More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2696 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2696  Citrate (Si)-synthase  100 
 
 
447 aa  916    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2571  citrate synthase  51.62 
 
 
450 aa  442  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000324243  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1122  citrate synthase  54 
 
 
448 aa  443  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3027  citrate synthase  49.55 
 
 
456 aa  432  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000187967  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0903  citrate synthase  48.44 
 
 
455 aa  428  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1100  citrate synthase  47.45 
 
 
450 aa  409  1e-113  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1989  citrate synthase  48.05 
 
 
453 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000399461  normal  0.147998 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2155  Citrate (Si)-synthase  48.08 
 
 
441 aa  401  9.999999999999999e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3834  citrate synthase  46.61 
 
 
457 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000081885  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12790  citrate synthase  46.38 
 
 
451 aa  385  1e-105  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0027871  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0085  citrate synthase  44.57 
 
 
448 aa  380  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.691353  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28210  citrate synthase  43.29 
 
 
445 aa  364  2e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0102554  normal  0.648823 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.63 
 
 
379 aa  220  3.9999999999999997e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.11 
 
 
378 aa  215  9.999999999999999e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.37 
 
 
382 aa  211  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.8 
 
 
397 aa  209  6e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  35.94 
 
 
387 aa  207  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.85 
 
 
385 aa  205  1e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.66 
 
 
382 aa  204  3e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.89 
 
 
380 aa  204  4e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.28 
 
 
390 aa  202  7e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.74 
 
 
379 aa  202  9e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.8 
 
 
382 aa  201  3e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.44 
 
 
387 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.7 
 
 
377 aa  200  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2105  citrate (Si)-synthase  36.58 
 
 
397 aa  199  6e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414267  normal  0.0115455 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1533  citrate (Si)-synthase  37.67 
 
 
396 aa  196  6e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.79 
 
 
430 aa  194  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  36.2 
 
 
380 aa  194  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1063  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.8 
 
 
393 aa  192  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  32.49 
 
 
395 aa  191  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  36.07 
 
 
370 aa  190  5e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10915  type II citrate synthase  36.62 
 
 
431 aa  190  5e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  34.11 
 
 
374 aa  190  5e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  35.04 
 
 
382 aa  189  7e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  34.5 
 
 
371 aa  189  9e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  34.5 
 
 
371 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  34.5 
 
 
371 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  34.5 
 
 
371 aa  188  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  34.5 
 
 
371 aa  188  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  34.5 
 
 
382 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  35.57 
 
 
373 aa  188  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  35.57 
 
 
373 aa  188  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  34.5 
 
 
382 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  34.77 
 
 
382 aa  188  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  33.96 
 
 
386 aa  186  5e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0100  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.11 
 
 
377 aa  186  6e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3065  citrate synthase  35.29 
 
 
386 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2672  citrate synthase  35.29 
 
 
386 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.530506  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  33.67 
 
 
378 aa  184  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  34 
 
 
381 aa  183  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  34.5 
 
 
371 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  33.42 
 
 
373 aa  183  6e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1130  citrate synthase I  34.49 
 
 
431 aa  182  9.000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.684999  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  33.25 
 
 
381 aa  182  2e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  34.42 
 
 
372 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2420  2-methylcitrate synthase  32.66 
 
 
375 aa  181  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0822163  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  33.25 
 
 
381 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  34.23 
 
 
373 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  33.16 
 
 
386 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1140  citrate synthase I  35.2 
 
 
441 aa  181  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  33.16 
 
 
386 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.58 
 
 
378 aa  181  2.9999999999999997e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  34.15 
 
 
372 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  33.6 
 
 
375 aa  180  4e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33600  citrate synthase  36.07 
 
 
437 aa  180  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  33.86 
 
 
375 aa  179  7e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2224  citrate synthase I  35 
 
 
425 aa  179  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2604  2-methylcitrate synthase  32.32 
 
 
374 aa  179  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.121252  hitchhiker  0.000290432 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1570  citrate (Si)-synthase  34.09 
 
 
430 aa  178  2e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00021591  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0586  citrate synthase  34.09 
 
 
430 aa  178  2e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  33.59 
 
 
381 aa  177  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1198  methylcitrate synthase  33.51 
 
 
376 aa  176  5e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1270  citrate synthase I  33.78 
 
 
440 aa  176  5e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0855  citrate synthase I  36.05 
 
 
432 aa  176  7e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0328929  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0528  citrate synthase I  34.43 
 
 
437 aa  176  8e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0708503  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2141  Citrate (Si)-synthase  31.89 
 
 
389 aa  176  9e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.636674  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4723  methylcitrate synthase  31.44 
 
 
375 aa  176  9e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1580  citrate synthase  33.78 
 
 
383 aa  176  9e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53950  methylcitrate synthase  31.44 
 
 
375 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.282102  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0563  citrate synthase  31.54 
 
 
412 aa  176  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3584  citrate synthase I  33.67 
 
 
425 aa  175  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887444 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2234  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.59 
 
 
409 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.709963 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1936  methylcitrate synthase  30.98 
 
 
375 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686847  hitchhiker  0.000000858753 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  33.16 
 
 
378 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1776  methylcitrate synthase  30.73 
 
 
375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549839  hitchhiker  0.000461346 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1301  Citrate (Si)-synthase  32.84 
 
 
431 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.115082  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2335  methylcitrate synthase  30.73 
 
 
375 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218689  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2288  2-methylcitrate synthase  31.6 
 
 
375 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.037213  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3435  methylcitrate synthase  30.73 
 
 
375 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01089  normal  0.171025 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4838  type II citrate synthase  34.43 
 
 
434 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.782916  normal  0.17167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4456  type II citrate synthase  34.43 
 
 
434 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1275  citrate synthase  33.33 
 
 
427 aa  173  5e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.152797  normal  0.229785 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0713  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.91 
 
 
404 aa  173  5e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.756288  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4543  type II citrate synthase  34.43 
 
 
434 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.701189 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2086  methylcitrate synthase  31.91 
 
 
375 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.440425  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1729  type II citrate synthase  35.81 
 
 
434 aa  172  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0715  citrate synthase  33.15 
 
 
355 aa  172  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1187  citrate synthase  33 
 
 
431 aa  172  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1071  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.54 
 
 
373 aa  172  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.66322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>