More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0085 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_12790  citrate synthase  72.54 
 
 		 451 aa  706    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0027871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0085  citrate synthase  100 
 
 		 448 aa  932    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.691353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28210  citrate synthase  60.36 
 
 		 445 aa  575  1.0000000000000001e-163  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0102554  normal  0.648823 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2571  citrate synthase  51.84 
 
 		 450 aa  476  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000324243  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3027  citrate synthase  51.16 
 
 		 456 aa  456  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000187967  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1122  citrate synthase  50.46 
 
 		 448 aa  445  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0903  citrate synthase  48.84 
 
 		 455 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1989  citrate synthase  48.15 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000399461  normal  0.147998 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3834  citrate synthase  50.59 
 
 		 457 aa  429  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000081885  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2155  Citrate (Si)-synthase  47.16 
 
 		 441 aa  419  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1100  citrate synthase  44.91 
 
 		 450 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2696  Citrate (Si)-synthase  44.57 
 
 		 447 aa  380  1e-104  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.57 
 
 		 380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2105  citrate (Si)-synthase  34.87 
 
 		 397 aa  197  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414267  normal  0.0115455 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1198  methylcitrate synthase  35.77 
 
 		 376 aa  197  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1858  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.34 
 
 		 374 aa  194  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  34.23 
 
 		 386 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.41 
 
 		 385 aa  192  1e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  34.23 
 
 		 386 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.46 
 
 		 387 aa  189  1e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.27 
 
 		 430 aa  189  1e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  35.16 
 
 		 374 aa  188  2e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3065  citrate synthase  34.84 
 
 		 386 aa  187  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2672  citrate synthase  34.84 
 
 		 386 aa  187  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.530506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2420  2-methylcitrate synthase  34.02 
 
 		 375 aa  187  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0822163  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.97 
 
 		 377 aa  186  6e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  33.49 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1420  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.38 
 
 		 374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2401  2-methylcitrate synthase  33.33 
 
 		 371 aa  183  6e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.612256  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3645  methylcitrate synthase  34.46 
 
 		 375 aa  182  7e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3630  methylcitrate synthase  33.85 
 
 		 375 aa  183  7e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3511  methylcitrate synthase  34.13 
 
 		 390 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.106101 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0314  methylcitrate synthase  33.85 
 
 		 375 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3826  methylcitrate synthase  33.85 
 
 		 375 aa  182  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3295  methylcitrate synthase  33.33 
 
 		 378 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3946  methylcitrate synthase  34.2 
 
 		 375 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4141  methylcitrate synthase  34.2 
 
 		 379 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4022  methylcitrate synthase  34.2 
 
 		 375 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4048  methylcitrate synthase  34.2 
 
 		 375 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1665  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.33 
 
 		 374 aa  179  7e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2288  2-methylcitrate synthase  33.73 
 
 		 375 aa  179  9e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.037213  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23220  methylcitrate synthase  33.33 
 
 		 387 aa  179  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  32.69 
 
 		 378 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0344  methylcitrate synthase  33.33 
 
 		 375 aa  178  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  32.99 
 
 		 370 aa  178  2e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1821  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.29 
 
 		 374 aa  177  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1586  methylcitrate synthase  33.33 
 
 		 385 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000154256  normal  0.49975 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.26 
 
 		 378 aa  177  3e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.49 
 
 		 382 aa  177  4e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0924  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.94 
 
 		 379 aa  176  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4723  methylcitrate synthase  31.82 
 
 		 375 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.03 
 
 		 379 aa  176  7e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.39 
 
 		 373 aa  176  9e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2086  methylcitrate synthase  33.49 
 
 		 375 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.440425  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  34.26 
 
 		 381 aa  175  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.38 
 
 		 390 aa  176  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2112  2-methylcitrate synthase  33.94 
 
 		 374 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53950  methylcitrate synthase  31.58 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.282102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  33.84 
 
 		 375 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3029  methylcitrate synthase  33.33 
 
 		 385 aa  174  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0100  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.71 
 
 		 377 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1665  methylcitrate synthase  32.9 
 
 		 377 aa  173  5e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  33.84 
 
 		 375 aa  173  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  32.36 
 
 		 378 aa  172  7.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  33.42 
 
 		 381 aa  172  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2821  putative 2-methylcitrate synthase  32.9 
 
 		 374 aa  172  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.702751  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02719  methylcitrate synthase  32.99 
 
 		 384 aa  172  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.966086  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  33.5 
 
 		 381 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  35.12 
 
 		 372 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1868  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.36 
 
 		 376 aa  172  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.650369  normal  0.135048 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1111  methylcitrate synthase  33.07 
 
 		 379 aa  172  2e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2498  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.25 
 
 		 374 aa  171  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0246552 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2079  methylcitrate synthase  31.87 
 
 		 386 aa  171  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.340874  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2081  methylcitrate synthase  32.38 
 
 		 404 aa  171  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.847456  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  33.02 
 
 		 397 aa  171  3e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1765  methylcitrate synthase  32.61 
 
 		 375 aa  170  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.924616  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.09 
 
 		 378 aa  171  4e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1310  methylcitrate synthase  32.48 
 
 		 375 aa  170  5e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1635  methylcitrate synthase  31.64 
 
 		 386 aa  170  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.169583 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1533  citrate (Si)-synthase  34.4 
 
 		 396 aa  170  5e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0715  citrate synthase  34.43 
 
 		 355 aa  169  7e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  32.85 
 
 		 373 aa  169  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0279  citrate synthase  32.69 
 
 		 396 aa  169  1e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.9 
 
 		 380 aa  169  1e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2604  2-methylcitrate synthase  33.07 
 
 		 374 aa  169  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.121252  hitchhiker  0.000290432 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2321  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.55 
 
 		 384 aa  169  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2335  methylcitrate synthase  31.37 
 
 		 375 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218689  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0621  methylcitrate synthase  32.85 
 
 		 383 aa  168  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3435  methylcitrate synthase  31.37 
 
 		 375 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01089  normal  0.171025 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.95 
 
 		 382 aa  168  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0401  methylcitrate synthase  32.44 
 
 		 389 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.600733  hitchhiker  0.00000000076827 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0463  methylcitrate synthase  32.44 
 
 		 389 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000165686  hitchhiker  0.000000131062 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2329  methylcitrate synthase  31.46 
 
 		 393 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1936  methylcitrate synthase  31.84 
 
 		 375 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686847  hitchhiker  0.000000858753 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4790  methylcitrate synthase  31.98 
 
 		 385 aa  167  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal  0.159071 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1487  2-methylcitrate synthase  33.41 
 
 		 372 aa  167  4e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1496  2-methylcitrate synthase  33.41 
 
 		 372 aa  167  4e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  31.82 
 
 		 375 aa  167  4e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1347  methylcitrate synthase  32.04 
 
 		 389 aa  167  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  31.75 
 
 		 395 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>