More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2556 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2556  citrate synthase  100 
 
 		 426 aa  799    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4145  citrate synthase  46.67 
 
 		 395 aa  320  3e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017146  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0856  citrate synthase  46.02 
 
 		 406 aa  318  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0781  citrate synthase  44.55 
 
 		 545 aa  282  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0550  citrate synthase  44.15 
 
 		 414 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0425635 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3184  Citrate synthase  46.44 
 
 		 413 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740532 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3240  DNA binding domain protein, excisionase family  44.36 
 
 		 410 aa  270  4e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2582  citrate synthase  44.55 
 
 		 410 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.11188  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2452  citrate synthase  44.72 
 
 		 410 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000202962 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3564  DNA binding domain protein, excisionase family  44.07 
 
 		 410 aa  260  4e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1148  citrate synthase  43.07 
 
 		 429 aa  255  8e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0705512  normal  0.385377 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2558  citrate synthase  45.95 
 
 		 410 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.01047 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7567  putative citrate synthase  43.06 
 
 		 407 aa  253  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1922  citrate synthase  45.7 
 
 		 410 aa  253  7e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.409228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2534  citrate synthase  45.7 
 
 		 410 aa  253  7e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0988843  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2391  citrate synthase  42.27 
 
 		 391 aa  251  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4908  citrate synthase  46.14 
 
 		 397 aa  247  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4867  citrate synthase  42.68 
 
 		 385 aa  217  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0287319  normal  0.592181 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4949  citrate synthase  44.67 
 
 		 382 aa  216  7e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537298  normal  0.392134 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2245  citrate synthase  47.34 
 
 		 402 aa  213  4.9999999999999996e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0483  DNA binding domain-containing protein  39.27 
 
 		 389 aa  209  8e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1829  Citrate synthase  39.57 
 
 		 381 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.375812  hitchhiker  0.00523151 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2102  citrate synthase  36.67 
 
 		 384 aa  205  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6374  citrate synthase  38.31 
 
 		 413 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.154136 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4951  citrate synthase  36.67 
 
 		 415 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3209  citrate synthase  36.67 
 
 		 415 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6077  citrate synthase  37.44 
 
 		 413 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1760  citrate synthase  37.35 
 
 		 374 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4213  Citrate synthase  37.96 
 
 		 414 aa  192  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.425435 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0845  citrate synthase  36.79 
 
 		 390 aa  192  8e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.627781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2026  Citrate synthase  39.65 
 
 		 381 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2258  citrate synthase family protein  50.93 
 
 		 501 aa  177  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0946  citrate synthase family protein  50.93 
 
 		 450 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2135  citrate synthase family protein  50.93 
 
 		 453 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0555  citrate synthase family protein  50.93 
 
 		 453 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0942  citrate synthase family protein  50.93 
 
 		 450 aa  176  9e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0679891  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1097  citrate synthase family protein  50.47 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.383469  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2580  regulatory protein MerR  34.38 
 
 		 425 aa  173  5.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1721  excisionase/Xis, DNA-binding  33.1 
 
 		 404 aa  161  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3560  DNA binding domain protein, excisionase family  34.39 
 
 		 412 aa  160  5e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0836216  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3955  citrate synthase  52.24 
 
 		 386 aa  157  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.999666  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1008  citrate synthase  32.39 
 
 		 429 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0761  citrate synthase  50.24 
 
 		 410 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0771063  normal  0.040487 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  30.42 
 
 		 374 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  28.98 
 
 		 373 aa  147  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  30.79 
 
 		 373 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  30.79 
 
 		 373 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0647  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.71 
 
 		 367 aa  144  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.029125  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0622  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.71 
 
 		 367 aa  144  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0115525  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.21 
 
 		 373 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2716  putative citrate synthase  31.09 
 
 		 418 aa  140  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000320245  normal  0.180168 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.8 
 
 		 382 aa  139  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.24 
 
 		 382 aa  136  5e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  32.27 
 
 		 380 aa  136  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.21 
 
 		 378 aa  135  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  31.16 
 
 		 373 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  29.91 
 
 		 372 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  29.18 
 
 		 371 aa  133  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  29.18 
 
 		 371 aa  133  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  28.9 
 
 		 382 aa  133  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  29.18 
 
 		 382 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  29.18 
 
 		 371 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  29.41 
 
 		 372 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  29.18 
 
 		 371 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  29.18 
 
 		 382 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  28.9 
 
 		 382 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  29.18 
 
 		 371 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0715  citrate synthase  35.53 
 
 		 355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  28.86 
 
 		 371 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  28.98 
 
 		 370 aa  130  6e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1035  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.8 
 
 		 375 aa  130  6e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  28.85 
 
 		 386 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4948  citrate synthase 2  36.47 
 
 		 364 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.257238  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.05 
 
 		 382 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.79 
 
 		 385 aa  125  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3561  Citrate (Si)-synthase  31.68 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141515  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  33.85 
 
 		 375 aa  124  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3748  Citrate (Si)-synthase  34.36 
 
 		 388 aa  124  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0574  citrate synthase  30.55 
 
 		 378 aa  124  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3747  Citrate synthase  34.16 
 
 		 454 aa  123  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.88792 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  35.18 
 
 		 378 aa  123  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  30.54 
 
 		 378 aa  123  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.25 
 
 		 377 aa  122  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0621  methylcitrate synthase  29.53 
 
 		 383 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1016  Citrate (Si)-synthase  34.78 
 
 		 366 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.525155  hitchhiker  0.00235766 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  29.56 
 
 		 381 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.52 
 
 		 378 aa  121  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  29.56 
 
 		 381 aa  121  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0260  citrate synthase I  35.35 
 
 		 426 aa  121  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.419168  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3029  methylcitrate synthase  26.55 
 
 		 385 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0834  Citrate (Si)-synthase  32.76 
 
 		 377 aa  120  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0848  Citrate (Si)-synthase  37.33 
 
 		 368 aa  120  6e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  29.56 
 
 		 381 aa  120  6e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0344  methylcitrate synthase  28.41 
 
 		 375 aa  119  7e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  36.45 
 
 		 387 aa  119  7.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10908  citrate synthase 2  40.62 
 
 		 373 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26921  citrate synthase  34.07 
 
 		 396 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3630  methylcitrate synthase  28.65 
 
 		 375 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3826  methylcitrate synthase  28.65 
 
 		 375 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02719  methylcitrate synthase  27.14 
 
 		 384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.966086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>