More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1721 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1721  excisionase/Xis, DNA-binding  100 
 
 		 404 aa  818    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0483  DNA binding domain-containing protein  42.13 
 
 		 389 aa  276  5e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2580  regulatory protein MerR  38.27 
 
 		 425 aa  259  7e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0856  citrate synthase  32.84 
 
 		 406 aa  187  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7567  putative citrate synthase  34.47 
 
 		 407 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3240  DNA binding domain protein, excisionase family  35.29 
 
 		 410 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3564  DNA binding domain protein, excisionase family  34.89 
 
 		 410 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1148  citrate synthase  30.69 
 
 		 429 aa  143  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0705512  normal  0.385377 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2582  citrate synthase  33.81 
 
 		 410 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.11188  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2391  citrate synthase  32.67 
 
 		 391 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2452  citrate synthase  33.25 
 
 		 410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000202962 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0781  citrate synthase  34.62 
 
 		 545 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4145  citrate synthase  28.47 
 
 		 395 aa  130  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017146  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1922  citrate synthase  31.95 
 
 		 410 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.409228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2534  citrate synthase  31.95 
 
 		 410 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0988843  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4908  citrate synthase  31.53 
 
 		 397 aa  123  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0550  citrate synthase  31.72 
 
 		 414 aa  123  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0425635 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2558  citrate synthase  31.8 
 
 		 410 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.01047 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2556  citrate synthase  33.64 
 
 		 426 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4867  citrate synthase  33.58 
 
 		 385 aa  117  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0287319  normal  0.592181 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6374  citrate synthase  30.5 
 
 		 413 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.154136 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3184  Citrate synthase  32.09 
 
 		 413 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740532 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4951  citrate synthase  29.73 
 
 		 415 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3209  citrate synthase  29.73 
 
 		 415 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2102  citrate synthase  29.68 
 
 		 384 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6077  citrate synthase  29.78 
 
 		 413 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3955  citrate synthase  30.77 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.999666  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0845  citrate synthase  28.33 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.627781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4949  citrate synthase  31.83 
 
 		 382 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537298  normal  0.392134 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5753  Citrate synthase  29.06 
 
 		 384 aa  97.4  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.149777  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1008  citrate synthase  27.67 
 
 		 429 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1829  Citrate synthase  29.6 
 
 		 381 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.375812  hitchhiker  0.00523151 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4213  Citrate synthase  28.93 
 
 		 414 aa  94  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.425435 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1760  citrate synthase  26.11 
 
 		 374 aa  90.9  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2026  Citrate synthase  29.43 
 
 		 381 aa  90.5  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0761  citrate synthase  32.03 
 
 		 410 aa  88.6  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0771063  normal  0.040487 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2716  putative citrate synthase  27.01 
 
 		 418 aa  87.4  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000320245  normal  0.180168 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  24.4 
 
 		 382 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  24.13 
 
 		 382 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  24.4 
 
 		 371 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  24.4 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  24.4 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  24.4 
 
 		 371 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  24.4 
 
 		 371 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  24.4 
 
 		 371 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  24.4 
 
 		 371 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  27.37 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  24.4 
 
 		 371 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2245  citrate synthase  30.15 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3560  DNA binding domain protein, excisionase family  29.28 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0836216  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2135  citrate synthase family protein  33.04 
 
 		 453 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0555  citrate synthase family protein  33.04 
 
 		 453 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2258  citrate synthase family protein  33.04 
 
 		 501 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0946  citrate synthase family protein  33.04 
 
 		 450 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0942  citrate synthase family protein  33.04 
 
 		 450 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0679891  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1097  citrate synthase family protein  32.6 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.383469  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2319  methylcitrate synthase  23.46 
 
 		 386 aa  72.4  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.16364  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  29.69 
 
 		 380 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4948  citrate synthase 2  28.97 
 
 		 364 aa  70.5  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.257238  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3911  citrate synthase I  30.14 
 
 		 427 aa  69.3  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0061  citrate synthase  26.72 
 
 		 430 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0890712  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  26.2 
 
 		 378 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  23.32 
 
 		 386 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1347  methylcitrate synthase  25.56 
 
 		 389 aa  68.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3029  methylcitrate synthase  23.84 
 
 		 385 aa  67.8  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02719  methylcitrate synthase  23.4 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.966086  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0344  methylcitrate synthase  25.74 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3630  methylcitrate synthase  25.61 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  24.36 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0314  methylcitrate synthase  25.61 
 
 		 375 aa  67  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23220  methylcitrate synthase  22.73 
 
 		 387 aa  67  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3826  methylcitrate synthase  25.61 
 
 		 375 aa  67  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4085  citrate synthase I  27.83 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  25 
 
 		 372 aa  67  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1586  methylcitrate synthase  23.16 
 
 		 385 aa  67  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000154256  normal  0.49975 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  25.41 
 
 		 382 aa  66.6  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  24.6 
 
 		 375 aa  66.6  0.0000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0621  methylcitrate synthase  24.65 
 
 		 383 aa  66.2  0.0000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2081  methylcitrate synthase  23.1 
 
 		 404 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.847456  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2401  2-methylcitrate synthase  23.99 
 
 		 371 aa  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.612256  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1658  citrate synthase  25.41 
 
 		 373 aa  65.9  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.617148  normal  0.567466 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  23.71 
 
 		 372 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1809  methylcitrate synthase  23.45 
 
 		 384 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.507238  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3093  Citrate (Si)-synthase  24.93 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.832749 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2348  type II citrate synthase  24.88 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.729565  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0511  citrate synthase 2  26.9 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.043222  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3511  methylcitrate synthase  25.14 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.106101 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2900  methylcitrate synthase  22.97 
 
 		 395 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02396  methylcitrate synthase  24.02 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  24.26 
 
 		 382 aa  63.9  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5388  methylcitrate synthase  23.73 
 
 		 390 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4841  methylcitrate synthase  23.73 
 
 		 390 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.994856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0953  methylcitrate synthase  24.13 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6860  methylcitrate synthase  23.53 
 
 		 395 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632501  normal  0.17935 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0960  citrate synthase  26.09 
 
 		 427 aa  63.9  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003389  2-methylcitrate synthase  24.18 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2647  methylcitrate synthase  23.28 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  25.51 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0121  methylcitrate synthase  23.96 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4355  methylcitrate synthase  23.24 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>