144  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0100  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.62 
 
 		 377 aa  144  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0621  methylcitrate synthase  30.99 
 
 		 383 aa  143  5e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1496  2-methylcitrate synthase  28.17 
 
 		 372 aa  143  5e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3029  methylcitrate synthase  28.86 
 
 		 385 aa  143  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  30.95 
 
 		 373 aa  143  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3288  methylcitrate synthase  28.77 
 
 		 390 aa  143  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.281405  normal  0.014196 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0121  methylcitrate synthase  28.86 
 
 		 387 aa  142  8e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2821  putative 2-methylcitrate synthase  27.62 
 
 		 374 aa  142  9e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.702751  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5862  methylcitrate synthase  28.77 
 
 		 398 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0463  methylcitrate synthase  28.92 
 
 		 389 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000165686  hitchhiker  0.000000131062 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3974  methylcitrate synthase  28.57 
 
 		 389 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0651061 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0364  methylcitrate synthase  29.27 
 
 		 389 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2319  methylcitrate synthase  28.77 
 
 		 386 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.16364  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3860  methylcitrate synthase  28.57 
 
 		 389 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0401  methylcitrate synthase  28.92 
 
 		 389 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.600733  hitchhiker  0.00000000076827 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1665  methylcitrate synthase  28.14 
 
 		 377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2188  methylcitrate synthase  28.49 
 
 		 390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2420  2-methylcitrate synthase  28.05 
 
 		 375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0822163  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2288  2-methylcitrate synthase  28.22 
 
 		 375 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.037213  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2086  methylcitrate synthase  28.49 
 
 		 375 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.440425  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2081  methylcitrate synthase  29.1 
 
 		 404 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.847456  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1821  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  26.7 
 
 		 374 aa  140  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  27.87 
 
 		 386 aa  140  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  28.21 
 
 		 374 aa  140  3e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0403  methylcitrate synthase  28.92 
 
 		 389 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0409  methylcitrate synthase  28.92 
 
 		 389 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000027346 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0421  methylcitrate synthase  28.92 
 
 		 389 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0258062 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0357  methylcitrate synthase  29 
 
 		 389 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  27.87 
 
 		 382 aa  139  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1420  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.07 
 
 		 374 aa  139  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0404  methylcitrate synthase  29 
 
 		 389 aa  139  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.7 
 
 		 390 aa  139  7.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  27.6 
 
 		 371 aa  138  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2112  2-methylcitrate synthase  26.92 
 
 		 374 aa  138  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2208  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.28 
 
 		 374 aa  138  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.539974  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2647  methylcitrate synthase  29.82 
 
 		 394 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2900  methylcitrate synthase  27.64 
 
 		 395 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  29.3 
 
 		 380 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2604  2-methylcitrate synthase  28.14 
 
 		 374 aa  139  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.121252  hitchhiker  0.000290432 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2498  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.07 
 
 		 374 aa  138  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0246552 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.22 
 
 		 378 aa  138  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3273  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.73 
 
 		 389 aa  138  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3292  methylcitrate synthase  28.73 
 
 		 389 aa  138  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  27.6 
 
 		 382 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2401  2-methylcitrate synthase  28.14 
 
 		 371 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.612256  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3295  methylcitrate synthase  27.25 
 
 		 378 aa  138  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6860  methylcitrate synthase  27.35 
 
 		 395 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632501  normal  0.17935 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  27.6 
 
 		 382 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  27.6 
 
 		 371 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  27.6 
 
 		 371 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  27.6 
 
 		 371 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.35 
 
 		 379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  29.69 
 
 		 395 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  27.6 
 
 		 371 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3511  methylcitrate synthase  30.73 
 
 		 390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.106101 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2302  methylcitrate synthase  28 
 
 		 389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.459531  normal  0.256502 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  27.87 
 
 		 371 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2321  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  25.66 
 
 		 384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>