More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2582 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2558  citrate synthase  90.24 
 
 		 410 aa  651    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.01047 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2452  citrate synthase  98.29 
 
 		 410 aa  770    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000202962 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1922  citrate synthase  90.49 
 
 		 410 aa  652    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.409228  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2582  citrate synthase  100 
 
 		 410 aa  784    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.11188  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2534  citrate synthase  90.49 
 
 		 410 aa  652    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0988843  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0761  citrate synthase  87.8 
 
 		 410 aa  566  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0771063  normal  0.040487 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0550  citrate synthase  63.77 
 
 		 414 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0425635 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0781  citrate synthase  62.32 
 
 		 545 aa  456  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3184  Citrate synthase  62.56 
 
 		 413 aa  427  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740532 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2258  citrate synthase family protein  63.58 
 
 		 501 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0942  citrate synthase family protein  64 
 
 		 450 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0679891  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0946  citrate synthase family protein  64 
 
 		 450 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0555  citrate synthase family protein  63.58 
 
 		 453 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2135  citrate synthase family protein  63.58 
 
 		 453 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0856  citrate synthase  43.73 
 
 		 406 aa  298  8e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1097  citrate synthase family protein  68.95 
 
 		 289 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.383469  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4908  citrate synthase  47.03 
 
 		 397 aa  268  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2391  citrate synthase  43.52 
 
 		 391 aa  268  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3564  DNA binding domain protein, excisionase family  47.45 
 
 		 410 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3240  DNA binding domain protein, excisionase family  46.42 
 
 		 410 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1148  citrate synthase  45.34 
 
 		 429 aa  263  6e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0705512  normal  0.385377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7567  putative citrate synthase  41.23 
 
 		 407 aa  247  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4145  citrate synthase  40.19 
 
 		 395 aa  233  7.000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017146  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2556  citrate synthase  44.31 
 
 		 426 aa  223  6e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4949  citrate synthase  45.3 
 
 		 382 aa  219  6e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537298  normal  0.392134 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3955  citrate synthase  42.28 
 
 		 386 aa  209  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.999666  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4867  citrate synthase  42.11 
 
 		 385 aa  208  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0287319  normal  0.592181 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2102  citrate synthase  38.9 
 
 		 384 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1829  Citrate synthase  41.91 
 
 		 381 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.375812  hitchhiker  0.00523151 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2026  Citrate synthase  43.14 
 
 		 381 aa  199  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0845  citrate synthase  36.32 
 
 		 390 aa  197  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.627781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4951  citrate synthase  38.74 
 
 		 415 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3209  citrate synthase  38.74 
 
 		 415 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4213  Citrate synthase  38.92 
 
 		 414 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.425435 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1760  citrate synthase  37.1 
 
 		 374 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5753  Citrate synthase  37.71 
 
 		 384 aa  195  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.149777  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6374  citrate synthase  38.24 
 
 		 413 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.154136 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6077  citrate synthase  37.96 
 
 		 413 aa  194  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0483  DNA binding domain-containing protein  34.95 
 
 		 389 aa  170  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2245  citrate synthase  43.03 
 
 		 402 aa  169  8e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  29.25 
 
 		 373 aa  162  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2716  putative citrate synthase  33.94 
 
 		 418 aa  157  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000320245  normal  0.180168 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1008  citrate synthase  33.33 
 
 		 429 aa  153  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  28.3 
 
 		 373 aa  146  6e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  28.3 
 
 		 373 aa  146  6e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3560  DNA binding domain protein, excisionase family  34.8 
 
 		 412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0836216  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0753  citrate synthase family protein  70.95 
 
 		 327 aa  139  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.915915  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1721  excisionase/Xis, DNA-binding  33.81 
 
 		 404 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  31.01 
 
 		 374 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  28.96 
 
 		 382 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  28.96 
 
 		 382 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  28.96 
 
 		 371 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  28.96 
 
 		 371 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  28.69 
 
 		 371 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  28.96 
 
 		 371 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0622  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.92 
 
 		 367 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0115525  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  28.96 
 
 		 371 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0647  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.92 
 
 		 367 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.029125  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  28.99 
 
 		 382 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  29.56 
 
 		 372 aa  126  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  28.99 
 
 		 382 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2580  regulatory protein MerR  29.85 
 
 		 425 aa  125  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  29.07 
 
 		 371 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  28.53 
 
 		 386 aa  125  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3029  methylcitrate synthase  35.18 
 
 		 385 aa  124  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1347  methylcitrate synthase  36.82 
 
 		 389 aa  120  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4841  methylcitrate synthase  34.5 
 
 		 390 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.994856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5388  methylcitrate synthase  34.5 
 
 		 390 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02719  methylcitrate synthase  35.71 
 
 		 384 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.966086  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  33.84 
 
 		 372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2647  methylcitrate synthase  35.27 
 
 		 394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1586  methylcitrate synthase  35.5 
 
 		 385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000154256  normal  0.49975 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0142  methylcitrate synthase  34 
 
 		 390 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482229  normal  0.590891 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0866  methylcitrate synthase  36.1 
 
 		 391 aa  117  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2319  methylcitrate synthase  34.78 
 
 		 386 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.16364  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3288  methylcitrate synthase  36.1 
 
 		 390 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.281405  normal  0.014196 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0621  methylcitrate synthase  37.06 
 
 		 383 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0715  citrate synthase  32 
 
 		 355 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5345  methylcitrate synthase  34.5 
 
 		 390 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.417928  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2027  citrate synthase 2  33.7 
 
 		 362 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4790  methylcitrate synthase  36.55 
 
 		 385 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal  0.159071 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5516  methylcitrate synthase  34.5 
 
 		 390 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4756  methylcitrate synthase  34.5 
 
 		 390 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.394349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3511  methylcitrate synthase  34 
 
 		 390 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.106101 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0383  methylcitrate synthase  34.63 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679335  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1869  methylcitrate synthase  34.63 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1737  methylcitrate synthase  34.63 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6707  methylcitrate synthase  34.62 
 
 		 389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2142  methylcitrate synthase  34.63 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0289  methylcitrate synthase  34.63 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23220  methylcitrate synthase  33.16 
 
 		 387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  27.55 
 
 		 370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1165  methylcitrate synthase  34.63 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0878  methylcitrate synthase  34.63 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2188  methylcitrate synthase  32.66 
 
 		 390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6081  methylcitrate synthase  34.17 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.662054 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1035  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.68 
 
 		 375 aa  114  3e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6860  methylcitrate synthase  33.17 
 
 		 395 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632501  normal  0.17935 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  30.73 
 
 		 375 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2079  methylcitrate synthase  36.82 
 
 		 386 aa  113  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.340874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>