More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1583 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1583  peptidase M16 domain protein  100 
 
 
453 aa  874    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.115865  normal  0.227723 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06880  predicted Zn-dependent peptidase  54.99 
 
 
462 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.408528  normal  0.0872557 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0864  peptidase M16 domain protein  53.17 
 
 
462 aa  438  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3795  peptidase M16-like  47.92 
 
 
448 aa  368  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.417189  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4127  peptidase M16 domain-containing protein  50.23 
 
 
447 aa  347  3e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4237  peptidase M16 domain protein  47.39 
 
 
451 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110006  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0932  peptidase M16 domain-containing protein  44.7 
 
 
455 aa  336  5.999999999999999e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513926  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1776  peptidase M16 domain-containing protein  45.6 
 
 
438 aa  330  3e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3746  peptidase M16 domain-containing protein  48.19 
 
 
447 aa  323  4e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3485  peptidase M16-like protein  23.68 
 
 
502 aa  143  8e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.320343  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0082  peptidase M16 domain-containing protein  30.39 
 
 
477 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.281002 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3492  peptidase M16 domain-containing protein  24.12 
 
 
477 aa  138  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3528  peptidase M16 domain protein  30.34 
 
 
949 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146206  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3464  peptidase M16 domain protein  30.96 
 
 
929 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.694105  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3443  peptidase M16-like protein  24.64 
 
 
473 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3741  peptidase M16 domain-containing protein  24.7 
 
 
486 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3814  peptidase M16 domain-containing protein  25.12 
 
 
487 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3381  peptidase M16-like  29.93 
 
 
947 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.529886  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3939  DNA-directed RNA polymerase  24.52 
 
 
487 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  28.29 
 
 
954 aa  130  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0210  peptidase M16 domain protein  23.83 
 
 
497 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.481547 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4129  peptidase M16 domain-containing protein  23.91 
 
 
492 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4255  peptidase M16 domain-containing protein  24.49 
 
 
492 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0304  peptidase M16 domain-containing protein  22.68 
 
 
483 aa  126  6e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0208  peptidase M16 domain-containing protein  24.09 
 
 
487 aa  127  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2079  peptidase M16 domain protein  29.91 
 
 
439 aa  126  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1866  peptidase M16-like  29.6 
 
 
439 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3580  peptidase M16 domain-containing protein  23.04 
 
 
482 aa  126  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3947  peptidase M16 domain-containing protein  22.82 
 
 
481 aa  124  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0091  peptidase M16 domain protein  29.3 
 
 
767 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1973  peptidase M16 domain-containing protein  29.95 
 
 
439 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333258  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1994  peptidase M16 domain protein  29.67 
 
 
439 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0261  peptidase M16 domain-containing protein  24.25 
 
 
481 aa  122  9e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2529  peptidase M16-like  23.89 
 
 
479 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657024 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3161  peptidase M16 domain-containing protein  28.47 
 
 
949 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0089  insulinase family protease/insulinase family protease  24.43 
 
 
952 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2981  peptidase M16 domain-containing protein  28.21 
 
 
949 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0262  peptidase M16 domain-containing protein  22.78 
 
 
480 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000120782  normal  0.152415 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3560  M16 family peptidase  27.84 
 
 
949 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  24.94 
 
 
947 aa  117  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3063  peptidase M16 domain-containing protein  27.97 
 
 
949 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  25.45 
 
 
943 aa  116  8.999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5951  peptidase M16 domain protein  25.37 
 
 
426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02700  putative metallopeptidase, M16 family protein  25.62 
 
 
687 aa  115  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0705  peptidase M16 domain protein  21.87 
 
 
427 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0103  peptidase M16-like  28.57 
 
 
519 aa  114  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.968685  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0497  peptidase M16 domain protein  24.26 
 
 
471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0152628  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1030  peptidase M16 domain-containing protein  26.91 
 
 
950 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3229  peptidase M16 domain-containing protein  25 
 
 
449 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3261  peptidase M16 domain protein  26.87 
 
 
944 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0698623  normal  0.160904 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03487  peptidase  26.73 
 
 
947 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0642  exported pepdidase, putative zinc protease  25.84 
 
 
950 aa  111  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0109  peptidase M16 domain protein  23.74 
 
 
456 aa  111  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3239  zinc protease  23.1 
 
 
427 aa  111  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00842119  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1131  peptidase M16 domain-containing protein  26.64 
 
 
950 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2615  peptidase M16 domain-containing protein  27.63 
 
 
910 aa  110  6e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0381043  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0121  peptidase M16 domain protein  29.57 
 
 
520 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0110  peptidase M16 domain protein  29.57 
 
 
520 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.282099  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1097  peptidase M16 domain-containing protein  26.64 
 
 
950 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01173  Peptidase, M16 family protein  24.66 
 
 
930 aa  108  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0120262  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4170  peptidase M16 domain protein  24.11 
 
 
969 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.732695 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  24.71 
 
 
954 aa  108  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1597  peptidase M16 domain-containing protein  25.71 
 
 
466 aa  107  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.832035  normal  0.315453 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1035  peptidase M16 domain-containing protein  25.99 
 
 
944 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0928  M16 family peptidase  23.46 
 
 
478 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1057  M16 family peptidase  26.05 
 
 
945 aa  105  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.867585 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1590  peptidase M16 domain protein  26.91 
 
 
424 aa  103  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.508475  normal  0.157035 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1365  peptidase M16-like  24.17 
 
 
958 aa  103  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  27.47 
 
 
921 aa  103  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3568  peptidase M16 domain-containing protein  31.27 
 
 
448 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.742239  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  22.99 
 
 
945 aa  102  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0735  peptidase M16-like protein  27.03 
 
 
446 aa  102  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.322228  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  25.12 
 
 
876 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0165  peptidase M16 domain protein  28.06 
 
 
949 aa  101  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4079  M16 family metallopeptidase  24.2 
 
 
959 aa  100  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1955  peptidase M16 domain-containing protein  23.98 
 
 
960 aa  99  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.384397  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2736  peptidase M16-like  26.14 
 
 
436 aa  98.6  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1271  peptidase M16 domain protein  32.84 
 
 
452 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.617151  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4248  peptidase M16 domain protein  24.57 
 
 
426 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2034  zinc protease  24.32 
 
 
962 aa  97.8  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554182  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5792  peptidase M16 domain protein  22.38 
 
 
458 aa  97.8  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.047663 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  26.59 
 
 
896 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3947  peptidase M16 domain-containing protein  30.03 
 
 
448 aa  97.1  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.530134  normal  0.18472 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  25.8 
 
 
945 aa  97.1  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0621  peptidase M16-like  23.88 
 
 
725 aa  97.1  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3327  peptidase M16 domain-containing protein  24.3 
 
 
944 aa  97.1  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3615  peptidase M16 domain protein  23.75 
 
 
421 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785014 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  25.75 
 
 
945 aa  95.5  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1801  peptidase M16 domain-containing protein  26.62 
 
 
453 aa  95.5  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.36256  normal  0.940688 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4236  processing peptidase  23.61 
 
 
421 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00385925 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4197  peptidase M16 domain protein  23.61 
 
 
421 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2546  peptidase M16  27.5 
 
 
464 aa  94  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.774857  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2826  peptidase M16-like  24.94 
 
 
952 aa  94  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.110257  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2345  peptidase M16 domain protein  21.74 
 
 
490 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.854323 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0320  peptidase M16 domain protein  31.6 
 
 
904 aa  93.6  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.812117  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0870  peptidase M16 domain protein  30.11 
 
 
451 aa  93.6  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4178  peptidase M16-like  27.09 
 
 
462 aa  93.2  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0172  peptidase M16 domain protein  24.09 
 
 
441 aa  92.8  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2704  peptidase M16 domain protein  22.01 
 
 
458 aa  92.8  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4034  peptidase M16-like  28.13 
 
 
462 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.450059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>