More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1760 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1760  citrate synthase  100 
 
 		 374 aa  757    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0845  citrate synthase  76.92 
 
 		 390 aa  572  1.0000000000000001e-162  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.627781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5753  Citrate synthase  74.6 
 
 		 384 aa  540  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.149777  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6077  citrate synthase  60.16 
 
 		 413 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6374  citrate synthase  60.53 
 
 		 413 aa  431  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.154136 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4951  citrate synthase  58.93 
 
 		 415 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3209  citrate synthase  58.93 
 
 		 415 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4213  Citrate synthase  58.18 
 
 		 414 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.425435 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1829  Citrate synthase  45.55 
 
 		 381 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.375812  hitchhiker  0.00523151 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2026  Citrate synthase  46.09 
 
 		 381 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4949  citrate synthase  47.18 
 
 		 382 aa  270  2.9999999999999997e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537298  normal  0.392134 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3955  citrate synthase  44.74 
 
 		 386 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.999666  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4867  citrate synthase  45.63 
 
 		 385 aa  263  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0287319  normal  0.592181 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2102  citrate synthase  41.53 
 
 		 384 aa  240  4e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1148  citrate synthase  39.8 
 
 		 429 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0705512  normal  0.385377 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4908  citrate synthase  40.67 
 
 		 397 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2391  citrate synthase  38.22 
 
 		 391 aa  215  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3240  DNA binding domain protein, excisionase family  37.85 
 
 		 410 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0550  citrate synthase  36.09 
 
 		 414 aa  210  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0425635 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3564  DNA binding domain protein, excisionase family  37.6 
 
 		 410 aa  209  7e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0856  citrate synthase  37.44 
 
 		 406 aa  206  6e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7567  putative citrate synthase  37.47 
 
 		 407 aa  195  8.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2452  citrate synthase  37.25 
 
 		 410 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000202962 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2582  citrate synthase  37.1 
 
 		 410 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.11188  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0781  citrate synthase  35.53 
 
 		 545 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1922  citrate synthase  37.5 
 
 		 410 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.409228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2534  citrate synthase  37.5 
 
 		 410 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0988843  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2558  citrate synthase  37.25 
 
 		 410 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.01047 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3184  Citrate synthase  34.01 
 
 		 413 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740532 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4145  citrate synthase  31.52 
 
 		 395 aa  161  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017146  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0761  citrate synthase  35.59 
 
 		 410 aa  160  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0771063  normal  0.040487 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2556  citrate synthase  36.61 
 
 		 426 aa  160  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2245  citrate synthase  39.65 
 
 		 402 aa  154  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2258  citrate synthase family protein  43.52 
 
 		 501 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0555  citrate synthase family protein  43.52 
 
 		 453 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0946  citrate synthase family protein  43.52 
 
 		 450 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2135  citrate synthase family protein  43.52 
 
 		 453 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0942  citrate synthase family protein  43.52 
 
 		 450 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0679891  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1097  citrate synthase family protein  43.06 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.383469  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3560  DNA binding domain protein, excisionase family  32.74 
 
 		 412 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0836216  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2716  putative citrate synthase  29.5 
 
 		 418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000320245  normal  0.180168 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1008  citrate synthase  29.46 
 
 		 429 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0647  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  26.59 
 
 		 367 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.029125  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0622  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  26.59 
 
 		 367 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0115525  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  27.45 
 
 		 373 aa  120  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  27.64 
 
 		 373 aa  116  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  27.64 
 
 		 373 aa  116  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0483  DNA binding domain-containing protein  29.01 
 
 		 389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  28.74 
 
 		 370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  27.09 
 
 		 371 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  27.09 
 
 		 371 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  27.09 
 
 		 382 aa  109  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  27.07 
 
 		 386 aa  110  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  27.09 
 
 		 371 aa  110  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  27.09 
 
 		 371 aa  110  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  27.09 
 
 		 382 aa  109  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  26.8 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  26.8 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  27.09 
 
 		 371 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3748  Citrate (Si)-synthase  36.82 
 
 		 388 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  27.17 
 
 		 371 aa  106  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  25.14 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.51 
 
 		 378 aa  104  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  26.59 
 
 		 372 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  34.03 
 
 		 380 aa  103  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0511  citrate synthase 2  34.88 
 
 		 368 aa  100  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.043222  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  26.01 
 
 		 372 aa  100  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3093  Citrate (Si)-synthase  33.51 
 
 		 378 aa  99.4  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.832749 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1830  citrate synthase 2  35.2 
 
 		 362 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.011311 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  27.85 
 
 		 375 aa  98.6  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.26 
 
 		 382 aa  98.6  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1016  Citrate (Si)-synthase  33.51 
 
 		 366 aa  97.8  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.525155  hitchhiker  0.00235766 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  26.44 
 
 		 379 aa  97.8  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.32 
 
 		 373 aa  97.4  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2027  citrate synthase 2  35.57 
 
 		 362 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  26.1 
 
 		 385 aa  95.9  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10908  citrate synthase 2  33.01 
 
 		 373 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0247  citrate synthase 2  34.07 
 
 		 368 aa  95.9  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.32184  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1035  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  25 
 
 		 375 aa  95.5  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.34 
 
 		 377 aa  95.9  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0834  Citrate (Si)-synthase  33.88 
 
 		 377 aa  95.1  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  29.26 
 
 		 373 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3561  Citrate (Si)-synthase  30.99 
 
 		 387 aa  95.1  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141515  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0857  citrate (Si)-synthase  30.45 
 
 		 390 aa  94.7  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.74 
 
 		 382 aa  94.7  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  33.33 
 
 		 387 aa  94  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0154  citrate synthase  26.47 
 
 		 374 aa  94  4e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.649155 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5025  citrate synthase 2  32.54 
 
 		 371 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4459  citrate synthase 2  31.46 
 
 		 376 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4546  citrate synthase 2  31.46 
 
 		 376 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591553  normal  0.862054 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0830  Citrate (Si)-synthase  32.43 
 
 		 374 aa  93.2  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2103  citrate synthase 2  31.86 
 
 		 364 aa  92.8  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.26 
 
 		 382 aa  92.8  9e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4948  citrate synthase 2  31.75 
 
 		 364 aa  92.8  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.257238  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4841  citrate synthase 2  31.1 
 
 		 376 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.169021 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0423  citrate synthase 2  33.01 
 
 		 368 aa  92.4  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2420  2-methylcitrate synthase  27.81 
 
 		 375 aa  92  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0822163  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1262  Citrate (Si)-synthase  31.63 
 
 		 375 aa  92.4  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4708  citrate synthase 2  29.72 
 
 		 370 aa  91.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2401  2-methylcitrate synthase  27.11 
 
 		 371 aa  92  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.612256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>