More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0864 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0864  peptidase M16 domain protein  100 
 
 
462 aa  903    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06880  predicted Zn-dependent peptidase  62.09 
 
 
462 aa  540  9.999999999999999e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.408528  normal  0.0872557 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1583  peptidase M16 domain protein  53.17 
 
 
453 aa  420  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.115865  normal  0.227723 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4237  peptidase M16 domain protein  49.89 
 
 
451 aa  366  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110006  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3795  peptidase M16-like  48.58 
 
 
448 aa  358  8e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.417189  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4127  peptidase M16 domain-containing protein  48.77 
 
 
447 aa  352  5.9999999999999994e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1776  peptidase M16 domain-containing protein  46.65 
 
 
438 aa  348  9e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0932  peptidase M16 domain-containing protein  45.58 
 
 
455 aa  340  2.9999999999999998e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513926  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3746  peptidase M16 domain-containing protein  47.95 
 
 
447 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0082  peptidase M16 domain-containing protein  31.62 
 
 
477 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.281002 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0091  peptidase M16 domain protein  29.31 
 
 
767 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1994  peptidase M16 domain protein  30.99 
 
 
439 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1866  peptidase M16-like  30.52 
 
 
439 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2079  peptidase M16 domain protein  30.75 
 
 
439 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3485  peptidase M16-like protein  24.76 
 
 
502 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.320343  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  27.91 
 
 
947 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  26.74 
 
 
921 aa  137  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0089  insulinase family protease/insulinase family protease  25.53 
 
 
952 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0109  peptidase M16 domain protein  25.12 
 
 
456 aa  135  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03487  peptidase  26.51 
 
 
947 aa  133  7.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3492  peptidase M16 domain-containing protein  24.12 
 
 
477 aa  133  9e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0642  exported pepdidase, putative zinc protease  26.65 
 
 
950 aa  130  6e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  30.19 
 
 
896 aa  130  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0210  peptidase M16 domain protein  24.18 
 
 
497 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.481547 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4079  M16 family metallopeptidase  26.42 
 
 
959 aa  127  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3741  peptidase M16 domain-containing protein  24.16 
 
 
486 aa  127  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3814  peptidase M16 domain-containing protein  24.4 
 
 
487 aa  127  5e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3939  DNA-directed RNA polymerase  24.16 
 
 
487 aa  127  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01173  Peptidase, M16 family protein  25.06 
 
 
930 aa  126  8.000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0120262  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0165  peptidase M16 domain protein  28.1 
 
 
949 aa  126  8.000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3528  peptidase M16 domain protein  28.82 
 
 
949 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146206  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3464  peptidase M16 domain protein  28.82 
 
 
929 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.694105  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3381  peptidase M16-like  29.05 
 
 
947 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.529886  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4129  peptidase M16 domain-containing protein  24.03 
 
 
492 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0208  peptidase M16 domain-containing protein  24.03 
 
 
487 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4255  peptidase M16 domain-containing protein  24.03 
 
 
492 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1973  peptidase M16 domain-containing protein  28.81 
 
 
439 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333258  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3947  peptidase M16 domain-containing protein  23.15 
 
 
481 aa  124  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4170  peptidase M16 domain protein  25.87 
 
 
969 aa  124  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.732695 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02700  putative metallopeptidase, M16 family protein  26.14 
 
 
687 aa  123  6e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0304  peptidase M16 domain-containing protein  23.39 
 
 
483 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  26.28 
 
 
943 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3229  peptidase M16 domain-containing protein  26.09 
 
 
449 aa  120  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3443  peptidase M16-like protein  23.68 
 
 
473 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0621  peptidase M16-like  24.26 
 
 
725 aa  119  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  25.47 
 
 
954 aa  119  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0497  peptidase M16 domain protein  27.32 
 
 
471 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0152628  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1035  peptidase M16 domain-containing protein  26.06 
 
 
944 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3580  peptidase M16 domain-containing protein  23.63 
 
 
482 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5951  peptidase M16 domain protein  27.16 
 
 
426 aa  116  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  24.38 
 
 
945 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1590  peptidase M16 domain protein  22.85 
 
 
424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.508475  normal  0.157035 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3161  peptidase M16 domain-containing protein  29.97 
 
 
949 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3630  peptidase M16 domain-containing protein  25 
 
 
474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120244  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1069  peptidase M16 domain-containing protein  28.57 
 
 
435 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.421262  hitchhiker  0.00357472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2133  peptidase M16 domain protein  32.18 
 
 
436 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.765752 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4177  peptidase M16 domain-containing protein  27.48 
 
 
486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.733027  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  27.43 
 
 
876 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3327  peptidase M16 domain-containing protein  27.48 
 
 
944 aa  114  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1057  M16 family peptidase  26.42 
 
 
945 aa  114  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.867585 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2981  peptidase M16 domain-containing protein  29.68 
 
 
949 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2529  peptidase M16-like  24.38 
 
 
479 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657024 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1235  processing peptidase  24.82 
 
 
418 aa  114  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1328  peptidase M16 domain-containing protein  26.37 
 
 
944 aa  113  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.438205  normal  0.0130612 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2736  peptidase M16-like  27.32 
 
 
436 aa  113  9e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3261  peptidase M16 domain protein  26.35 
 
 
944 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0698623  normal  0.160904 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  26.1 
 
 
954 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4986  peptidase M16 domain-containing protein  28.85 
 
 
496 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0352  peptidase M16 domain-containing protein  29.3 
 
 
494 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3063  peptidase M16 domain-containing protein  28.7 
 
 
949 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1030  peptidase M16 domain-containing protein  26.35 
 
 
950 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2117  processing peptidase  25.06 
 
 
429 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.971397  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0735  peptidase M16-like protein  30.66 
 
 
446 aa  111  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.322228  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1097  peptidase M16 domain-containing protein  26.35 
 
 
950 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0270  peptidase M16 domain protein  26.3 
 
 
450 aa  111  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.582885  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0309  peptidase M16 domain protein  34.58 
 
 
901 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3239  zinc protease  24.64 
 
 
427 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00842119  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0705  peptidase M16 domain protein  21.87 
 
 
427 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5163  peptidase M16 domain-containing protein  29.17 
 
 
496 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3323  processing peptidase  27.6 
 
 
441 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390474  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  26.83 
 
 
959 aa  109  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1980  peptidase, putative  28.25 
 
 
479 aa  109  9.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1071  peptidase M16 domain-containing protein  24.06 
 
 
943 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0425  hypothetical protein  27.94 
 
 
497 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0103  peptidase M16-like  28.71 
 
 
519 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.968685  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0121  peptidase M16 domain protein  28.74 
 
 
520 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1131  peptidase M16 domain-containing protein  25.88 
 
 
950 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2615  peptidase M16 domain-containing protein  26.93 
 
 
910 aa  109  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0381043  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0110  peptidase M16 domain protein  28.74 
 
 
520 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.282099  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5113  peptidase M16 domain protein  28.53 
 
 
496 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3560  M16 family peptidase  27.7 
 
 
949 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0261  peptidase M16 domain-containing protein  23.19 
 
 
481 aa  108  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3216  peptidase M16 domain-containing protein  24.45 
 
 
476 aa  108  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  25.73 
 
 
937 aa  107  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0243  peptidase M16 domain protein  26.3 
 
 
450 aa  107  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5111  peptidase M16 domain-containing protein  29.14 
 
 
438 aa  107  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591794  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0928  M16 family peptidase  25.27 
 
 
478 aa  106  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2726  hypothetical protein  23.66 
 
 
434 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3129  peptidase M16 domain-containing protein  27.61 
 
 
967 aa  106  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0262  peptidase M16 domain-containing protein  21.88 
 
 
480 aa  105  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000120782  normal  0.152415 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>