More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1832 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1832  Citrate synthase  100 
 
 		 289 aa  567  1e-161  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0399593  normal  0.514801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4159  citrate synthase  63.6 
 
 		 275 aa  313  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4144  citrate synthase  57.76 
 
 		 284 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00479182  normal  0.482128 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4959  citrate synthase  60.08 
 
 		 282 aa  308  6.999999999999999e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4041  citrate synthase  55.56 
 
 		 284 aa  290  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4153  citrate synthase  55.56 
 
 		 284 aa  290  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.595412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3119  citrate synthase  55.3 
 
 		 254 aa  270  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4013  citrate synthase  53.08 
 
 		 274 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2728  citrate synthase  55.64 
 
 		 255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8311  citrate synthase  54.44 
 
 		 277 aa  258  8e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173148  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1039  citrate synthase  34.03 
 
 		 255 aa  143  4e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1379  citrate synthase  31.76 
 
 		 257 aa  137  1e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6294  citrate synthase  33.46 
 
 		 302 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4477  citrate synthase  34.11 
 
 		 250 aa  112  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5653  citrate synthase  37.96 
 
 		 268 aa  105  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0675936  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2128  citrate synthase  29.48 
 
 		 286 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4697  citrate synthase  36.07 
 
 		 259 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.405969  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6318  citrate synthase  32.24 
 
 		 249 aa  97.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1313  citrate synthase  32.38 
 
 		 262 aa  96.7  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2027  citrate synthase 2  36.32 
 
 		 362 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1830  citrate synthase 2  36.77 
 
 		 362 aa  96.3  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.011311 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0799  citrate synthase  30.28 
 
 		 261 aa  96.3  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4823  citrate synthase  33.03 
 
 		 261 aa  95.5  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0447  Citrate synthase-like protein  31 
 
 		 240 aa  94  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000621018  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0986  citrate synthase  32.91 
 
 		 259 aa  93.6  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.879919 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3867  citrate synthase  31.94 
 
 		 259 aa  92.8  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4826  citrate synthase  30.2 
 
 		 271 aa  92.4  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.538489  normal  0.968705 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5380  citrate synthase  31.65 
 
 		 261 aa  91.3  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2009  citrate synthase  33.18 
 
 		 261 aa  91.3  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.884105 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2141  Citrate (Si)-synthase  31.85 
 
 		 389 aa  88.6  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.636674  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02359  type II citrate synthase  28.92 
 
 		 442 aa  87.8  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4677  citrate synthase  32.11 
 
 		 257 aa  85.9  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4948  citrate synthase 2  32.91 
 
 		 364 aa  85.5  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.257238  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  32.72 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.96 
 
 		 385 aa  84.7  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2022  citrate synthase  35.14 
 
 		 267 aa  84.3  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.275146  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0279  citrate synthase  31.9 
 
 		 396 aa  83.6  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4703  citrate synthase I  32.87 
 
 		 463 aa  83.6  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1035  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.47 
 
 		 375 aa  83.6  0.000000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2136  citrate synthase I  32.56 
 
 		 427 aa  83.2  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.873392  normal  0.0485985 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2284  citrate synthase I  33.78 
 
 		 427 aa  83.2  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0343529 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.77 
 
 		 378 aa  82.8  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.49 
 
 		 382 aa  82.4  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6289  citrate synthase  29.58 
 
 		 270 aa  82  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0980026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4456  type II citrate synthase  30.73 
 
 		 434 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4838  type II citrate synthase  30.73 
 
 		 434 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.782916  normal  0.17167 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4543  type II citrate synthase  30.73 
 
 		 434 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701189 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  27.88 
 
 		 373 aa  80.9  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5036  citrate synthase I  28.05 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  30.12 
 
 		 375 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0715  citrate synthase  27.48 
 
 		 355 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.51 
 
 		 382 aa  81.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01870  Citrate synthase  28.74 
 
 		 425 aa  81.3  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  30.77 
 
 		 378 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10915  type II citrate synthase  30.56 
 
 		 431 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.33 
 
 		 378 aa  80.5  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0350  citrate synthase  29.07 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.36 
 
 		 382 aa  80.5  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5022  type II citrate synthase  31.47 
 
 		 434 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834357 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0599  type II citrate synthase  28.63 
 
 		 430 aa  80.5  0.00000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.281651  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2886  type II citrate synthase  28.84 
 
 		 426 aa  80.1  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000035086  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  29.77 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.42 
 
 		 379 aa  80.1  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1379  type II citrate synthase  28.84 
 
 		 426 aa  80.1  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000415607  normal  0.279105 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2973  type II citrate synthase  28.84 
 
 		 426 aa  80.1  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00618343  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0247  citrate synthase 2  31.91 
 
 		 368 aa  79.7  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.32184  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  29.73 
 
 		 375 aa  79.7  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1139  type II citrate synthase  27.46 
 
 		 428 aa  79.7  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2007  citrate synthase I  26.42 
 
 		 427 aa  79.3  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2520  type II citrate synthase  27.76 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0560239  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2672  citrate synthase  28.89 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.530506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1831  type II citrate synthase  27.76 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000179965  normal  0.249033 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  29.41 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3065  citrate synthase  28.89 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0085  citrate synthase  28.51 
 
 		 448 aa  78.6  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.691353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  29.07 
 
 		 373 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2633  type II citrate synthase  27.76 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000579193  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0995  citrate synthase I  29.17 
 
 		 436 aa  78.2  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  29.07 
 
 		 373 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1705  type II citrate synthase  27.38 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.668035 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2513  type II citrate synthase  27.76 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000256312  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  29.41 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1231  type II citrate synthase  27.42 
 
 		 428 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1705  type II citrate synthase  27.38 
 
 		 428 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00232802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.13 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3105  type II citrate synthase  27.42 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.510334  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1729  type II citrate synthase  31.05 
 
 		 434 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4951  citrate synthase  33.48 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1630  type II citrate synthase  27.38 
 
 		 428 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.01465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3209  citrate synthase  33.48 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  30.71 
 
 		 380 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0115  citrate synthase 2  30.8 
 
 		 368 aa  76.6  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0874  type II citrate synthase  26.21 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0015368  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0790  type II citrate synthase  27.42 
 
 		 427 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.148883  normal  0.115118 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1926  type II citrate synthase  27.92 
 
 		 428 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0825  type II citrate synthase  27.42 
 
 		 427 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0764  type II citrate synthase  27.42 
 
 		 427 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0854  type II citrate synthase  27.42 
 
 		 427 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000551297 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1275  citrate synthase  27.52 
 
 		 427 aa  76.3  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.152797  normal  0.229785 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0887  type II citrate synthase  27.42 
 
 		 427 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.304459 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>