More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0845 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0845  citrate synthase  100 
 
 		 390 aa  785    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.627781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5753  Citrate synthase  83.81 
 
 		 384 aa  624  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.149777  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1760  citrate synthase  76.92 
 
 		 374 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4213  Citrate synthase  59.27 
 
 		 414 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.425435 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6077  citrate synthase  60 
 
 		 413 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6374  citrate synthase  60 
 
 		 413 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.154136 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3209  citrate synthase  58.91 
 
 		 415 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4951  citrate synthase  58.91 
 
 		 415 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4949  citrate synthase  47.38 
 
 		 382 aa  281  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537298  normal  0.392134 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3955  citrate synthase  45.29 
 
 		 386 aa  281  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.999666  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1829  Citrate synthase  42.41 
 
 		 381 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.375812  hitchhiker  0.00523151 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2026  Citrate synthase  42.53 
 
 		 381 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4867  citrate synthase  42.67 
 
 		 385 aa  246  4e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0287319  normal  0.592181 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2102  citrate synthase  39.47 
 
 		 384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4908  citrate synthase  42.17 
 
 		 397 aa  235  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3240  DNA binding domain protein, excisionase family  38.77 
 
 		 410 aa  226  7e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1148  citrate synthase  38.77 
 
 		 429 aa  225  9e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0705512  normal  0.385377 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3564  DNA binding domain protein, excisionase family  39.11 
 
 		 410 aa  223  6e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2391  citrate synthase  40.26 
 
 		 391 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0856  citrate synthase  36.48 
 
 		 406 aa  214  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0550  citrate synthase  36.89 
 
 		 414 aa  209  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0425635 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0781  citrate synthase  37.28 
 
 		 545 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7567  putative citrate synthase  35.24 
 
 		 407 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2582  citrate synthase  36.32 
 
 		 410 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.11188  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2452  citrate synthase  36.5 
 
 		 410 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000202962 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4145  citrate synthase  35.26 
 
 		 395 aa  186  6e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017146  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3184  Citrate synthase  36.8 
 
 		 413 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740532 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2534  citrate synthase  37.32 
 
 		 410 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0988843  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1922  citrate synthase  37.32 
 
 		 410 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.409228  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2558  citrate synthase  37.07 
 
 		 410 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.01047 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0761  citrate synthase  36.14 
 
 		 410 aa  161  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0771063  normal  0.040487 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2245  citrate synthase  39.11 
 
 		 402 aa  158  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2556  citrate synthase  36.1 
 
 		 426 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1008  citrate synthase  29.02 
 
 		 429 aa  137  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115669  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2258  citrate synthase family protein  42.86 
 
 		 501 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2135  citrate synthase family protein  42.86 
 
 		 453 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0946  citrate synthase family protein  42.86 
 
 		 450 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0555  citrate synthase family protein  42.86 
 
 		 453 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0942  citrate synthase family protein  42.86 
 
 		 450 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0679891  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1097  citrate synthase family protein  42.4 
 
 		 289 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.383469  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3560  DNA binding domain protein, excisionase family  32.65 
 
 		 412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0836216  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2716  putative citrate synthase  29.9 
 
 		 418 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000320245  normal  0.180168 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  28.21 
 
 		 373 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  27.84 
 
 		 373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0483  DNA binding domain-containing protein  29.47 
 
 		 389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  27.84 
 
 		 373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2580  regulatory protein MerR  28.43 
 
 		 425 aa  113  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0647  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.03 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.029125  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0622  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.03 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0115525  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  27.46 
 
 		 370 aa  107  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  28.78 
 
 		 380 aa  106  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  27.99 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  27.75 
 
 		 371 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.57 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3748  Citrate (Si)-synthase  30.46 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  32.84 
 
 		 374 aa  105  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  27.89 
 
 		 372 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0247  citrate synthase 2  32.03 
 
 		 368 aa  103  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.32184  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1035  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.32 
 
 		 375 aa  103  4e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  27.11 
 
 		 371 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  27.11 
 
 		 371 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  27.11 
 
 		 371 aa  102  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  27.11 
 
 		 371 aa  102  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  27.11 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  27.11 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  27.11 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  26.82 
 
 		 382 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1721  excisionase/Xis, DNA-binding  28.33 
 
 		 404 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  26.82 
 
 		 382 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10908  citrate synthase 2  32.56 
 
 		 373 aa  100  6e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.31 
 
 		 373 aa  100  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  27.73 
 
 		 372 aa  100  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0511  citrate synthase 2  34.93 
 
 		 368 aa  99.8  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.043222  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  26.16 
 
 		 379 aa  99.4  9e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3093  Citrate (Si)-synthase  28.57 
 
 		 378 aa  98.2  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.832749 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  25.58 
 
 		 382 aa  98.6  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.79 
 
 		 382 aa  97.4  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  29.11 
 
 		 375 aa  95.9  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4546  citrate synthase 2  29.45 
 
 		 376 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591553  normal  0.862054 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.2 
 
 		 377 aa  95.5  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0848  Citrate (Si)-synthase  30.34 
 
 		 368 aa  95.5  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1016  Citrate (Si)-synthase  34.97 
 
 		 366 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.525155  hitchhiker  0.00235766 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5025  citrate synthase 2  31.36 
 
 		 371 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4459  citrate synthase 2  29.45 
 
 		 376 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0834  Citrate (Si)-synthase  29.74 
 
 		 377 aa  94.7  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0520  citrate (Si)-synthase  31.17 
 
 		 368 aa  94.7  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.341938  normal  0.0162418 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  25.87 
 
 		 382 aa  94.4  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4841  citrate synthase 2  29.14 
 
 		 376 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.169021 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2103  citrate synthase 2  28.45 
 
 		 364 aa  94  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  31.15 
 
 		 373 aa  94  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1262  Citrate (Si)-synthase  32.09 
 
 		 375 aa  93.6  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0715  citrate synthase  29.41 
 
 		 355 aa  92.8  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1063  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.86 
 
 		 393 aa  92.8  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1830  citrate synthase 2  34.26 
 
 		 362 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.011311 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4948  citrate synthase 2  33.65 
 
 		 364 aa  92.8  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.257238  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.58 
 
 		 385 aa  92.8  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1726  citrate synthase 2  30.56 
 
 		 373 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3561  Citrate (Si)-synthase  33.49 
 
 		 387 aa  91.7  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141515  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5814  Citrate (Si)-synthase  31.02 
 
 		 361 aa  91.3  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00482398 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1724  citrate synthase 3  26.94 
 
 		 372 aa  91.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.992858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>