More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2245 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2245  citrate synthase  100 
 
 		 402 aa  757    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7567  putative citrate synthase  43.52 
 
 		 407 aa  246  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4145  citrate synthase  40.8 
 
 		 395 aa  237  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017146  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2391  citrate synthase  42.96 
 
 		 391 aa  237  3e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0856  citrate synthase  41.63 
 
 		 406 aa  234  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2102  citrate synthase  42.61 
 
 		 384 aa  233  5e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1829  Citrate synthase  43.94 
 
 		 381 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.375812  hitchhiker  0.00523151 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4908  citrate synthase  45.05 
 
 		 397 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2556  citrate synthase  47.34 
 
 		 426 aa  223  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0550  citrate synthase  41.98 
 
 		 414 aa  223  6e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0425635 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2026  Citrate synthase  44.47 
 
 		 381 aa  219  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4867  citrate synthase  43.8 
 
 		 385 aa  216  7e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0287319  normal  0.592181 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3955  citrate synthase  43.99 
 
 		 386 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.999666  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2452  citrate synthase  42.55 
 
 		 410 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000202962 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3564  DNA binding domain protein, excisionase family  41.83 
 
 		 410 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2582  citrate synthase  42.32 
 
 		 410 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.11188  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1148  citrate synthase  41.81 
 
 		 429 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0705512  normal  0.385377 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4951  citrate synthase  39.35 
 
 		 415 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3209  citrate synthase  39.35 
 
 		 415 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0781  citrate synthase  40.95 
 
 		 545 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3240  DNA binding domain protein, excisionase family  40.69 
 
 		 410 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0845  citrate synthase  39.11 
 
 		 390 aa  206  7e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.627781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6374  citrate synthase  39.01 
 
 		 413 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.154136 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3184  Citrate synthase  41.29 
 
 		 413 aa  204  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740532 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5753  Citrate synthase  39.41 
 
 		 384 aa  203  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.149777  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1760  citrate synthase  39.65 
 
 		 374 aa  202  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6077  citrate synthase  38.77 
 
 		 413 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1922  citrate synthase  42.22 
 
 		 410 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.409228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2534  citrate synthase  42.22 
 
 		 410 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0988843  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2558  citrate synthase  41.98 
 
 		 410 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.01047 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4213  Citrate synthase  38.54 
 
 		 414 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.425435 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4949  citrate synthase  43.22 
 
 		 382 aa  188  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537298  normal  0.392134 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0761  citrate synthase  42.82 
 
 		 410 aa  180  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0771063  normal  0.040487 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0483  DNA binding domain-containing protein  34.24 
 
 		 389 aa  153  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  29.34 
 
 		 374 aa  145  1e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2716  putative citrate synthase  32.37 
 
 		 418 aa  140  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000320245  normal  0.180168 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  30.52 
 
 		 373 aa  139  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  30.64 
 
 		 371 aa  139  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  30.52 
 
 		 373 aa  139  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  30.7 
 
 		 386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  31.12 
 
 		 371 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  31.12 
 
 		 371 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  31.12 
 
 		 382 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  31.12 
 
 		 382 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  31.12 
 
 		 371 aa  135  9e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  31.12 
 
 		 371 aa  135  9e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  31.12 
 
 		 371 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2258  citrate synthase family protein  45.54 
 
 		 501 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  30.35 
 
 		 382 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  30.35 
 
 		 382 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2135  citrate synthase family protein  45.54 
 
 		 453 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0555  citrate synthase family protein  45.54 
 
 		 453 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0946  citrate synthase family protein  45.54 
 
 		 450 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  28.81 
 
 		 373 aa  133  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0942  citrate synthase family protein  45.54 
 
 		 450 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0679891  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1008  citrate synthase  29.72 
 
 		 429 aa  133  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1097  citrate synthase family protein  45.21 
 
 		 289 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.383469  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  31.48 
 
 		 372 aa  131  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  30.97 
 
 		 372 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.97 
 
 		 379 aa  129  9.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0647  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.75 
 
 		 367 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.029125  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0622  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.75 
 
 		 367 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0115525  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5388  methylcitrate synthase  29.61 
 
 		 390 aa  127  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4841  methylcitrate synthase  29.61 
 
 		 390 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.994856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0866  methylcitrate synthase  30.47 
 
 		 391 aa  125  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4756  methylcitrate synthase  29.83 
 
 		 390 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.394349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5345  methylcitrate synthase  29.61 
 
 		 390 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.417928  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5516  methylcitrate synthase  29.61 
 
 		 390 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2401  2-methylcitrate synthase  32 
 
 		 371 aa  124  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.612256  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23220  methylcitrate synthase  30.51 
 
 		 387 aa  123  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.82 
 
 		 382 aa  123  5e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00287  2-methylcitrate synthase  30.73 
 
 		 389 aa  122  8e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0398  methylcitrate synthase  30.73 
 
 		 389 aa  122  8e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0404  methylcitrate synthase  30.73 
 
 		 389 aa  122  8e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0357  methylcitrate synthase  30.73 
 
 		 389 aa  122  8e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.9 
 
 		 377 aa  122  8e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00291  hypothetical protein  30.73 
 
 		 389 aa  122  8e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1635  methylcitrate synthase  31.1 
 
 		 386 aa  122  8e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.169583 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0142  methylcitrate synthase  29.33 
 
 		 390 aa  122  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482229  normal  0.590891 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0364  methylcitrate synthase  30.73 
 
 		 389 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3273  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.45 
 
 		 389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3292  methylcitrate synthase  30.45 
 
 		 389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3747  Citrate synthase  34.16 
 
 		 454 aa  121  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.88792 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3511  methylcitrate synthase  33.14 
 
 		 390 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.106101 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1347  methylcitrate synthase  31.43 
 
 		 389 aa  120  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2079  methylcitrate synthase  30.81 
 
 		 386 aa  119  7e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.340874  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3288  methylcitrate synthase  29.05 
 
 		 390 aa  119  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.281405  normal  0.014196 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2604  2-methylcitrate synthase  30.48 
 
 		 374 aa  119  7.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.121252  hitchhiker  0.000290432 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0463  methylcitrate synthase  30.28 
 
 		 389 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000165686  hitchhiker  0.000000131062 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2647  methylcitrate synthase  33.81 
 
 		 394 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0401  methylcitrate synthase  30.28 
 
 		 389 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.600733  hitchhiker  0.00000000076827 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0409  methylcitrate synthase  30.28 
 
 		 389 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000027346 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0403  methylcitrate synthase  30.28 
 
 		 389 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0421  methylcitrate synthase  30.28 
 
 		 389 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0258062 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1508  methylcitrate synthase  31.2 
 
 		 386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2188  methylcitrate synthase  29.83 
 
 		 390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0289  methylcitrate synthase  29.61 
 
 		 390 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4790  methylcitrate synthase  33.33 
 
 		 385 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal  0.159071 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0878  methylcitrate synthase  29.61 
 
 		 390 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0383  methylcitrate synthase  29.61 
 
 		 390 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>