More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3955 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3955  citrate synthase  100 
 
 		 386 aa  740    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.999666  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4867  citrate synthase  56.1 
 
 		 385 aa  342  1e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0287319  normal  0.592181 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0845  citrate synthase  45.29 
 
 		 390 aa  294  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.627781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4949  citrate synthase  51.84 
 
 		 382 aa  282  9e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537298  normal  0.392134 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6374  citrate synthase  45.93 
 
 		 413 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.154136 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1760  citrate synthase  44.74 
 
 		 374 aa  279  6e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6077  citrate synthase  45.14 
 
 		 413 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4951  citrate synthase  44.24 
 
 		 415 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3209  citrate synthase  44.24 
 
 		 415 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5753  Citrate synthase  45.93 
 
 		 384 aa  275  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.149777  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1829  Citrate synthase  47.07 
 
 		 381 aa  272  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.375812  hitchhiker  0.00523151 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4213  Citrate synthase  45 
 
 		 414 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.425435 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2391  citrate synthase  45.62 
 
 		 391 aa  261  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2102  citrate synthase  43.72 
 
 		 384 aa  257  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2026  Citrate synthase  47.06 
 
 		 381 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3240  DNA binding domain protein, excisionase family  43.07 
 
 		 410 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3564  DNA binding domain protein, excisionase family  42.71 
 
 		 410 aa  232  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1148  citrate synthase  41.77 
 
 		 429 aa  226  7e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0705512  normal  0.385377 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0856  citrate synthase  41.88 
 
 		 406 aa  225  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4908  citrate synthase  41.67 
 
 		 397 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0781  citrate synthase  41.94 
 
 		 545 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2452  citrate synthase  42.78 
 
 		 410 aa  215  9e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000202962 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2582  citrate synthase  42.28 
 
 		 410 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.11188  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0550  citrate synthase  40.41 
 
 		 414 aa  209  9e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0425635 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3184  Citrate synthase  42.04 
 
 		 413 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740532 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4145  citrate synthase  38.05 
 
 		 395 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017146  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7567  putative citrate synthase  39.53 
 
 		 407 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1922  citrate synthase  42.28 
 
 		 410 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.409228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2534  citrate synthase  42.28 
 
 		 410 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0988843  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2558  citrate synthase  42.03 
 
 		 410 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.01047 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2245  citrate synthase  44.92 
 
 		 402 aa  172  6.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2556  citrate synthase  41.18 
 
 		 426 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0555  citrate synthase family protein  51.17 
 
 		 453 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2135  citrate synthase family protein  51.17 
 
 		 453 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0942  citrate synthase family protein  51.17 
 
 		 450 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0679891  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0946  citrate synthase family protein  51.17 
 
 		 450 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2258  citrate synthase family protein  50.47 
 
 		 501 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1097  citrate synthase family protein  50 
 
 		 289 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.383469  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2716  putative citrate synthase  32.61 
 
 		 418 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000320245  normal  0.180168 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1008  citrate synthase  32.53 
 
 		 429 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0761  citrate synthase  49.77 
 
 		 410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0771063  normal  0.040487 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0483  DNA binding domain-containing protein  33.42 
 
 		 389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.41 
 
 		 373 aa  130  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3560  DNA binding domain protein, excisionase family  34.26 
 
 		 412 aa  130  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0836216  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  40.53 
 
 		 380 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  29.38 
 
 		 372 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10908  citrate synthase 2  44.62 
 
 		 373 aa  125  9e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  30.23 
 
 		 372 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2401  2-methylcitrate synthase  31.9 
 
 		 371 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.612256  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  37.82 
 
 		 373 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  28.9 
 
 		 382 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  29.18 
 
 		 371 aa  124  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  29.18 
 
 		 371 aa  124  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  28.9 
 
 		 382 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  29.18 
 
 		 371 aa  123  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  29.18 
 
 		 371 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  29.18 
 
 		 371 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  29.18 
 
 		 382 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  29.18 
 
 		 382 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  37 
 
 		 373 aa  123  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  29.83 
 
 		 386 aa  123  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  37 
 
 		 373 aa  123  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  29.58 
 
 		 371 aa  122  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  28.05 
 
 		 373 aa  122  9e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.88 
 
 		 382 aa  122  9e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0511  citrate synthase 2  35.63 
 
 		 368 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.043222  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5025  citrate synthase 2  44.09 
 
 		 371 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2141  Citrate (Si)-synthase  33.06 
 
 		 389 aa  119  7e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.636674  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3029  methylcitrate synthase  35.94 
 
 		 385 aa  119  7e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0247  citrate synthase 2  44.09 
 
 		 368 aa  119  9e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.32184  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.86 
 
 		 385 aa  119  9e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0647  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.21 
 
 		 367 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.029125  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0622  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.21 
 
 		 367 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0115525  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02719  methylcitrate synthase  36.7 
 
 		 384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.966086  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1035  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.43 
 
 		 375 aa  117  3e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.46 
 
 		 382 aa  117  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1016  Citrate (Si)-synthase  40.3 
 
 		 366 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.525155  hitchhiker  0.00235766 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.74 
 
 		 379 aa  116  5e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2580  regulatory protein MerR  31.4 
 
 		 425 aa  116  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  30.4 
 
 		 370 aa  116  7.999999999999999e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.59 
 
 		 382 aa  115  8.999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  36.6 
 
 		 374 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.48 
 
 		 378 aa  114  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1658  citrate synthase  30.17 
 
 		 373 aa  114  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.617148  normal  0.567466 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1262  Citrate (Si)-synthase  41.08 
 
 		 375 aa  114  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0715  citrate synthase  27.79 
 
 		 355 aa  113  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0463  methylcitrate synthase  33.33 
 
 		 389 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000165686  hitchhiker  0.000000131062 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0401  methylcitrate synthase  33.33 
 
 		 389 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.600733  hitchhiker  0.00000000076827 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2027  citrate synthase 2  43.43 
 
 		 362 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1487  2-methylcitrate synthase  35.18 
 
 		 372 aa  113  6e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0421  methylcitrate synthase  33.51 
 
 		 389 aa  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0258062 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4841  citrate synthase 2  34.02 
 
 		 376 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.169021 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0403  methylcitrate synthase  33.51 
 
 		 389 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4459  citrate synthase 2  33.72 
 
 		 376 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0409  methylcitrate synthase  33.51 
 
 		 389 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000027346 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4546  citrate synthase 2  33.72 
 
 		 376 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591553  normal  0.862054 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1496  2-methylcitrate synthase  35.18 
 
 		 372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0289  methylcitrate synthase  34.04 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0383  methylcitrate synthase  34.04 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679335  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0878  methylcitrate synthase  34.04 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>