162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_0538 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA3155  citrate synthase-related protein  99.74 
 
 		 383 aa  751    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0704  hypothetical protein  99.74 
 
 		 383 aa  751    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0982036  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0125  citrate synthase-related protein  99.74 
 
 		 383 aa  751    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1463  citrate synthase-related protein  99.74 
 
 		 383 aa  751    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0520  citrate synthase-related protein  99.74 
 
 		 383 aa  751    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.455647  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0538  citrate synthase-related protein  100 
 
 		 383 aa  753    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0221269  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2891  citrate synthase-related protein  99.74 
 
 		 383 aa  751    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7426  citrate synthase-like  55.05 
 
 		 412 aa  347  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0339716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6135  citrate synthase-like protein  56.68 
 
 		 416 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.822109  normal  0.0240059 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6508  citrate synthase-like protein  54.04 
 
 		 414 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5652  citrate synthase-like  54.77 
 
 		 416 aa  316  5e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6017  citrate synthase-like protein  54.77 
 
 		 416 aa  316  5e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.03442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6702  citrate synthase  34.04 
 
 		 390 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1039  citrate synthase  30.36 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3867  citrate synthase  31.16 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6294  citrate synthase  33.85 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4677  citrate synthase  31.12 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  23.48 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  26.26 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1194  citrate synthase  32.34 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7568  citrate synthase 2  29.27 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.708852 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1379  citrate synthase  26.77 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3029  methylcitrate synthase  24.09 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4959  citrate synthase  31.12 
 
 		 282 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2009  citrate synthase  32 
 
 		 261 aa  62  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.884105 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8311  citrate synthase  29.89 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173148  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4013  citrate synthase  30.06 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  23.63 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4946  citrate synthase  29.9 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.094047  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1586  methylcitrate synthase  24.86 
 
 		 385 aa  59.7  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000154256  normal  0.49975 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2022  citrate synthase  32.99 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.275146  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2557  citrate synthase  26.47 
 
 		 391 aa  59.3  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2081  methylcitrate synthase  24.09 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.847456  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4144  citrate synthase  29.89 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00479182  normal  0.482128 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  21.57 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  21.57 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  21.57 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  21.57 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  21.57 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  21.57 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  21.57 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  25.75 
 
 		 379 aa  56.2  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0121  methylcitrate synthase  24.65 
 
 		 387 aa  55.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4268  citrate synthase  30.96 
 
 		 265 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.245417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4153  citrate synthase  29.48 
 
 		 284 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.595412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3974  methylcitrate synthase  24.65 
 
 		 389 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0651061 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3860  methylcitrate synthase  24.65 
 
 		 389 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4041  citrate synthase  29.48 
 
 		 284 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6318  citrate synthase  27.64 
 
 		 249 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  21.28 
 
 		 382 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1658  citrate synthase  26.05 
 
 		 373 aa  55.1  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.617148  normal  0.567466 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1130  citrate synthase I  25.3 
 
 		 431 aa  55.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.684999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  21.57 
 
 		 386 aa  55.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0856  citrate synthase  32.02 
 
 		 406 aa  54.3  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  21.28 
 
 		 382 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  25 
 
 		 379 aa  54.3  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  21.28 
 
 		 371 aa  54.3  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1809  methylcitrate synthase  24.58 
 
 		 384 aa  53.9  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.507238  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2811  citrate synthase  24.09 
 
 		 427 aa  53.9  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0195056  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6860  methylcitrate synthase  23.8 
 
 		 395 aa  53.9  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632501  normal  0.17935 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2531  citrate synthase I  24.23 
 
 		 428 aa  53.1  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000235775 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23220  methylcitrate synthase  23.81 
 
 		 387 aa  52.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  25.21 
 
 		 395 aa  52.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0281  citrate synthase  23.69 
 
 		 378 aa  52  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.160338  normal  0.143922 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2224  citrate synthase I  24.86 
 
 		 425 aa  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2900  methylcitrate synthase  22.95 
 
 		 395 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0621  methylcitrate synthase  26.53 
 
 		 383 aa  51.2  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0404  methylcitrate synthase  25.73 
 
 		 389 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6081  methylcitrate synthase  23.51 
 
 		 389 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.662054 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2329  methylcitrate synthase  24.6 
 
 		 393 aa  50.8  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2302  methylcitrate synthase  23.51 
 
 		 389 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.459531  normal  0.256502 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0803  citrate synthase I  29.65 
 
 		 440 aa  50.8  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.558205 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0447  Citrate synthase-like protein  30.16 
 
 		 240 aa  50.8  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000621018  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0364  methylcitrate synthase  25.15 
 
 		 389 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0100  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  23.9 
 
 		 377 aa  50.8  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  22.33 
 
 		 380 aa  50.8  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.7 
 
 		 382 aa  50.8  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2728  citrate synthase  29.78 
 
 		 255 aa  50.4  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0357  methylcitrate synthase  25.15 
 
 		 389 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0999  citrate synthase I  25 
 
 		 438 aa  50.4  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  25.36 
 
 		 373 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00287  2-methylcitrate synthase  25.15 
 
 		 389 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3273  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  25.15 
 
 		 389 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1035  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  24.6 
 
 		 375 aa  50.4  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3093  Citrate (Si)-synthase  27.3 
 
 		 378 aa  50.1  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.832749 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0398  methylcitrate synthase  25.15 
 
 		 389 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3292  methylcitrate synthase  25.15 
 
 		 389 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00291  hypothetical protein  25.15 
 
 		 389 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1063  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  24.73 
 
 		 393 aa  50.1  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1140  citrate synthase I  28.19 
 
 		 441 aa  49.7  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3119  citrate synthase  29.44 
 
 		 254 aa  49.7  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  24.86 
 
 		 378 aa  49.7  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2450  type II citrate synthase  28.64 
 
 		 434 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0403  methylcitrate synthase  25.15 
 
 		 389 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0421  methylcitrate synthase  25.15 
 
 		 389 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0258062 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0409  methylcitrate synthase  25.15 
 
 		 389 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000027346 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5653  citrate synthase  32.41 
 
 		 268 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0675936  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0463  methylcitrate synthase  25.15 
 
 		 389 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000165686  hitchhiker  0.000000131062 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1964  citrate synthase I  25.37 
 
 		 427 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148224  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  23.91 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>