More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2155 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2155  Citrate (Si)-synthase  100 
 
 
441 aa  899    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0903  citrate synthase  52.76 
 
 
455 aa  478  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3027  citrate synthase  52.79 
 
 
456 aa  474  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000187967  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1122  citrate synthase  55.81 
 
 
448 aa  477  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2571  citrate synthase  51.27 
 
 
450 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000324243  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1100  citrate synthase  51.25 
 
 
450 aa  458  9.999999999999999e-129  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1989  citrate synthase  50.93 
 
 
453 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000399461  normal  0.147998 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0085  citrate synthase  47.16 
 
 
448 aa  419  1e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.691353  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3834  citrate synthase  47.07 
 
 
457 aa  421  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000081885  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28210  citrate synthase  46.08 
 
 
445 aa  412  1e-114  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0102554  normal  0.648823 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2696  Citrate (Si)-synthase  48.08 
 
 
447 aa  401  9.999999999999999e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12790  citrate synthase  45.43 
 
 
451 aa  393  1e-108  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0027871  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.98 
 
 
379 aa  213  3.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.07 
 
 
380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34 
 
 
385 aa  189  7e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.99 
 
 
382 aa  188  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.93 
 
 
397 aa  184  3e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  35.79 
 
 
387 aa  182  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.69 
 
 
377 aa  182  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.58 
 
 
382 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  35.48 
 
 
386 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  35.48 
 
 
386 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.34 
 
 
387 aa  180  5.999999999999999e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.92 
 
 
382 aa  179  9e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.85 
 
 
378 aa  179  1e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2105  citrate (Si)-synthase  33.68 
 
 
397 aa  177  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414267  normal  0.0115455 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.14 
 
 
430 aa  176  8e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33 
 
 
379 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  31.54 
 
 
395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0121  methylcitrate synthase  32.78 
 
 
387 aa  172  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2329  methylcitrate synthase  31.68 
 
 
393 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  35.31 
 
 
381 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3295  methylcitrate synthase  33.52 
 
 
378 aa  171  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1586  methylcitrate synthase  32.6 
 
 
385 aa  171  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000154256  normal  0.49975 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1063  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.74 
 
 
393 aa  170  4e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  34.15 
 
 
373 aa  170  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0100  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.27 
 
 
377 aa  170  5e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6081  methylcitrate synthase  31.42 
 
 
389 aa  169  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.662054 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1936  methylcitrate synthase  32.27 
 
 
375 aa  169  8e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686847  hitchhiker  0.000000858753 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2335  methylcitrate synthase  32 
 
 
375 aa  169  9e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218689  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3435  methylcitrate synthase  32 
 
 
375 aa  169  9e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01089  normal  0.171025 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0344  methylcitrate synthase  31.87 
 
 
375 aa  169  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1809  methylcitrate synthase  31.4 
 
 
384 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.507238  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1665  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.69 
 
 
374 aa  168  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3630  methylcitrate synthase  31.87 
 
 
375 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4141  methylcitrate synthase  31.88 
 
 
379 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  34.49 
 
 
370 aa  168  1e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  34.95 
 
 
375 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  34.95 
 
 
375 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4022  methylcitrate synthase  31.88 
 
 
375 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0314  methylcitrate synthase  31.87 
 
 
375 aa  168  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3826  methylcitrate synthase  31.87 
 
 
375 aa  168  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  34.12 
 
 
372 aa  168  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3946  methylcitrate synthase  31.88 
 
 
375 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  33.97 
 
 
381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6860  methylcitrate synthase  31.42 
 
 
395 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632501  normal  0.17935 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  32.78 
 
 
374 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2081  methylcitrate synthase  31.52 
 
 
404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.847456  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0383  methylcitrate synthase  31.68 
 
 
390 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679335  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4048  methylcitrate synthase  31.59 
 
 
375 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1869  methylcitrate synthase  31.68 
 
 
390 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1737  methylcitrate synthase  31.68 
 
 
390 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1165  methylcitrate synthase  31.68 
 
 
390 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2900  methylcitrate synthase  31.42 
 
 
395 aa  167  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2401  2-methylcitrate synthase  33.97 
 
 
371 aa  167  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.612256  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2142  methylcitrate synthase  31.68 
 
 
390 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3645  methylcitrate synthase  31.59 
 
 
375 aa  167  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0289  methylcitrate synthase  31.68 
 
 
390 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0878  methylcitrate synthase  31.68 
 
 
390 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4723  methylcitrate synthase  31.89 
 
 
375 aa  167  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2288  2-methylcitrate synthase  31.41 
 
 
375 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.037213  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5345  methylcitrate synthase  31.06 
 
 
390 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.417928  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5516  methylcitrate synthase  31.06 
 
 
390 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272926  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4756  methylcitrate synthase  31.06 
 
 
390 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.394349  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0350  citrate synthase  35.09 
 
 
391 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2302  methylcitrate synthase  31.42 
 
 
389 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.459531  normal  0.256502 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53950  methylcitrate synthase  31.89 
 
 
375 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.282102  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3511  methylcitrate synthase  31.41 
 
 
390 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.106101 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1776  methylcitrate synthase  32 
 
 
375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549839  hitchhiker  0.000461346 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23220  methylcitrate synthase  30.62 
 
 
387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  33.7 
 
 
381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.97 
 
 
380 aa  165  1.0000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  33.42 
 
 
381 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2672  citrate synthase  34.95 
 
 
386 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.530506  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3065  citrate synthase  34.95 
 
 
386 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4355  methylcitrate synthase  30.85 
 
 
391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.25 
 
 
378 aa  164  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3860  methylcitrate synthase  31.68 
 
 
389 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2188  methylcitrate synthase  31.4 
 
 
390 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1071  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.37 
 
 
373 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.66322  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1658  citrate synthase  30.62 
 
 
373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.617148  normal  0.567466 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3974  methylcitrate synthase  31.68 
 
 
389 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0651061 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6707  methylcitrate synthase  30.85 
 
 
389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  33.67 
 
 
378 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1487  2-methylcitrate synthase  31.33 
 
 
372 aa  164  3e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2086  methylcitrate synthase  31.41 
 
 
375 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.440425  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0715  citrate synthase  31.78 
 
 
355 aa  164  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1765  methylcitrate synthase  32.69 
 
 
375 aa  164  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.924616  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.04 
 
 
390 aa  164  3e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1533  citrate (Si)-synthase  31.96 
 
 
396 aa  164  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>