More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6077 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4951  citrate synthase  91.08 
 
 		 415 aa  755    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6077  citrate synthase  100 
 
 		 413 aa  825    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6374  citrate synthase  97.34 
 
 		 413 aa  803    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.154136 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3209  citrate synthase  91.08 
 
 		 415 aa  755    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4213  Citrate synthase  74.09 
 
 		 414 aa  584  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.425435 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0845  citrate synthase  60 
 
 		 390 aa  436  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.627781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1760  citrate synthase  60.16 
 
 		 374 aa  432  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5753  Citrate synthase  59.74 
 
 		 384 aa  418  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.149777  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3955  citrate synthase  45.14 
 
 		 386 aa  263  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.999666  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4949  citrate synthase  47.11 
 
 		 382 aa  261  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537298  normal  0.392134 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1829  Citrate synthase  43.31 
 
 		 381 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.375812  hitchhiker  0.00523151 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4867  citrate synthase  43.54 
 
 		 385 aa  241  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0287319  normal  0.592181 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2026  Citrate synthase  42.45 
 
 		 381 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2102  citrate synthase  40.21 
 
 		 384 aa  232  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1148  citrate synthase  37.6 
 
 		 429 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0705512  normal  0.385377 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2391  citrate synthase  41.93 
 
 		 391 aa  226  6e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4908  citrate synthase  39.44 
 
 		 397 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0856  citrate synthase  36.34 
 
 		 406 aa  211  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3240  DNA binding domain protein, excisionase family  37.44 
 
 		 410 aa  210  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3564  DNA binding domain protein, excisionase family  37.63 
 
 		 410 aa  209  9e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0550  citrate synthase  37.38 
 
 		 414 aa  206  8e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0425635 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0781  citrate synthase  37.5 
 
 		 545 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3184  Citrate synthase  37.23 
 
 		 413 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740532 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2558  citrate synthase  38.92 
 
 		 410 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.01047 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1922  citrate synthase  38.67 
 
 		 410 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.409228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2534  citrate synthase  38.67 
 
 		 410 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0988843  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2582  citrate synthase  37.96 
 
 		 410 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.11188  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2452  citrate synthase  37.71 
 
 		 410 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000202962 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7567  putative citrate synthase  33.25 
 
 		 407 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4145  citrate synthase  32.99 
 
 		 395 aa  172  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017146  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2556  citrate synthase  36.96 
 
 		 426 aa  159  9e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2245  citrate synthase  38.77 
 
 		 402 aa  155  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2135  citrate synthase family protein  46.67 
 
 		 453 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2258  citrate synthase family protein  46.67 
 
 		 501 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0555  citrate synthase family protein  46.67 
 
 		 453 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0942  citrate synthase family protein  46.67 
 
 		 450 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0679891  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0946  citrate synthase family protein  46.67 
 
 		 450 aa  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1097  citrate synthase family protein  46.19 
 
 		 289 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.383469  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1008  citrate synthase  30.49 
 
 		 429 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0761  citrate synthase  44.13 
 
 		 410 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0771063  normal  0.040487 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0483  DNA binding domain-containing protein  31.23 
 
 		 389 aa  123  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3560  DNA binding domain protein, excisionase family  32.91 
 
 		 412 aa  122  9e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0836216  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0647  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.73 
 
 		 367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.029125  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0622  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.73 
 
 		 367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0115525  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2716  putative citrate synthase  28.19 
 
 		 418 aa  113  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000320245  normal  0.180168 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  27.22 
 
 		 373 aa  112  8.000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.03 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  34.22 
 
 		 374 aa  107  5e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  25.64 
 
 		 373 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  25.64 
 
 		 373 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2103  citrate synthase 2  36.14 
 
 		 364 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1721  excisionase/Xis, DNA-binding  29.78 
 
 		 404 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178266  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  27.01 
 
 		 371 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  25.72 
 
 		 382 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  27.01 
 
 		 371 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  27.01 
 
 		 371 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  26.3 
 
 		 382 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  27.01 
 
 		 371 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  25.72 
 
 		 382 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10908  citrate synthase 2  35.53 
 
 		 373 aa  100  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  27.01 
 
 		 371 aa  101  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  25.94 
 
 		 371 aa  101  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  25.72 
 
 		 382 aa  101  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.79 
 
 		 382 aa  100  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2580  regulatory protein MerR  28.61 
 
 		 425 aa  100  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0247  citrate synthase 2  35.33 
 
 		 368 aa  100  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.32184  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3748  Citrate (Si)-synthase  36.04 
 
 		 388 aa  98.2  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.68 
 
 		 385 aa  98.2  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.4 
 
 		 373 aa  98.6  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  26.5 
 
 		 386 aa  97.8  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  32.8 
 
 		 380 aa  97.8  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2027  citrate synthase 2  35.9 
 
 		 362 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  27.03 
 
 		 381 aa  97.4  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  32.54 
 
 		 372 aa  97.4  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  33.01 
 
 		 378 aa  97.4  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.46 
 
 		 379 aa  97.1  5e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3093  Citrate (Si)-synthase  32.51 
 
 		 378 aa  97.1  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.832749 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  27.03 
 
 		 381 aa  97.1  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1830  citrate synthase 2  36.41 
 
 		 362 aa  97.1  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.011311 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  29.85 
 
 		 375 aa  97.1  6e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5025  citrate synthase 2  34.52 
 
 		 371 aa  96.3  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.49 
 
 		 377 aa  96.7  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  27.43 
 
 		 372 aa  96.7  8e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  28.87 
 
 		 373 aa  96.3  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  26.74 
 
 		 381 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.3 
 
 		 382 aa  95.9  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1262  Citrate (Si)-synthase  35.1 
 
 		 375 aa  94.7  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.65 
 
 		 378 aa  95.1  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0715  citrate synthase  29.69 
 
 		 355 aa  94  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0511  citrate synthase 2  34.41 
 
 		 368 aa  94  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.043222  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  33.17 
 
 		 381 aa  94  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4841  citrate synthase 2  33.5 
 
 		 376 aa  94  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.169021 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4546  citrate synthase 2  34.52 
 
 		 376 aa  94  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591553  normal  0.862054 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4459  citrate synthase 2  34.52 
 
 		 376 aa  94  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7568  citrate synthase 2  32.18 
 
 		 362 aa  93.2  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.708852 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33820  citrate synthase 2  35.29 
 
 		 389 aa  92  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.655288  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0520  citrate (Si)-synthase  30.04 
 
 		 368 aa  91.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.341938  normal  0.0162418 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4948  citrate synthase 2  34.12 
 
 		 364 aa  91.3  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.257238  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1016  Citrate (Si)-synthase  32.8 
 
 		 366 aa  90.9  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.525155  hitchhiker  0.00235766 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0848  Citrate (Si)-synthase  36.17 
 
 		 368 aa  90.9  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>