More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2716 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2716  putative citrate synthase  100 
 
 		 418 aa  837    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000320245  normal  0.180168 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1008  citrate synthase  38.26 
 
 		 429 aa  249  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3240  DNA binding domain protein, excisionase family  35.58 
 
 		 410 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3564  DNA binding domain protein, excisionase family  34.29 
 
 		 410 aa  156  6e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0550  citrate synthase  32.71 
 
 		 414 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0425635 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2582  citrate synthase  33.33 
 
 		 410 aa  153  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.11188  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4867  citrate synthase  33.99 
 
 		 385 aa  152  8e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0287319  normal  0.592181 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2452  citrate synthase  32.72 
 
 		 410 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000202962 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4145  citrate synthase  30.17 
 
 		 395 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017146  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1148  citrate synthase  33.17 
 
 		 429 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0705512  normal  0.385377 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0856  citrate synthase  30.05 
 
 		 406 aa  145  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1922  citrate synthase  31.87 
 
 		 410 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.409228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2534  citrate synthase  31.87 
 
 		 410 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0988843  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2558  citrate synthase  31.64 
 
 		 410 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.01047 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2391  citrate synthase  32.05 
 
 		 391 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4908  citrate synthase  31.97 
 
 		 397 aa  135  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1829  Citrate synthase  33.58 
 
 		 381 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.375812  hitchhiker  0.00523151 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1760  citrate synthase  29.5 
 
 		 374 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7567  putative citrate synthase  31.18 
 
 		 407 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1097  citrate synthase family protein  40.4 
 
 		 289 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.383469  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0845  citrate synthase  29.9 
 
 		 390 aa  127  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.627781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2026  Citrate synthase  33.25 
 
 		 381 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2135  citrate synthase family protein  40.4 
 
 		 453 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2258  citrate synthase family protein  40.4 
 
 		 501 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0555  citrate synthase family protein  40.4 
 
 		 453 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0946  citrate synthase family protein  40.4 
 
 		 450 aa  127  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0942  citrate synthase family protein  40.4 
 
 		 450 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0679891  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2102  citrate synthase  32.23 
 
 		 384 aa  122  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4949  citrate synthase  31.76 
 
 		 382 aa  123  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537298  normal  0.392134 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4951  citrate synthase  28.61 
 
 		 415 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3209  citrate synthase  28.61 
 
 		 415 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5753  Citrate synthase  29.66 
 
 		 384 aa  120  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.149777  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6374  citrate synthase  28.71 
 
 		 413 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.154136 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0781  citrate synthase  40 
 
 		 545 aa  117  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6077  citrate synthase  28.19 
 
 		 413 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3184  Citrate synthase  38.95 
 
 		 413 aa  113  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740532 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4213  Citrate synthase  29.76 
 
 		 414 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.425435 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2556  citrate synthase  29.77 
 
 		 426 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  31.16 
 
 		 374 aa  107  4e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2081  methylcitrate synthase  26.88 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.847456  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23220  methylcitrate synthase  26.83 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2319  methylcitrate synthase  29.39 
 
 		 386 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.16364  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2401  2-methylcitrate synthase  27.51 
 
 		 371 aa  105  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.612256  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0483  DNA binding domain-containing protein  28.43 
 
 		 389 aa  103  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.1 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0866  methylcitrate synthase  27.73 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0621  methylcitrate synthase  25.4 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  30.23 
 
 		 373 aa  101  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2079  methylcitrate synthase  27.38 
 
 		 386 aa  100  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.340874  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2647  methylcitrate synthase  26.29 
 
 		 394 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  32.6 
 
 		 395 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2208  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.22 
 
 		 374 aa  100  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.539974  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1635  methylcitrate synthase  27.38 
 
 		 386 aa  100  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.169583 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.41 
 
 		 430 aa  100  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3029  methylcitrate synthase  25.88 
 
 		 385 aa  100  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  31.48 
 
 		 372 aa  100  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1347  methylcitrate synthase  26.79 
 
 		 389 aa  100  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0383  methylcitrate synthase  26.59 
 
 		 390 aa  100  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679335  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0878  methylcitrate synthase  26.59 
 
 		 390 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1869  methylcitrate synthase  26.59 
 
 		 390 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0289  methylcitrate synthase  26.59 
 
 		 390 aa  100  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1737  methylcitrate synthase  26.59 
 
 		 390 aa  100  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3511  methylcitrate synthase  26.49 
 
 		 390 aa  100  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.106101 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1165  methylcitrate synthase  26.59 
 
 		 390 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2142  methylcitrate synthase  26.59 
 
 		 390 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1809  methylcitrate synthase  24.19 
 
 		 384 aa  99  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.507238  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1586  methylcitrate synthase  27.38 
 
 		 385 aa  99  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000154256  normal  0.49975 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2245  citrate synthase  32.37 
 
 		 402 aa  99.4  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  30.7 
 
 		 372 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1508  methylcitrate synthase  28 
 
 		 386 aa  99.4  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  30.41 
 
 		 373 aa  98.6  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3288  methylcitrate synthase  25.78 
 
 		 390 aa  98.6  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.281405  normal  0.014196 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.8 
 
 		 377 aa  98.6  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2329  methylcitrate synthase  24.61 
 
 		 393 aa  99  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4790  methylcitrate synthase  29.07 
 
 		 385 aa  98.6  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal  0.159071 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5345  methylcitrate synthase  25.2 
 
 		 390 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.417928  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5516  methylcitrate synthase  25.2 
 
 		 390 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  30.41 
 
 		 373 aa  98.6  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4756  methylcitrate synthase  25.2 
 
 		 390 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.394349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1936  methylcitrate synthase  28.63 
 
 		 375 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686847  hitchhiker  0.000000858753 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3560  DNA binding domain protein, excisionase family  30.27 
 
 		 412 aa  97.8  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0836216  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0121  methylcitrate synthase  26.59 
 
 		 387 aa  97.4  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  30.88 
 
 		 382 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5862  methylcitrate synthase  27.06 
 
 		 398 aa  97.4  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  29.25 
 
 		 371 aa  97.4  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2112  2-methylcitrate synthase  27.57 
 
 		 374 aa  97.4  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2604  2-methylcitrate synthase  24.93 
 
 		 374 aa  97.4  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.121252  hitchhiker  0.000290432 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2188  methylcitrate synthase  25.79 
 
 		 390 aa  97.1  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  30.88 
 
 		 382 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02719  methylcitrate synthase  25.98 
 
 		 384 aa  97.1  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.966086  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1858  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.78 
 
 		 374 aa  97.1  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53950  methylcitrate synthase  30.09 
 
 		 375 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.282102  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2335  methylcitrate synthase  28.63 
 
 		 375 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218689  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  31.02 
 
 		 371 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  31.02 
 
 		 371 aa  97.1  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  31.02 
 
 		 382 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  31.02 
 
 		 371 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3435  methylcitrate synthase  28.63 
 
 		 375 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01089  normal  0.171025 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1035  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.48 
 
 		 375 aa  96.7  6e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  31.02 
 
 		 382 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>