More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6702 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6702  citrate synthase  100 
 
 
390 aa  749    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3155  citrate synthase-related protein  35.29 
 
 
383 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0125  citrate synthase-related protein  35.29 
 
 
383 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1463  citrate synthase-related protein  35.29 
 
 
383 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0704  hypothetical protein  35.29 
 
 
383 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0982036  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0520  citrate synthase-related protein  35.29 
 
 
383 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.455647  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2891  citrate synthase-related protein  35.29 
 
 
383 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0538  citrate synthase-related protein  35.29 
 
 
383 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0221269  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7426  citrate synthase-like  32.67 
 
 
412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0339716  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6017  citrate synthase-like protein  33.66 
 
 
416 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.03442  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5652  citrate synthase-like  33.66 
 
 
416 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6135  citrate synthase-like protein  32.6 
 
 
416 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.822109  normal  0.0240059 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6508  citrate synthase-like protein  32.92 
 
 
414 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.1 
 
 
379 aa  94  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  26.6 
 
 
382 aa  91.3  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.57 
 
 
378 aa  90.9  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.58 
 
 
382 aa  88.6  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.72 
 
 
382 aa  87  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0154  citrate synthase  26.52 
 
 
374 aa  82  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.649155 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.57 
 
 
373 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  30.74 
 
 
373 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2105  citrate (Si)-synthase  28.99 
 
 
397 aa  77.8  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414267  normal  0.0115455 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1379  citrate synthase  28.57 
 
 
257 aa  77  0.0000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1035  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  26.45 
 
 
375 aa  77  0.0000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1724  citrate synthase 3  22.16 
 
 
372 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.992858  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2539  Citrate (Si)-synthase  26.94 
 
 
374 aa  75.9  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.64966  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2315  citrate synthase 3  21.61 
 
 
373 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2367  citrate synthase 3  21.33 
 
 
373 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3010  citrate synthase 3  21.61 
 
 
373 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2450  citrate synthase 3  21.61 
 
 
373 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0697754  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2111  citrate synthase 3  21.33 
 
 
372 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2156  citrate synthase 3  21.61 
 
 
373 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1063  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.01 
 
 
393 aa  73.9  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2188  citrate synthase 3  21.33 
 
 
372 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.685723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2125  citrate synthase 3  21.33 
 
 
372 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.306637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2348  citrate synthase 3  21.33 
 
 
372 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  24.07 
 
 
374 aa  73.6  0.000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.51 
 
 
385 aa  72.4  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2022  citrate synthase  34.34 
 
 
267 aa  72.4  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.275146  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2401  2-methylcitrate synthase  22.95 
 
 
371 aa  72.8  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.612256  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3630  methylcitrate synthase  24.72 
 
 
375 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3826  methylcitrate synthase  24.72 
 
 
375 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2376  citrate synthase 3  25.31 
 
 
372 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.151245  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1039  citrate synthase  27.6 
 
 
255 aa  70.9  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0314  methylcitrate synthase  24.44 
 
 
375 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4048  methylcitrate synthase  24.72 
 
 
375 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  28.45 
 
 
378 aa  70.1  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  23.93 
 
 
387 aa  69.3  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  24.86 
 
 
377 aa  68.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.57 
 
 
378 aa  68.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4141  methylcitrate synthase  24.72 
 
 
379 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3946  methylcitrate synthase  24.72 
 
 
375 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3645  methylcitrate synthase  24.44 
 
 
375 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4022  methylcitrate synthase  24.72 
 
 
375 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0344  methylcitrate synthase  24.16 
 
 
375 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1347  methylcitrate synthase  25.64 
 
 
389 aa  68.2  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26517  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0100  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  25.69 
 
 
377 aa  68.2  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3295  methylcitrate synthase  27.9 
 
 
378 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0350  citrate synthase  25.56 
 
 
391 aa  66.6  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0621  methylcitrate synthase  26.29 
 
 
383 aa  66.2  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0072  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  25.94 
 
 
372 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1420  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  26.18 
 
 
374 aa  66.2  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  25 
 
 
386 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  28.57 
 
 
382 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1508  methylcitrate synthase  27.03 
 
 
386 aa  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  28.57 
 
 
371 aa  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  24.44 
 
 
380 aa  65.5  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1821  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.35 
 
 
374 aa  65.1  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2321  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  25.86 
 
 
384 aa  65.1  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2420  2-methylcitrate synthase  26.56 
 
 
375 aa  65.1  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0822163  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0798  citrate synthase 3  23.84 
 
 
370 aa  65.5  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.036744  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  28.08 
 
 
371 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1071  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  24.93 
 
 
373 aa  64.7  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.66322  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  28.08 
 
 
382 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  28.08 
 
 
371 aa  64.3  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  28.08 
 
 
371 aa  64.3  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  28.08 
 
 
371 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  26.73 
 
 
372 aa  63.9  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4723  methylcitrate synthase  25.86 
 
 
375 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  28.08 
 
 
371 aa  64.3  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  28.08 
 
 
382 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1665  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  26.18 
 
 
374 aa  63.9  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  28.08 
 
 
382 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1858  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  26.18 
 
 
374 aa  63.9  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0447  Citrate synthase-like protein  28.02 
 
 
240 aa  63.5  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000621018  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  24.56 
 
 
397 aa  63.5  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  23.75 
 
 
380 aa  63.5  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1868  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  24.89 
 
 
376 aa  63.5  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.650369  normal  0.135048 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2821  putative 2-methylcitrate synthase  26.18 
 
 
374 aa  63.2  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.702751  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53950  methylcitrate synthase  25.43 
 
 
375 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.282102  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3974  methylcitrate synthase  27.78 
 
 
389 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0651061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6150  Citrate (Si)-synthase  31.86 
 
 
391 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.153659 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23220  methylcitrate synthase  25.52 
 
 
387 aa  62.4  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3860  methylcitrate synthase  27.78 
 
 
389 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0121  methylcitrate synthase  28.33 
 
 
387 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0820  2-methylcitrate synthase  30.08 
 
 
372 aa  61.6  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0404  methylcitrate synthase  25.34 
 
 
389 aa  62  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1487  2-methylcitrate synthase  23.4 
 
 
372 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3564  DNA binding domain protein, excisionase family  35.29 
 
 
410 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0364  methylcitrate synthase  25.34 
 
 
389 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>