More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0903 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0903  citrate synthase  100 
 
 		 455 aa  938    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1989  citrate synthase  66.82 
 
 		 453 aa  644    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000399461  normal  0.147998 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3027  citrate synthase  69.45 
 
 		 456 aa  673    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000187967  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1122  citrate synthase  64.27 
 
 		 448 aa  583  1.0000000000000001e-165  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3834  citrate synthase  60.82 
 
 		 457 aa  555  1e-157  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000081885  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2571  citrate synthase  59.67 
 
 		 450 aa  538  9.999999999999999e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000324243  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2155  Citrate (Si)-synthase  52.76 
 
 		 441 aa  478  1e-134  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1100  citrate synthase  51.73 
 
 		 450 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0085  citrate synthase  48.84 
 
 		 448 aa  441  9.999999999999999e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.691353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28210  citrate synthase  47.09 
 
 		 445 aa  429  1e-119  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0102554  normal  0.648823 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2696  Citrate (Si)-synthase  48.44 
 
 		 447 aa  428  1e-119  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12790  citrate synthase  49.07 
 
 		 451 aa  426  1e-118  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0027871  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.84 
 
 		 379 aa  213  7.999999999999999e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.53 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.81 
 
 		 385 aa  210  3e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  36.58 
 
 		 387 aa  206  5e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.62 
 
 		 380 aa  205  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.01 
 
 		 377 aa  205  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  36.76 
 
 		 375 aa  205  1e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.8 
 
 		 382 aa  205  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  36.34 
 
 		 375 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.1 
 
 		 378 aa  203  4e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  36.6 
 
 		 378 aa  203  7e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.31 
 
 		 382 aa  202  8e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  36.25 
 
 		 381 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.48 
 
 		 378 aa  199  7e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  35.22 
 
 		 381 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  35.22 
 
 		 381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  35.13 
 
 		 386 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  35.13 
 
 		 386 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  34.96 
 
 		 381 aa  197  3e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.46 
 
 		 397 aa  197  4.0000000000000005e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  31.72 
 
 		 395 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1936  methylcitrate synthase  35.84 
 
 		 375 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686847  hitchhiker  0.000000858753 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2335  methylcitrate synthase  36.1 
 
 		 375 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218689  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3435  methylcitrate synthase  36.1 
 
 		 375 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01089  normal  0.171025 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1665  methylcitrate synthase  35.25 
 
 		 377 aa  196  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  34.71 
 
 		 397 aa  195  1e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  35.31 
 
 		 378 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.91 
 
 		 430 aa  195  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  34.54 
 
 		 389 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1776  methylcitrate synthase  35.22 
 
 		 375 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549839  hitchhiker  0.000461346 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  35.84 
 
 		 386 aa  193  6e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2086  methylcitrate synthase  35.73 
 
 		 375 aa  192  7e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.440425  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4723  methylcitrate synthase  36.62 
 
 		 375 aa  192  8e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53950  methylcitrate synthase  36.62 
 
 		 375 aa  192  9e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.282102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2105  citrate (Si)-synthase  35.19 
 
 		 397 aa  192  9e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414267  normal  0.0115455 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1765  methylcitrate synthase  35.17 
 
 		 375 aa  192  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.924616  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  35.31 
 
 		 373 aa  192  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4141  methylcitrate synthase  32.38 
 
 		 379 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26921  citrate synthase  34.2 
 
 		 396 aa  191  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.22 
 
 		 387 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4022  methylcitrate synthase  32.38 
 
 		 375 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3946  methylcitrate synthase  32.38 
 
 		 375 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2081  methylcitrate synthase  33.77 
 
 		 404 aa  190  5e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.847456  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  34.64 
 
 		 382 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1665  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.82 
 
 		 374 aa  189  8e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02719  methylcitrate synthase  34.38 
 
 		 384 aa  189  9e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.966086  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4048  methylcitrate synthase  32.12 
 
 		 375 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3645  methylcitrate synthase  32.12 
 
 		 375 aa  188  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  34.38 
 
 		 382 aa  188  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  32.47 
 
 		 370 aa  188  2e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2321  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.55 
 
 		 384 aa  188  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1858  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.75 
 
 		 374 aa  188  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  34.38 
 
 		 382 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  34.38 
 
 		 371 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02396  methylcitrate synthase  33.77 
 
 		 380 aa  187  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  34.38 
 
 		 371 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1198  methylcitrate synthase  33.16 
 
 		 376 aa  187  3e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  34.38 
 
 		 382 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  34.38 
 
 		 371 aa  187  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  34.64 
 
 		 371 aa  187  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2288  2-methylcitrate synthase  34.7 
 
 		 375 aa  187  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.037213  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  34.38 
 
 		 371 aa  187  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  34.38 
 
 		 371 aa  187  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003389  2-methylcitrate synthase  34.9 
 
 		 380 aa  187  4e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2604  2-methylcitrate synthase  33.77 
 
 		 374 aa  187  4e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.121252  hitchhiker  0.000290432 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0279  citrate synthase  34.29 
 
 		 396 aa  187  5e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1063  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.31 
 
 		 393 aa  187  5e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1586  methylcitrate synthase  34.12 
 
 		 385 aa  186  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000154256  normal  0.49975 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5862  methylcitrate synthase  33.25 
 
 		 398 aa  186  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0344  methylcitrate synthase  31.87 
 
 		 375 aa  186  6e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1420  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.55 
 
 		 374 aa  186  9e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0612  citrate synthase  36.31 
 
 		 386 aa  186  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.148892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  32.46 
 
 		 373 aa  186  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0924  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.16 
 
 		 379 aa  186  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1821  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.29 
 
 		 374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  32.46 
 
 		 373 aa  186  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1580  citrate synthase  34.69 
 
 		 383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3630  methylcitrate synthase  31.69 
 
 		 375 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0314  methylcitrate synthase  31.69 
 
 		 375 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3826  methylcitrate synthase  31.69 
 
 		 375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1071  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.24 
 
 		 373 aa  184  3e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.66322  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2401  2-methylcitrate synthase  32.55 
 
 		 371 aa  184  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.612256  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  34.42 
 
 		 378 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2420  2-methylcitrate synthase  34.29 
 
 		 375 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0822163  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.01 
 
 		 380 aa  183  5.0000000000000004e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2498  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.05 
 
 		 374 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0246552 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0121  methylcitrate synthase  34.11 
 
 		 387 aa  183  6e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2821  putative 2-methylcitrate synthase  34.37 
 
 		 374 aa  183  6e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.702751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>