More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A0555 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA2258  citrate synthase family protein  100 
 
 		 501 aa  861    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0942  citrate synthase family protein  96.69 
 
 		 450 aa  706    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0679891  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0946  citrate synthase family protein  97.79 
 
 		 450 aa  715    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0555  citrate synthase family protein  100 
 
 		 453 aa  862    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2135  citrate synthase family protein  100 
 
 		 453 aa  862    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1097  citrate synthase family protein  99.29 
 
 		 289 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.383469  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2582  citrate synthase  64.24 
 
 		 410 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.11188  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2452  citrate synthase  64.24 
 
 		 410 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000202962 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2558  citrate synthase  63.56 
 
 		 410 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.01047 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1922  citrate synthase  63.78 
 
 		 410 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.409228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2534  citrate synthase  63.78 
 
 		 410 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0988843  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0781  citrate synthase  53.93 
 
 		 545 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0550  citrate synthase  55.73 
 
 		 414 aa  385  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0425635 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0761  citrate synthase  62.89 
 
 		 410 aa  381  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0771063  normal  0.040487 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3184  Citrate synthase  53.26 
 
 		 413 aa  359  6e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740532 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0856  citrate synthase  39.87 
 
 		 406 aa  268  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3240  DNA binding domain protein, excisionase family  42.83 
 
 		 410 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2391  citrate synthase  41.16 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4145  citrate synthase  37.75 
 
 		 395 aa  233  5e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017146  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7567  putative citrate synthase  38.2 
 
 		 407 aa  216  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2556  citrate synthase  42.86 
 
 		 426 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3564  DNA binding domain protein, excisionase family  53.22 
 
 		 410 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2102  citrate synthase  36 
 
 		 384 aa  192  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1148  citrate synthase  50.66 
 
 		 429 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0705512  normal  0.385377 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4908  citrate synthase  52.78 
 
 		 397 aa  186  8e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0753  citrate synthase family protein  85.81 
 
 		 327 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.915915  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4949  citrate synthase  55.19 
 
 		 382 aa  166  6.9999999999999995e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537298  normal  0.392134 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3955  citrate synthase  49.36 
 
 		 386 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.999666  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2026  Citrate synthase  37 
 
 		 381 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2716  putative citrate synthase  32.46 
 
 		 418 aa  163  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000320245  normal  0.180168 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6374  citrate synthase  45.92 
 
 		 413 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.154136 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6077  citrate synthase  45.06 
 
 		 413 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4951  citrate synthase  44.26 
 
 		 415 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3209  citrate synthase  44.26 
 
 		 415 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4867  citrate synthase  50.24 
 
 		 385 aa  157  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0287319  normal  0.592181 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1760  citrate synthase  42.92 
 
 		 374 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0483  DNA binding domain-containing protein  33.41 
 
 		 389 aa  146  7.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  26.34 
 
 		 373 aa  144  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4213  Citrate synthase  44.4 
 
 		 414 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.425435 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0845  citrate synthase  41.28 
 
 		 390 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.627781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5753  Citrate synthase  43.06 
 
 		 384 aa  140  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.149777  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3560  DNA binding domain protein, excisionase family  34.83 
 
 		 412 aa  138  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0836216  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  26.55 
 
 		 373 aa  136  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  26.55 
 
 		 373 aa  136  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  34.47 
 
 		 374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1008  citrate synthase  42.86 
 
 		 429 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.31 
 
 		 382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1035  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.42 
 
 		 375 aa  127  5e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.75 
 
 		 382 aa  127  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1829  Citrate synthase  42.67 
 
 		 381 aa  126  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.375812  hitchhiker  0.00523151 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  27.48 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  27.48 
 
 		 382 aa  125  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.42 
 
 		 382 aa  124  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  27.48 
 
 		 371 aa  124  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  27.48 
 
 		 371 aa  124  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2647  methylcitrate synthase  31.91 
 
 		 394 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0622  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.36 
 
 		 367 aa  124  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0115525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0647  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.36 
 
 		 367 aa  124  4e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.029125  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  27.48 
 
 		 382 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  27.48 
 
 		 382 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  27.48 
 
 		 371 aa  124  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  27.48 
 
 		 371 aa  123  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  27.48 
 
 		 371 aa  123  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  27.23 
 
 		 371 aa  123  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0715  citrate synthase  35 
 
 		 355 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.34 
 
 		 378 aa  121  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  26.67 
 
 		 372 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3029  methylcitrate synthase  29.44 
 
 		 385 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  26.38 
 
 		 386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0621  methylcitrate synthase  30.08 
 
 		 383 aa  118  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  31.84 
 
 		 375 aa  118  3e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3748  Citrate (Si)-synthase  39.91 
 
 		 388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  28.17 
 
 		 372 aa  117  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02719  methylcitrate synthase  30.16 
 
 		 384 aa  117  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.966086  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2420  Citrate synthase  38 
 
 		 481 aa  117  6e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2224  citrate synthase I  34.04 
 
 		 425 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4948  citrate synthase 2  41.92 
 
 		 364 aa  116  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.257238  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1347  methylcitrate synthase  31.38 
 
 		 389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3511  methylcitrate synthase  29.37 
 
 		 390 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.106101 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12020  citrate synthase  35.68 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.555378  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1586  methylcitrate synthase  33.33 
 
 		 385 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000154256  normal  0.49975 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2401  2-methylcitrate synthase  35.23 
 
 		 371 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.612256  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.1 
 
 		 379 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.85 
 
 		 430 aa  114  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10915  type II citrate synthase  29.95 
 
 		 431 aa  114  5e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0834  Citrate (Si)-synthase  35.19 
 
 		 377 aa  113  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  26.33 
 
 		 370 aa  113  7.000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1270  citrate synthase I  35.41 
 
 		 440 aa  113  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  29.92 
 
 		 380 aa  112  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  26.23 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.96 
 
 		 373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5036  citrate synthase I  36.57 
 
 		 428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6150  Citrate (Si)-synthase  30.17 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.153659 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02359  type II citrate synthase  35.51 
 
 		 442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.33 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  31.4 
 
 		 373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4790  methylcitrate synthase  31.58 
 
 		 385 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal  0.159071 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2319  methylcitrate synthase  28.5 
 
 		 386 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.16364  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3561  Citrate (Si)-synthase  39.25 
 
 		 387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141515  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23220  methylcitrate synthase  28.04 
 
 		 387 aa  112  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>