More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2102 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2102  citrate synthase  100 
 
 
384 aa  773    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1829  Citrate synthase  54.03 
 
 
381 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.375812  hitchhiker  0.00523151 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2026  Citrate synthase  53.91 
 
 
381 aa  348  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4949  citrate synthase  46.58 
 
 
382 aa  262  8e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537298  normal  0.392134 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3955  citrate synthase  43.59 
 
 
386 aa  257  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.999666  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0845  citrate synthase  39.47 
 
 
390 aa  249  5e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.627781  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2391  citrate synthase  40.36 
 
 
391 aa  248  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1760  citrate synthase  41.53 
 
 
374 aa  246  6.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4951  citrate synthase  39.74 
 
 
415 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3209  citrate synthase  39.74 
 
 
415 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5753  Citrate synthase  38.64 
 
 
384 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.149777  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6077  citrate synthase  40.21 
 
 
413 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4213  Citrate synthase  42.78 
 
 
414 aa  235  8e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.425435 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6374  citrate synthase  39.69 
 
 
413 aa  235  8e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.154136 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4867  citrate synthase  41.21 
 
 
385 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0287319  normal  0.592181 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3564  DNA binding domain protein, excisionase family  39.24 
 
 
410 aa  225  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0856  citrate synthase  38.65 
 
 
406 aa  223  4.9999999999999996e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3240  DNA binding domain protein, excisionase family  38.25 
 
 
410 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1148  citrate synthase  37.89 
 
 
429 aa  220  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0705512  normal  0.385377 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0550  citrate synthase  37.87 
 
 
414 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0425635 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4908  citrate synthase  38.82 
 
 
397 aa  213  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115723  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7567  putative citrate synthase  37.31 
 
 
407 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0781  citrate synthase  36.99 
 
 
545 aa  205  8e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2452  citrate synthase  38.77 
 
 
410 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000202962 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4145  citrate synthase  35.55 
 
 
395 aa  200  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017146  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2582  citrate synthase  38.42 
 
 
410 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.11188  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3184  Citrate synthase  37.59 
 
 
413 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740532 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2558  citrate synthase  39.47 
 
 
410 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.01047 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2245  citrate synthase  42.61 
 
 
402 aa  193  5e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1922  citrate synthase  39.23 
 
 
410 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.409228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2534  citrate synthase  39.23 
 
 
410 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0988843  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2556  citrate synthase  36.67 
 
 
426 aa  168  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0761  citrate synthase  39.22 
 
 
410 aa  161  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0771063  normal  0.040487 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2258  citrate synthase family protein  42.99 
 
 
501 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0946  citrate synthase family protein  42.99 
 
 
450 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0555  citrate synthase family protein  42.99 
 
 
453 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2135  citrate synthase family protein  42.99 
 
 
453 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0942  citrate synthase family protein  42.99 
 
 
450 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0679891  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1097  citrate synthase family protein  42.52 
 
 
289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.383469  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0483  DNA binding domain-containing protein  32.66 
 
 
389 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2716  putative citrate synthase  31.76 
 
 
418 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000320245  normal  0.180168 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  30.64 
 
 
372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2580  regulatory protein MerR  28.95 
 
 
425 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  31.01 
 
 
372 aa  117  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  27.54 
 
 
374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  29.01 
 
 
371 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  31.88 
 
 
380 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  28.84 
 
 
386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.66 
 
 
373 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4948  citrate synthase 2  34.49 
 
 
364 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.257238  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1721  excisionase/Xis, DNA-binding  29.72 
 
 
404 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178266  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  36.51 
 
 
382 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  36.51 
 
 
371 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  36.51 
 
 
371 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  36.51 
 
 
371 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  36.51 
 
 
382 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  36.51 
 
 
382 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  36.51 
 
 
371 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  36.51 
 
 
382 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  36.51 
 
 
371 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  28.36 
 
 
373 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  32.8 
 
 
373 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  32.8 
 
 
373 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1008  citrate synthase  36.27 
 
 
429 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115669  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0622  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.2 
 
 
367 aa  100  6e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0115525  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  30.12 
 
 
370 aa  100  6e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0647  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.2 
 
 
367 aa  100  6e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.029125  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0715  citrate synthase  34.52 
 
 
355 aa  99.8  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1830  citrate synthase 2  32.86 
 
 
362 aa  99.4  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.011311 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2027  citrate synthase 2  34.18 
 
 
362 aa  99.4  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2401  2-methylcitrate synthase  35.48 
 
 
371 aa  99  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.612256  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  28.49 
 
 
381 aa  98.6  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.1 
 
 
377 aa  98.6  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  29.05 
 
 
375 aa  97.8  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  28.34 
 
 
395 aa  97.8  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1176  2-methylcitrate synthase  32.99 
 
 
372 aa  96.7  5e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.831059  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0820  2-methylcitrate synthase  32.99 
 
 
372 aa  96.7  5e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  29.18 
 
 
381 aa  96.7  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  29.18 
 
 
381 aa  96.3  8e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  28.49 
 
 
381 aa  95.9  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1658  citrate synthase  28.73 
 
 
373 aa  96.3  9e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.617148  normal  0.567466 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  32.28 
 
 
373 aa  94.7  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1496  2-methylcitrate synthase  29.16 
 
 
372 aa  95.1  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  28.77 
 
 
375 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3561  Citrate (Si)-synthase  33.5 
 
 
387 aa  95.1  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141515  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003389  2-methylcitrate synthase  28.74 
 
 
380 aa  95.1  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2480  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.7 
 
 
380 aa  94.7  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388889  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2604  2-methylcitrate synthase  32.5 
 
 
374 aa  94.7  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.121252  hitchhiker  0.000290432 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0154  citrate synthase  27.5 
 
 
374 aa  94.7  3e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.649155 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1262  Citrate (Si)-synthase  28.96 
 
 
375 aa  94.7  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.71 
 
 
430 aa  94.4  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0953  methylcitrate synthase  35.79 
 
 
377 aa  94.4  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.6 
 
 
385 aa  94.4  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0834  Citrate (Si)-synthase  28.31 
 
 
377 aa  94  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.84 
 
 
382 aa  94  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02396  methylcitrate synthase  34.39 
 
 
380 aa  93.6  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10908  citrate synthase 2  29.43 
 
 
373 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0733  citrate synthase 2  29.14 
 
 
368 aa  93.2  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3826  methylcitrate synthase  28.23 
 
 
375 aa  92.8  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.55 
 
 
397 aa  92  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.772555 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>