More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2571 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2571  citrate synthase  100 
 
 		 450 aa  930    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000324243  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1122  citrate synthase  68.91 
 
 		 448 aa  607  9.999999999999999e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3027  citrate synthase  60.86 
 
 		 456 aa  570  1e-161  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000187967  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1989  citrate synthase  57.24 
 
 		 453 aa  542  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000399461  normal  0.147998 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0903  citrate synthase  59.67 
 
 		 455 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1100  citrate synthase  54.22 
 
 		 450 aa  503  1e-141  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3834  citrate synthase  53.17 
 
 		 457 aa  485  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000081885  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0085  citrate synthase  51.84 
 
 		 448 aa  476  1e-133  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.691353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2155  Citrate (Si)-synthase  51.27 
 
 		 441 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12790  citrate synthase  51.27 
 
 		 451 aa  457  1e-127  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0027871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28210  citrate synthase  47.69 
 
 		 445 aa  451  1e-125  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0102554  normal  0.648823 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2696  Citrate (Si)-synthase  51.62 
 
 		 447 aa  442  1e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.94 
 
 		 380 aa  215  9.999999999999999e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.67 
 
 		 385 aa  213  7e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.92 
 
 		 379 aa  207  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.6 
 
 		 377 aa  204  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.13 
 
 		 382 aa  199  6e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.52 
 
 		 387 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  35.92 
 
 		 386 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  35.92 
 
 		 386 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.04 
 
 		 378 aa  195  1e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  35.84 
 
 		 378 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.73 
 
 		 430 aa  194  3e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.96 
 
 		 382 aa  192  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2105  citrate (Si)-synthase  35.35 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414267  normal  0.0115455 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.8 
 
 		 382 aa  190  5e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.16 
 
 		 378 aa  189  7e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1063  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.81 
 
 		 393 aa  188  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.84 
 
 		 373 aa  188  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2604  2-methylcitrate synthase  33.25 
 
 		 374 aa  187  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.121252  hitchhiker  0.000290432 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  35.16 
 
 		 389 aa  186  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.04 
 
 		 380 aa  186  9e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.95 
 
 		 390 aa  185  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  35.38 
 
 		 381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  32.64 
 
 		 370 aa  184  3e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2288  2-methylcitrate synthase  33.16 
 
 		 375 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.037213  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  34.88 
 
 		 380 aa  183  5.0000000000000004e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2335  methylcitrate synthase  32.73 
 
 		 375 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218689  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3435  methylcitrate synthase  32.73 
 
 		 375 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01089  normal  0.171025 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1936  methylcitrate synthase  32.99 
 
 		 375 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686847  hitchhiker  0.000000858753 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1776  methylcitrate synthase  32.47 
 
 		 375 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549839  hitchhiker  0.000461346 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  36.64 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1071  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.9 
 
 		 373 aa  181  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.66322  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  34.44 
 
 		 381 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.98 
 
 		 397 aa  181  2e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3511  methylcitrate synthase  32.6 
 
 		 390 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.106101 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1176  2-methylcitrate synthase  34.03 
 
 		 372 aa  181  2e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.831059  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0820  2-methylcitrate synthase  34.03 
 
 		 372 aa  181  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  36.36 
 
 		 371 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0100  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.77 
 
 		 377 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1580  citrate synthase  35.15 
 
 		 383 aa  181  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  34.31 
 
 		 387 aa  180  4e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  36.36 
 
 		 382 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  33.59 
 
 		 378 aa  180  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1765  methylcitrate synthase  32.72 
 
 		 375 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.924616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2420  2-methylcitrate synthase  30.56 
 
 		 375 aa  180  4.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0822163  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  34.18 
 
 		 381 aa  180  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  36.09 
 
 		 371 aa  179  7e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  36.09 
 
 		 371 aa  179  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  36.09 
 
 		 382 aa  179  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  34.18 
 
 		 381 aa  179  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  36.09 
 
 		 382 aa  179  7e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  36.09 
 
 		 371 aa  179  8e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  32.56 
 
 		 395 aa  179  8e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  36.09 
 
 		 371 aa  179  8e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  35.82 
 
 		 373 aa  179  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  34.22 
 
 		 375 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  34.11 
 
 		 397 aa  179  1e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2401  2-methylcitrate synthase  33.94 
 
 		 371 aa  179  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.612256  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4141  methylcitrate synthase  30.95 
 
 		 379 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4723  methylcitrate synthase  33.09 
 
 		 375 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  34.63 
 
 		 373 aa  177  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0344  methylcitrate synthase  31.57 
 
 		 375 aa  177  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2086  methylcitrate synthase  32.9 
 
 		 375 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.440425  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.18 
 
 		 379 aa  177  3e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4022  methylcitrate synthase  30.95 
 
 		 375 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3946  methylcitrate synthase  30.95 
 
 		 375 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  34.63 
 
 		 373 aa  177  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53950  methylcitrate synthase  33.09 
 
 		 375 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.282102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1035  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.76 
 
 		 375 aa  177  4e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  33.98 
 
 		 375 aa  177  4e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0279  citrate synthase  34.28 
 
 		 396 aa  176  6e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  36.09 
 
 		 386 aa  176  9e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3645  methylcitrate synthase  30.69 
 
 		 375 aa  176  9e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0072  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.25 
 
 		 372 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0715  citrate synthase  33.33 
 
 		 355 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4048  methylcitrate synthase  30.69 
 
 		 375 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  34.37 
 
 		 374 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  33.33 
 
 		 373 aa  175  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0924  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.79 
 
 		 379 aa  175  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  34.81 
 
 		 378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1111  methylcitrate synthase  30.51 
 
 		 379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  35.81 
 
 		 371 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3630  methylcitrate synthase  30.36 
 
 		 375 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1130  citrate synthase I  33.33 
 
 		 431 aa  174  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.684999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0314  methylcitrate synthase  30.36 
 
 		 375 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0621  methylcitrate synthase  31.05 
 
 		 383 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1301  Citrate (Si)-synthase  32.92 
 
 		 431 aa  173  5e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.115082  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1868  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.97 
 
 		 376 aa  173  5e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.650369  normal  0.135048 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3826  methylcitrate synthase  30.1 
 
 		 375 aa  172  9e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>