More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3027 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3027  citrate synthase  100 
 
 		 456 aa  938    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000187967  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0903  citrate synthase  69.45 
 
 		 455 aa  673    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1989  citrate synthase  70.5 
 
 		 453 aa  687    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000399461  normal  0.147998 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1122  citrate synthase  65.84 
 
 		 448 aa  597  1e-169  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3834  citrate synthase  63.06 
 
 		 457 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000081885  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2571  citrate synthase  60.86 
 
 		 450 aa  570  1e-161  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000324243  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2155  Citrate (Si)-synthase  52.79 
 
 		 441 aa  474  1e-132  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1100  citrate synthase  52.09 
 
 		 450 aa  465  9.999999999999999e-131  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0085  citrate synthase  51.16 
 
 		 448 aa  456  1e-127  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.691353  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2696  Citrate (Si)-synthase  49.55 
 
 		 447 aa  432  1e-120  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28210  citrate synthase  47.44 
 
 		 445 aa  428  1e-118  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0102554  normal  0.648823 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12790  citrate synthase  48.14 
 
 		 451 aa  421  1e-116  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0027871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.43 
 
 		 385 aa  224  2e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.08 
 
 		 377 aa  217  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.78 
 
 		 379 aa  207  4e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  36.32 
 
 		 386 aa  203  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  36.32 
 
 		 386 aa  203  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.36 
 
 		 430 aa  202  7e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  36.32 
 
 		 381 aa  202  7e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  36.32 
 
 		 387 aa  202  8e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  36.66 
 
 		 378 aa  202  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  36.06 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  36.15 
 
 		 381 aa  201  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.2 
 
 		 378 aa  201  3e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  37.21 
 
 		 378 aa  198  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.11 
 
 		 382 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  35.79 
 
 		 381 aa  198  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.24 
 
 		 380 aa  197  4.0000000000000005e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2105  citrate (Si)-synthase  37.02 
 
 		 397 aa  197  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414267  normal  0.0115455 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26921  citrate synthase  35.75 
 
 		 396 aa  196  7e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  35.85 
 
 		 389 aa  196  9e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0715  citrate synthase  37.23 
 
 		 355 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.71 
 
 		 387 aa  194  2e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1580  citrate synthase  35.92 
 
 		 383 aa  194  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.39 
 
 		 397 aa  195  2e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.33 
 
 		 378 aa  194  3e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.12 
 
 		 382 aa  193  6e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  35.03 
 
 		 375 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0100  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.51 
 
 		 377 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  35.03 
 
 		 375 aa  191  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3065  citrate synthase  35.1 
 
 		 386 aa  190  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2672  citrate synthase  35.1 
 
 		 386 aa  190  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.530506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  36.71 
 
 		 372 aa  189  9e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0612  citrate synthase  35.9 
 
 		 386 aa  189  1e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.148892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  36.02 
 
 		 378 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  34.47 
 
 		 397 aa  188  2e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0350  citrate synthase  35.88 
 
 		 391 aa  187  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.28 
 
 		 382 aa  188  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.89 
 
 		 379 aa  187  3e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1198  methylcitrate synthase  33.42 
 
 		 376 aa  187  4e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  32.11 
 
 		 370 aa  186  8e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2420  2-methylcitrate synthase  32.99 
 
 		 375 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0822163  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0279  citrate synthase  34.87 
 
 		 396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0924  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.59 
 
 		 379 aa  184  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1508  methylcitrate synthase  33.77 
 
 		 386 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1665  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.55 
 
 		 374 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  35.99 
 
 		 382 aa  183  7e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.39 
 
 		 380 aa  182  8.000000000000001e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  35.71 
 
 		 371 aa  182  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  35.14 
 
 		 372 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1765  methylcitrate synthase  33.94 
 
 		 375 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.924616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3511  methylcitrate synthase  32.25 
 
 		 390 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.106101 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  35.71 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1063  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.42 
 
 		 393 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  32.33 
 
 		 373 aa  181  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  32.33 
 
 		 373 aa  181  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  35.44 
 
 		 371 aa  180  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.71 
 
 		 373 aa  180  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  35.44 
 
 		 371 aa  180  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1586  methylcitrate synthase  33.61 
 
 		 385 aa  180  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000154256  normal  0.49975 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  35.44 
 
 		 382 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  35.44 
 
 		 371 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  35.44 
 
 		 371 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3946  methylcitrate synthase  32.21 
 
 		 375 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  35.44 
 
 		 382 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4022  methylcitrate synthase  32.21 
 
 		 375 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  33.41 
 
 		 373 aa  179  5.999999999999999e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4141  methylcitrate synthase  32.21 
 
 		 379 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2604  2-methylcitrate synthase  32.99 
 
 		 374 aa  180  5.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.121252  hitchhiker  0.000290432 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  35.6 
 
 		 386 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1665  methylcitrate synthase  33.16 
 
 		 377 aa  180  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.08 
 
 		 390 aa  179  7e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2401  2-methylcitrate synthase  34.03 
 
 		 371 aa  179  8e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.612256  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1071  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.97 
 
 		 373 aa  178  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.66322  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  32.09 
 
 		 395 aa  179  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2288  2-methylcitrate synthase  33.51 
 
 		 375 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.037213  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  35.62 
 
 		 371 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4048  methylcitrate synthase  31.95 
 
 		 375 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1936  methylcitrate synthase  32.9 
 
 		 375 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686847  hitchhiker  0.000000858753 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3295  methylcitrate synthase  32.29 
 
 		 378 aa  178  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3645  methylcitrate synthase  31.95 
 
 		 375 aa  177  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1111  methylcitrate synthase  32.71 
 
 		 379 aa  177  3e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2335  methylcitrate synthase  32.65 
 
 		 375 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218689  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3029  methylcitrate synthase  32.55 
 
 		 385 aa  177  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3435  methylcitrate synthase  32.65 
 
 		 375 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01089  normal  0.171025 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02396  methylcitrate synthase  32.55 
 
 		 380 aa  176  6e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  35 
 
 		 373 aa  176  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0364  methylcitrate synthase  32.9 
 
 		 389 aa  176  7e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0421  methylcitrate synthase  33.25 
 
 		 389 aa  176  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0258062 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1868  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.11 
 
 		 376 aa  176  7e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.650369  normal  0.135048 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>