More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0856 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0856  citrate synthase  100 
 
 		 406 aa  812    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7567  putative citrate synthase  44.47 
 
 		 407 aa  292  8e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2582  citrate synthase  43.73 
 
 		 410 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.11188  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2452  citrate synthase  43.49 
 
 		 410 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000202962 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4145  citrate synthase  42.32 
 
 		 395 aa  281  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017146  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0550  citrate synthase  41.75 
 
 		 414 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0425635 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3240  DNA binding domain protein, excisionase family  43.81 
 
 		 410 aa  279  5e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2556  citrate synthase  45.3 
 
 		 426 aa  280  5e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1922  citrate synthase  42.79 
 
 		 410 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.409228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2534  citrate synthase  42.79 
 
 		 410 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0988843  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0781  citrate synthase  42.75 
 
 		 545 aa  275  9e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2558  citrate synthase  42.54 
 
 		 410 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.01047 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3564  DNA binding domain protein, excisionase family  43.18 
 
 		 410 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3184  Citrate synthase  42.86 
 
 		 413 aa  269  8e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740532 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1148  citrate synthase  43 
 
 		 429 aa  263  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0705512  normal  0.385377 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2391  citrate synthase  39.45 
 
 		 391 aa  253  3e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4908  citrate synthase  41.28 
 
 		 397 aa  242  7e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0761  citrate synthase  42.93 
 
 		 410 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0771063  normal  0.040487 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4949  citrate synthase  43.47 
 
 		 382 aa  226  8e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537298  normal  0.392134 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4213  Citrate synthase  40 
 
 		 414 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.425435 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2102  citrate synthase  39.05 
 
 		 384 aa  219  5e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0845  citrate synthase  36.48 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.627781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3955  citrate synthase  40.1 
 
 		 386 aa  213  7e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.999666  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6077  citrate synthase  36.34 
 
 		 413 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2580  regulatory protein MerR  33.98 
 
 		 425 aa  210  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6374  citrate synthase  36.82 
 
 		 413 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.154136 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0483  DNA binding domain-containing protein  34.66 
 
 		 389 aa  208  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4951  citrate synthase  36.43 
 
 		 415 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3209  citrate synthase  36.43 
 
 		 415 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1760  citrate synthase  37.44 
 
 		 374 aa  206  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5753  Citrate synthase  36.09 
 
 		 384 aa  204  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.149777  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4867  citrate synthase  38.29 
 
 		 385 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0287319  normal  0.592181 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1829  Citrate synthase  39.21 
 
 		 381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.375812  hitchhiker  0.00523151 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2245  citrate synthase  41.63 
 
 		 402 aa  193  4e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2026  Citrate synthase  39.9 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1721  excisionase/Xis, DNA-binding  32.84 
 
 		 404 aa  187  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178266  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  33.7 
 
 		 373 aa  183  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0946  citrate synthase family protein  45.58 
 
 		 450 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2258  citrate synthase family protein  45.58 
 
 		 501 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0942  citrate synthase family protein  45.58 
 
 		 450 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0679891  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0555  citrate synthase family protein  45.58 
 
 		 453 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2135  citrate synthase family protein  45.58 
 
 		 453 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3560  DNA binding domain protein, excisionase family  31.88 
 
 		 412 aa  168  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0836216  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1097  citrate synthase family protein  44.65 
 
 		 289 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.383469  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  29.59 
 
 		 373 aa  167  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  29.59 
 
 		 373 aa  167  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1008  citrate synthase  32.37 
 
 		 429 aa  157  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  30.41 
 
 		 372 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  30.41 
 
 		 372 aa  150  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  29.18 
 
 		 382 aa  147  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  28.9 
 
 		 386 aa  146  5e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  28.9 
 
 		 371 aa  146  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  29.75 
 
 		 371 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  29.18 
 
 		 371 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  29.18 
 
 		 371 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  29.18 
 
 		 371 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  29.18 
 
 		 371 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  28.9 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  29.18 
 
 		 382 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2716  putative citrate synthase  30.05 
 
 		 418 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000320245  normal  0.180168 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  29.18 
 
 		 382 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1508  methylcitrate synthase  32.85 
 
 		 386 aa  143  5e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  29.53 
 
 		 374 aa  142  9e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1586  methylcitrate synthase  31.5 
 
 		 385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000154256  normal  0.49975 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0621  methylcitrate synthase  30.55 
 
 		 383 aa  140  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0383  methylcitrate synthase  30.55 
 
 		 390 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679335  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1869  methylcitrate synthase  30.55 
 
 		 390 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1737  methylcitrate synthase  30.55 
 
 		 390 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0878  methylcitrate synthase  30.55 
 
 		 390 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1165  methylcitrate synthase  30.55 
 
 		 390 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2142  methylcitrate synthase  30.55 
 
 		 390 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0289  methylcitrate synthase  30.55 
 
 		 390 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2079  methylcitrate synthase  31.61 
 
 		 386 aa  138  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.340874  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1347  methylcitrate synthase  32.86 
 
 		 389 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26517  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.59 
 
 		 373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1635  methylcitrate synthase  31.61 
 
 		 386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.169583 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2188  methylcitrate synthase  29.97 
 
 		 390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5345  methylcitrate synthase  30.56 
 
 		 390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.417928  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5516  methylcitrate synthase  30.56 
 
 		 390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23220  methylcitrate synthase  30.14 
 
 		 387 aa  137  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4756  methylcitrate synthase  30.56 
 
 		 390 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.394349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5388  methylcitrate synthase  30.77 
 
 		 390 aa  137  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5862  methylcitrate synthase  30.55 
 
 		 398 aa  137  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4841  methylcitrate synthase  30.77 
 
 		 390 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.994856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2319  methylcitrate synthase  28.95 
 
 		 386 aa  136  8e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.16364  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3029  methylcitrate synthase  30.81 
 
 		 385 aa  136  8e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3288  methylcitrate synthase  30.77 
 
 		 390 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.281405  normal  0.014196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  32.87 
 
 		 373 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0142  methylcitrate synthase  31.07 
 
 		 390 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482229  normal  0.590891 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6860  methylcitrate synthase  29.91 
 
 		 395 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632501  normal  0.17935 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0866  methylcitrate synthase  29.51 
 
 		 391 aa  134  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4790  methylcitrate synthase  30.12 
 
 		 385 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal  0.159071 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53950  methylcitrate synthase  30.88 
 
 		 375 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.282102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6081  methylcitrate synthase  29.62 
 
 		 389 aa  133  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.662054 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2302  methylcitrate synthase  30.7 
 
 		 389 aa  133  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.459531  normal  0.256502 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2900  methylcitrate synthase  30.7 
 
 		 395 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02719  methylcitrate synthase  30.68 
 
 		 384 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.966086  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2081  methylcitrate synthase  30.97 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.847456  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2329  methylcitrate synthase  29.48 
 
 		 393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4723  methylcitrate synthase  30.59 
 
 		 375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>