More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6374 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6077  citrate synthase  97.34 
 
 		 413 aa  803    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4951  citrate synthase  90.6 
 
 		 415 aa  748    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6374  citrate synthase  100 
 
 		 413 aa  822    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.154136 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3209  citrate synthase  90.6 
 
 		 415 aa  748    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4213  Citrate synthase  73.61 
 
 		 414 aa  580  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.425435 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0845  citrate synthase  60 
 
 		 390 aa  436  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.627781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1760  citrate synthase  60.53 
 
 		 374 aa  431  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5753  Citrate synthase  60.63 
 
 		 384 aa  424  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.149777  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3955  citrate synthase  45.26 
 
 		 386 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.999666  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4949  citrate synthase  47.51 
 
 		 382 aa  259  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537298  normal  0.392134 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1829  Citrate synthase  43.16 
 
 		 381 aa  249  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.375812  hitchhiker  0.00523151 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4867  citrate synthase  43.8 
 
 		 385 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0287319  normal  0.592181 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2026  Citrate synthase  41.65 
 
 		 381 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1148  citrate synthase  38.62 
 
 		 429 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0705512  normal  0.385377 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2102  citrate synthase  39.69 
 
 		 384 aa  231  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4908  citrate synthase  40.05 
 
 		 397 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2391  citrate synthase  41.41 
 
 		 391 aa  224  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3240  DNA binding domain protein, excisionase family  38.19 
 
 		 410 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3564  DNA binding domain protein, excisionase family  38.38 
 
 		 410 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0856  citrate synthase  36.82 
 
 		 406 aa  209  5e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0550  citrate synthase  37.87 
 
 		 414 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0425635 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0781  citrate synthase  37.71 
 
 		 545 aa  199  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3184  Citrate synthase  38.44 
 
 		 413 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740532 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2582  citrate synthase  38.24 
 
 		 410 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.11188  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2452  citrate synthase  37.59 
 
 		 410 aa  186  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000202962 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2558  citrate synthase  38.95 
 
 		 410 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.01047 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1922  citrate synthase  38.72 
 
 		 410 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.409228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2534  citrate synthase  38.72 
 
 		 410 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0988843  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4145  citrate synthase  33.25 
 
 		 395 aa  175  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017146  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7567  putative citrate synthase  33.92 
 
 		 407 aa  173  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2556  citrate synthase  37.83 
 
 		 426 aa  162  8.000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2245  citrate synthase  39.26 
 
 		 402 aa  158  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2258  citrate synthase family protein  47.14 
 
 		 501 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2135  citrate synthase family protein  47.14 
 
 		 453 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0555  citrate synthase family protein  47.14 
 
 		 453 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0946  citrate synthase family protein  47.14 
 
 		 450 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0942  citrate synthase family protein  47.14 
 
 		 450 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0679891  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1097  citrate synthase family protein  46.67 
 
 		 289 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.383469  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1008  citrate synthase  29.33 
 
 		 429 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0761  citrate synthase  34.94 
 
 		 410 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0771063  normal  0.040487 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0483  DNA binding domain-containing protein  30.9 
 
 		 389 aa  124  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0622  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.45 
 
 		 367 aa  122  8e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0115525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0647  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.45 
 
 		 367 aa  122  8e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.029125  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3560  DNA binding domain protein, excisionase family  33.5 
 
 		 412 aa  119  7.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0836216  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2716  putative citrate synthase  28.71 
 
 		 418 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000320245  normal  0.180168 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  26.67 
 
 		 373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1721  excisionase/Xis, DNA-binding  30.5 
 
 		 404 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  26.95 
 
 		 374 aa  109  7.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2103  citrate synthase 2  37.13 
 
 		 364 aa  109  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  27.3 
 
 		 371 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  27.3 
 
 		 371 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  27.3 
 
 		 371 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  27.3 
 
 		 382 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  27.3 
 
 		 382 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  27.3 
 
 		 371 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  27.3 
 
 		 382 aa  107  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  27.3 
 
 		 371 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  27.59 
 
 		 382 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  26.44 
 
 		 371 aa  106  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  25.5 
 
 		 373 aa  106  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  25.5 
 
 		 373 aa  106  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.75 
 
 		 382 aa  105  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.08 
 
 		 382 aa  103  6e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  27.01 
 
 		 386 aa  103  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  33.97 
 
 		 378 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2580  regulatory protein MerR  27.36 
 
 		 425 aa  101  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  30.35 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2027  citrate synthase 2  36.92 
 
 		 362 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.84 
 
 		 385 aa  100  5e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.7 
 
 		 373 aa  100  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  33.33 
 
 		 380 aa  100  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10908  citrate synthase 2  35.53 
 
 		 373 aa  100  6e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  27.54 
 
 		 381 aa  100  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1830  citrate synthase 2  37.44 
 
 		 362 aa  100  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.011311 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  33.33 
 
 		 372 aa  99.8  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  27.54 
 
 		 381 aa  99.8  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.5 
 
 		 382 aa  99.8  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.62 
 
 		 378 aa  99.4  9e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3748  Citrate (Si)-synthase  36.36 
 
 		 388 aa  99  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.77 
 
 		 377 aa  98.6  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.78 
 
 		 379 aa  98.2  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0247  citrate synthase 2  34.78 
 
 		 368 aa  97.8  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.32184  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0715  citrate synthase  30.73 
 
 		 355 aa  97.8  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  33.5 
 
 		 381 aa  98.2  3e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  27.79 
 
 		 372 aa  97.4  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3093  Citrate (Si)-synthase  32.52 
 
 		 378 aa  97.1  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.832749 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  34.01 
 
 		 381 aa  97.1  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5025  citrate synthase 2  34.52 
 
 		 371 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0279  citrate synthase  33.5 
 
 		 396 aa  95.5  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0350  citrate synthase  25.5 
 
 		 391 aa  94.4  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  32.97 
 
 		 373 aa  94  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  26.68 
 
 		 375 aa  93.2  7e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0511  citrate synthase 2  34.41 
 
 		 368 aa  93.2  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.043222  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4546  citrate synthase 2  33.83 
 
 		 376 aa  93.2  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591553  normal  0.862054 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4459  citrate synthase 2  33.83 
 
 		 376 aa  93.2  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4841  citrate synthase 2  33.5 
 
 		 376 aa  92.8  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.169021 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  27.27 
 
 		 375 aa  92.8  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1262  Citrate (Si)-synthase  34.62 
 
 		 375 aa  92.4  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7568  citrate synthase 2  32.34 
 
 		 362 aa  92.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.708852 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4948  citrate synthase 2  34.6 
 
 		 364 aa  92.4  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.257238  normal  0.409706 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>