More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2026 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2026  Citrate synthase  100 
 
 		 381 aa  749    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1829  Citrate synthase  89.39 
 
 		 381 aa  634    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.375812  hitchhiker  0.00523151 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2102  citrate synthase  53.91 
 
 		 384 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1760  citrate synthase  46.09 
 
 		 374 aa  298  9e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5753  Citrate synthase  46.09 
 
 		 384 aa  282  8.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.149777  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0845  citrate synthase  42.53 
 
 		 390 aa  278  9e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.627781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4867  citrate synthase  48.25 
 
 		 385 aa  276  4e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0287319  normal  0.592181 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4949  citrate synthase  50.13 
 
 		 382 aa  275  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537298  normal  0.392134 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3955  citrate synthase  47.45 
 
 		 386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.999666  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4951  citrate synthase  42.86 
 
 		 415 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3209  citrate synthase  42.86 
 
 		 415 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2391  citrate synthase  45.66 
 
 		 391 aa  269  7e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6077  citrate synthase  42.45 
 
 		 413 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4213  Citrate synthase  44.01 
 
 		 414 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.425435 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6374  citrate synthase  41.65 
 
 		 413 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.154136 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1148  citrate synthase  42.56 
 
 		 429 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0705512  normal  0.385377 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3240  DNA binding domain protein, excisionase family  42.68 
 
 		 410 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3564  DNA binding domain protein, excisionase family  41.71 
 
 		 410 aa  230  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0856  citrate synthase  39.9 
 
 		 406 aa  219  6e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7567  putative citrate synthase  39.75 
 
 		 407 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2582  citrate synthase  43.14 
 
 		 410 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.11188  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4908  citrate synthase  41.65 
 
 		 397 aa  213  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0781  citrate synthase  40.94 
 
 		 545 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2452  citrate synthase  41.91 
 
 		 410 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000202962 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0550  citrate synthase  39.16 
 
 		 414 aa  210  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0425635 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1922  citrate synthase  41.18 
 
 		 410 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.409228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2534  citrate synthase  41.18 
 
 		 410 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0988843  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2558  citrate synthase  40.93 
 
 		 410 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.01047 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3184  Citrate synthase  40.3 
 
 		 413 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740532 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4145  citrate synthase  35.49 
 
 		 395 aa  197  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017146  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2245  citrate synthase  43.72 
 
 		 402 aa  196  4.0000000000000005e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0761  citrate synthase  40.15 
 
 		 410 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0771063  normal  0.040487 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2556  citrate synthase  39.15 
 
 		 426 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1008  citrate synthase  31.67 
 
 		 429 aa  155  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2716  putative citrate synthase  33.25 
 
 		 418 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000320245  normal  0.180168 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  32.09 
 
 		 372 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0555  citrate synthase family protein  42.2 
 
 		 453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2135  citrate synthase family protein  42.2 
 
 		 453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0942  citrate synthase family protein  42.2 
 
 		 450 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0679891  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2258  citrate synthase family protein  42.2 
 
 		 501 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0946  citrate synthase family protein  42.2 
 
 		 450 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1097  citrate synthase family protein  43.26 
 
 		 289 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.383469  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0483  DNA binding domain-containing protein  31.16 
 
 		 389 aa  130  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  31.23 
 
 		 372 aa  126  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0647  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.89 
 
 		 367 aa  126  6e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.029125  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0622  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.89 
 
 		 367 aa  126  6e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0115525  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  28.98 
 
 		 382 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  28.98 
 
 		 382 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  28.98 
 
 		 371 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  28.98 
 
 		 371 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  28.98 
 
 		 371 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  28.98 
 
 		 382 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  28.98 
 
 		 382 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  28.98 
 
 		 371 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2580  regulatory protein MerR  29.75 
 
 		 425 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  28.98 
 
 		 371 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  28.98 
 
 		 371 aa  121  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  28.49 
 
 		 373 aa  120  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  28.49 
 
 		 373 aa  120  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.73 
 
 		 382 aa  119  7.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2401  2-methylcitrate synthase  37.44 
 
 		 371 aa  118  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.612256  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  39.38 
 
 		 380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  29.11 
 
 		 386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0715  citrate synthase  37.44 
 
 		 355 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.62 
 
 		 378 aa  115  8.999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.15 
 
 		 377 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.17 
 
 		 373 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.96 
 
 		 382 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4948  citrate synthase 2  41.15 
 
 		 364 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.257238  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  30.56 
 
 		 395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7568  citrate synthase 2  33.62 
 
 		 362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.708852 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2103  citrate synthase 2  37.68 
 
 		 364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  27.37 
 
 		 374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  32.11 
 
 		 373 aa  110  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.14 
 
 		 385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  29.41 
 
 		 381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  29.41 
 
 		 381 aa  110  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  37.1 
 
 		 373 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  28.49 
 
 		 370 aa  109  8.000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0857  citrate (Si)-synthase  39.04 
 
 		 390 aa  109  8.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  30.08 
 
 		 381 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  29.41 
 
 		 381 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.06 
 
 		 379 aa  109  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1830  citrate synthase 2  39.29 
 
 		 362 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.011311 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2027  citrate synthase 2  40.51 
 
 		 362 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.05 
 
 		 397 aa  107  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3748  Citrate (Si)-synthase  40.7 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.94 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  28.65 
 
 		 375 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3561  Citrate (Si)-synthase  34.48 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141515  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3560  DNA binding domain protein, excisionase family  43.71 
 
 		 412 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0836216  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  28.37 
 
 		 375 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.74 
 
 		 430 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0350  citrate synthase  30.43 
 
 		 391 aa  104  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1176  2-methylcitrate synthase  36.27 
 
 		 372 aa  104  3e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.831059  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003389  2-methylcitrate synthase  35.45 
 
 		 380 aa  104  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0820  2-methylcitrate synthase  36.27 
 
 		 372 aa  104  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1496  2-methylcitrate synthase  36.55 
 
 		 372 aa  103  5e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  29.78 
 
 		 378 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1721  excisionase/Xis, DNA-binding  30.42 
 
 		 404 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178266  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>