More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4213 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4213  Citrate synthase  100 
 
 		 414 aa  831    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.425435 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4951  citrate synthase  73.73 
 
 		 415 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3209  citrate synthase  73.73 
 
 		 415 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6077  citrate synthase  74.09 
 
 		 413 aa  599  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6374  citrate synthase  73.61 
 
 		 413 aa  594  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.154136 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0845  citrate synthase  59.27 
 
 		 390 aa  448  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.627781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5753  Citrate synthase  60.95 
 
 		 384 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.149777  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1760  citrate synthase  58.18 
 
 		 374 aa  424  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4949  citrate synthase  45.79 
 
 		 382 aa  257  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537298  normal  0.392134 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1829  Citrate synthase  43.26 
 
 		 381 aa  257  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.375812  hitchhiker  0.00523151 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3955  citrate synthase  45 
 
 		 386 aa  256  7e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.999666  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2026  Citrate synthase  43.7 
 
 		 381 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2102  citrate synthase  42.78 
 
 		 384 aa  239  9e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4867  citrate synthase  41.58 
 
 		 385 aa  237  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0287319  normal  0.592181 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0856  citrate synthase  40 
 
 		 406 aa  232  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1148  citrate synthase  38.62 
 
 		 429 aa  229  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0705512  normal  0.385377 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2391  citrate synthase  40.62 
 
 		 391 aa  224  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4908  citrate synthase  38.3 
 
 		 397 aa  218  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0550  citrate synthase  38.37 
 
 		 414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0425635 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2452  citrate synthase  38.67 
 
 		 410 aa  199  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000202962 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2582  citrate synthase  38.92 
 
 		 410 aa  199  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.11188  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3240  DNA binding domain protein, excisionase family  37.5 
 
 		 410 aa  196  6e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3564  DNA binding domain protein, excisionase family  36.71 
 
 		 410 aa  196  9e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0781  citrate synthase  37.53 
 
 		 545 aa  190  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3184  Citrate synthase  37.53 
 
 		 413 aa  189  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740532 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7567  putative citrate synthase  35.52 
 
 		 407 aa  188  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2558  citrate synthase  37.13 
 
 		 410 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.01047 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1922  citrate synthase  36.88 
 
 		 410 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.409228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2534  citrate synthase  36.88 
 
 		 410 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0988843  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4145  citrate synthase  31.97 
 
 		 395 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017146  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0761  citrate synthase  37.99 
 
 		 410 aa  166  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0771063  normal  0.040487 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2556  citrate synthase  37.23 
 
 		 426 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2245  citrate synthase  37.78 
 
 		 402 aa  154  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1008  citrate synthase  31.8 
 
 		 429 aa  150  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2135  citrate synthase family protein  45.54 
 
 		 453 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2258  citrate synthase family protein  45.54 
 
 		 501 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0946  citrate synthase family protein  45.54 
 
 		 450 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0555  citrate synthase family protein  45.54 
 
 		 453 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0942  citrate synthase family protein  45.07 
 
 		 450 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0679891  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1097  citrate synthase family protein  45.07 
 
 		 289 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.383469  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0647  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.91 
 
 		 367 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.029125  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0483  DNA binding domain-containing protein  30.03 
 
 		 389 aa  129  8.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0622  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.91 
 
 		 367 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0115525  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2716  putative citrate synthase  29.76 
 
 		 418 aa  124  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000320245  normal  0.180168 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  25.65 
 
 		 373 aa  116  7.999999999999999e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  29.17 
 
 		 374 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  25 
 
 		 373 aa  110  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  25 
 
 		 373 aa  110  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  27.87 
 
 		 372 aa  102  9e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0715  citrate synthase  31.94 
 
 		 355 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  27.03 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  26.38 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  27.33 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  26.73 
 
 		 371 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  26.73 
 
 		 371 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  26.73 
 
 		 371 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  26.73 
 
 		 382 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2580  regulatory protein MerR  29.37 
 
 		 425 aa  102  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  26.73 
 
 		 371 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  27.68 
 
 		 371 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  26.73 
 
 		 382 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3093  Citrate (Si)-synthase  29.12 
 
 		 378 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.832749 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  26.73 
 
 		 382 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  29.36 
 
 		 375 aa  102  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  26.73 
 
 		 371 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2103  citrate synthase 2  36.46 
 
 		 364 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3748  Citrate (Si)-synthase  37.3 
 
 		 388 aa  100  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  27.17 
 
 		 372 aa  100  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.21 
 
 		 385 aa  99  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0247  citrate synthase 2  35.5 
 
 		 368 aa  99  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.32184  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  25.45 
 
 		 370 aa  98.6  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.3 
 
 		 379 aa  98.2  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3560  DNA binding domain protein, excisionase family  39.88 
 
 		 412 aa  97.4  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0836216  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3561  Citrate (Si)-synthase  32.29 
 
 		 387 aa  96.3  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141515  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1721  excisionase/Xis, DNA-binding  28.93 
 
 		 404 aa  95.9  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  26.83 
 
 		 377 aa  94.7  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2111  citrate synthase 3  27.73 
 
 		 372 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0857  citrate (Si)-synthase  33.5 
 
 		 390 aa  94.7  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.65 
 
 		 382 aa  94.7  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2156  citrate synthase 3  27.43 
 
 		 373 aa  94  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  30.93 
 
 		 373 aa  93.6  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.12 
 
 		 382 aa  93.2  7e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2188  citrate synthase 3  27.14 
 
 		 372 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.685723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2125  citrate synthase 3  27.14 
 
 		 372 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.306637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2348  citrate synthase 3  27.14 
 
 		 372 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  33.5 
 
 		 387 aa  91.3  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3010  citrate synthase 3  27.14 
 
 		 373 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2450  citrate synthase 3  27.14 
 
 		 373 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0697754  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0154  citrate synthase  26.29 
 
 		 374 aa  90.9  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.649155 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.18 
 
 		 382 aa  90.9  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  25.85 
 
 		 381 aa  90.9  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.91 
 
 		 373 aa  90.9  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2367  citrate synthase 3  26.84 
 
 		 373 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0350  citrate synthase  25.71 
 
 		 391 aa  90.5  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2480  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.09 
 
 		 380 aa  90.1  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388889  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2315  citrate synthase 3  27.14 
 
 		 373 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  31.31 
 
 		 381 aa  90.1  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  28.35 
 
 		 378 aa  89.7  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  25.85 
 
 		 381 aa  89.7  8e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0511  citrate synthase 2  30.43 
 
 		 368 aa  89.7  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.043222  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>