More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0483 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0483  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 		 389 aa  779    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2580  regulatory protein MerR  41.28 
 
 		 425 aa  285  8e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1721  excisionase/Xis, DNA-binding  42.13 
 
 		 404 aa  276  5e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0856  citrate synthase  34.66 
 
 		 406 aa  208  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7567  putative citrate synthase  38.21 
 
 		 407 aa  203  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4145  citrate synthase  32.84 
 
 		 395 aa  187  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017146  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1148  citrate synthase  36.21 
 
 		 429 aa  186  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0705512  normal  0.385377 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3240  DNA binding domain protein, excisionase family  35.84 
 
 		 410 aa  178  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3564  DNA binding domain protein, excisionase family  36.75 
 
 		 410 aa  172  9e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4867  citrate synthase  36.91 
 
 		 385 aa  169  9e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0287319  normal  0.592181 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2556  citrate synthase  39.02 
 
 		 426 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2582  citrate synthase  34.95 
 
 		 410 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.11188  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2452  citrate synthase  35.44 
 
 		 410 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000202962 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2391  citrate synthase  35.5 
 
 		 391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2558  citrate synthase  34.96 
 
 		 410 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.01047 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1922  citrate synthase  34.72 
 
 		 410 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.409228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2534  citrate synthase  34.72 
 
 		 410 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0988843  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4908  citrate synthase  33.5 
 
 		 397 aa  147  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4949  citrate synthase  34.99 
 
 		 382 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537298  normal  0.392134 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0781  citrate synthase  32.58 
 
 		 545 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0550  citrate synthase  32.67 
 
 		 414 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0425635 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3184  Citrate synthase  32.41 
 
 		 413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740532 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1829  Citrate synthase  30.54 
 
 		 381 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.375812  hitchhiker  0.00523151 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3955  citrate synthase  32.49 
 
 		 386 aa  125  9e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.999666  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2102  citrate synthase  32.66 
 
 		 384 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4213  Citrate synthase  29.77 
 
 		 414 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.425435 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6077  citrate synthase  31.23 
 
 		 413 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6374  citrate synthase  30.9 
 
 		 413 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.154136 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4951  citrate synthase  29.82 
 
 		 415 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3209  citrate synthase  29.82 
 
 		 415 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2026  Citrate synthase  31.16 
 
 		 381 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5753  Citrate synthase  29.55 
 
 		 384 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.149777  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0761  citrate synthase  35.11 
 
 		 410 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0771063  normal  0.040487 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2245  citrate synthase  34.24 
 
 		 402 aa  116  7.999999999999999e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1760  citrate synthase  29.01 
 
 		 374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0845  citrate synthase  29.47 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.627781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1008  citrate synthase  28.28 
 
 		 429 aa  113  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3560  DNA binding domain protein, excisionase family  32.83 
 
 		 412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0836216  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2716  putative citrate synthase  28.43 
 
 		 418 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000320245  normal  0.180168 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2258  citrate synthase family protein  38.21 
 
 		 501 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0946  citrate synthase family protein  38.21 
 
 		 450 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2135  citrate synthase family protein  38.21 
 
 		 453 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0555  citrate synthase family protein  38.21 
 
 		 453 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0942  citrate synthase family protein  38.21 
 
 		 450 aa  99.4  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0679891  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1097  citrate synthase family protein  37.74 
 
 		 289 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.383469  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  25.07 
 
 		 370 aa  88.6  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1508  methylcitrate synthase  27.12 
 
 		 386 aa  85.1  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  28.62 
 
 		 372 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  27.9 
 
 		 374 aa  83.6  0.000000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  35.11 
 
 		 373 aa  83.6  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  27.3 
 
 		 372 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4085  citrate synthase I  29.25 
 
 		 427 aa  83.2  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0621  methylcitrate synthase  26.38 
 
 		 383 aa  82.4  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  28.74 
 
 		 380 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  26.98 
 
 		 378 aa  79.3  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  24.93 
 
 		 373 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  24.93 
 
 		 373 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  29.02 
 
 		 373 aa  78.6  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.72 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3911  citrate synthase I  28.87 
 
 		 427 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.93 
 
 		 377 aa  78.6  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2319  methylcitrate synthase  23.92 
 
 		 386 aa  77  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.16364  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4790  methylcitrate synthase  28 
 
 		 385 aa  77  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal  0.159071 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02359  type II citrate synthase  31.07 
 
 		 442 aa  76.6  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12020  citrate synthase  26.65 
 
 		 389 aa  75.9  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.555378  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  23.43 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  23.43 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  23.43 
 
 		 371 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  23.43 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  23.43 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  23.43 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  23.43 
 
 		 382 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  23.43 
 
 		 371 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  23.14 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  23.43 
 
 		 382 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0715  citrate synthase  26.04 
 
 		 355 aa  74.3  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  25.47 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  24.55 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2962  2-methylcitrate synthase  27.71 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3253  type II citrate synthase  28.31 
 
 		 425 aa  71.6  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  30.35 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3747  Citrate synthase  27.75 
 
 		 454 aa  71.6  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.88792 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3029  methylcitrate synthase  24.59 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  29.95 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  30.62 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1347  methylcitrate synthase  27.17 
 
 		 389 aa  70.9  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4948  citrate synthase 2  33.96 
 
 		 364 aa  70.5  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.257238  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  30.54 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0647  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  24.18 
 
 		 367 aa  70.1  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.029125  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1586  methylcitrate synthase  24.86 
 
 		 385 aa  69.7  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000154256  normal  0.49975 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0622  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  24.18 
 
 		 367 aa  70.1  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0115525  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0574  citrate synthase  28.53 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  29.95 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0364  methylcitrate synthase  29.53 
 
 		 389 aa  69.7  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3288  methylcitrate synthase  24.86 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.281405  normal  0.014196 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.7 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0421  methylcitrate synthase  29.53 
 
 		 389 aa  69.7  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0258062 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3065  citrate synthase  25.87 
 
 		 386 aa  68.9  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2672  citrate synthase  25.87 
 
 		 386 aa  68.9  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.530506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  30.41 
 
 		 375 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>