More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1801 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1801  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 
453 aa  915    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.36256  normal  0.940688 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2841  peptidase M16 domain protein  69.03 
 
 
460 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.279982  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3518  peptidase M16 domain-containing protein  68.14 
 
 
460 aa  600  1e-170  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3871  peptidase M16 domain-containing protein  72.3 
 
 
453 aa  596  1e-169  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4763  peptidase M16 domain-containing protein  65.49 
 
 
448 aa  560  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1670  peptidase M16-like  61.66 
 
 
471 aa  545  1e-154  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0893  peptidase M16 domain-containing protein  59.25 
 
 
451 aa  533  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0504062  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4372  peptidase M16 domain protein  59.6 
 
 
448 aa  525  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1280  peptidase M16-like  57.48 
 
 
461 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0270  peptidase M16 domain protein  50.71 
 
 
450 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.582885  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0243  peptidase M16 domain protein  50.24 
 
 
450 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0388  putative Zinc protease-like signal peptide protein  50.12 
 
 
447 aa  397  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.886206  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0283  peptidase M16-like protein  47.29 
 
 
454 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0571104  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0336  peptidase M16, C-terminal  48.27 
 
 
453 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.469062  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1926  peptidase M16 domain-containing protein  41.11 
 
 
445 aa  342  7e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1631  peptidase M16 domain protein  40.78 
 
 
445 aa  340  2e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.368966  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2736  peptidase M16-like  42.66 
 
 
436 aa  339  5.9999999999999996e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3721  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  40.89 
 
 
429 aa  319  5e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0690318 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1932  peptidase M16-like  40.9 
 
 
434 aa  318  1e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.166044  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3618  peptidase M16 domain protein  46.56 
 
 
467 aa  318  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0378  insulinase family protein  41.88 
 
 
435 aa  316  6e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.621778  hitchhiker  0.00954863 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0735  peptidase M16-like protein  38.94 
 
 
446 aa  315  9e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.322228  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0064  hypothetical protein  41.49 
 
 
441 aa  309  8e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2986  hypothetical protein  39.39 
 
 
438 aa  294  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03520  peptidase M16-like protein  38.68 
 
 
494 aa  274  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00585109  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2106  M16 family peptidase  34.45 
 
 
443 aa  270  2.9999999999999997e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0218  non-proteolytic protein, peptidase family M16  35.24 
 
 
443 aa  270  2.9999999999999997e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1940  peptidase M16-like  36.08 
 
 
437 aa  266  7e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04870  hypothetical protein  37.26 
 
 
495 aa  263  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0466  hypothetical protein  37.26 
 
 
495 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0425  hypothetical protein  36.38 
 
 
497 aa  260  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4753  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  36.16 
 
 
496 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0542028 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2726  hypothetical protein  32.78 
 
 
434 aa  254  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4177  peptidase M16 domain-containing protein  37.97 
 
 
486 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.733027  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2599  hypothetical protein  32.78 
 
 
434 aa  253  5.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0172  peptidase M16 domain protein  33.63 
 
 
441 aa  253  6e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0352  peptidase M16 domain-containing protein  36.6 
 
 
494 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4986  peptidase M16 domain-containing protein  35.73 
 
 
496 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5339  peptidase M16-like  34.55 
 
 
495 aa  249  6e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5163  peptidase M16 domain-containing protein  35.92 
 
 
496 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2657  peptidase M16 domain-containing protein  35.98 
 
 
481 aa  244  3e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5113  peptidase M16 domain protein  35.92 
 
 
496 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3039  peptidase M16 domain-containing protein  31.99 
 
 
451 aa  217  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0296274  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0095  peptidase M16-like  33.41 
 
 
457 aa  212  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.212806  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0188  zinc protease  31.44 
 
 
454 aa  209  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4178  peptidase M16-like  32.09 
 
 
462 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4034  peptidase M16-like  32.25 
 
 
462 aa  203  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4857  peptidase M16 domain protein  31.89 
 
 
477 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2546  peptidase M16  31.52 
 
 
464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.774857  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1994  peptidase M16 domain protein  33.26 
 
 
439 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2079  peptidase M16 domain protein  33.26 
 
 
439 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1483  peptidase M16-like  28.6 
 
 
515 aa  199  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0660842  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1783  peptidase M16 domain-containing protein  30.18 
 
 
504 aa  198  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3166  peptidase M16-like  32.25 
 
 
465 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972339  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1866  peptidase M16-like  32.56 
 
 
439 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1712  putative Zn-dependent protease  31.44 
 
 
460 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2973  peptidase M16-like  32.72 
 
 
447 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2307  peptidase M16 domain-containing protein  32.62 
 
 
451 aa  196  7e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0931  insulinase-like peptidase  29 
 
 
528 aa  195  1e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0647883  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2203  peptidase M16 domain-containing protein  31.04 
 
 
457 aa  195  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.339907  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2714  peptidase M16 domain-containing protein  32.31 
 
 
437 aa  195  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.80374  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1391  peptidase M16-like  31.71 
 
 
456 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0362  peptidase M16 protein  31.41 
 
 
437 aa  189  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0563461  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2932  peptidase M16 domain-containing protein  32.23 
 
 
435 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00273902  normal  0.175117 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2606  peptidase M16 domain protein  31.1 
 
 
427 aa  186  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.36599  normal  0.289555 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3229  peptidase M16 domain-containing protein  30.8 
 
 
449 aa  187  5e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2329  peptidase M16 domain-containing protein  31.1 
 
 
427 aa  186  6e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.504761  normal  0.793459 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2284  peptidase M16 domain protein  31.03 
 
 
427 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.538642 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2143  peptidase M16 domain-containing protein  29.42 
 
 
444 aa  184  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0006113  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1973  peptidase M16 domain-containing protein  32.33 
 
 
439 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333258  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1802  peptidase M16 domain-containing protein  31.6 
 
 
431 aa  182  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0228874 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0291  peptidase M16 domain-containing protein  29.44 
 
 
464 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2864  peptidase M16 domain protein  30.34 
 
 
435 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0431623 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0395  peptidase M16 domain protein  30.66 
 
 
437 aa  178  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412071  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1096  putative zinc protease  32.86 
 
 
435 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0917813  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2216  peptidase M16 domain-containing protein  30.55 
 
 
433 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.384434  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2759  peptidase M16 domain-containing protein  32.62 
 
 
435 aa  173  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.482454  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0431  peptidase M16-like  30.12 
 
 
451 aa  172  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4179  peptidase M16 domain-containing protein  31.03 
 
 
430 aa  169  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1010  peptidase M16 domain-containing protein  28.77 
 
 
426 aa  169  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.346738  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1980  peptidase, putative  28.1 
 
 
479 aa  166  9e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4046  peptidase M16-like  29.01 
 
 
444 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3630  peptidase M16 domain-containing protein  27.92 
 
 
474 aa  160  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120244  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  29.62 
 
 
945 aa  157  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0686  peptidase M16 domain protein  27.03 
 
 
495 aa  156  6e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000768524  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4989  peptidase M16 domain-containing protein  30.05 
 
 
456 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0497  peptidase M16 domain protein  28.33 
 
 
471 aa  155  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0152628  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  29.01 
 
 
896 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2529  peptidase M16-like  27.54 
 
 
479 aa  153  7e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657024 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2774  peptidase M16-like  25.85 
 
 
494 aa  152  8e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171699  normal  0.336498 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5166  peptidase M16 domain-containing protein  29.51 
 
 
457 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0698  peptidase M16 domain protein  26.32 
 
 
495 aa  147  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147325 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0738  peptidase M16 domain-containing protein  27.69 
 
 
506 aa  146  6e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2345  peptidase M16 domain protein  27.21 
 
 
490 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.854323 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5116  peptidase M16 domain protein  29.34 
 
 
456 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2752  peptidase M16 domain protein  27.17 
 
 
494 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0349  peptidase M16 domain-containing protein  29.51 
 
 
464 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0621  peptidase M16-like  26.37 
 
 
725 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  27.92 
 
 
876 aa  140  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0678  peptidase M16 domain protein  25.17 
 
 
490 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>