More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0893 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1280  peptidase M16-like  82.6 
 
 		 461 aa  731    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0893  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 		 451 aa  912    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0504062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1670  peptidase M16-like  67.54 
 
 		 471 aa  608  1e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4372  peptidase M16 domain protein  63.92 
 
 		 448 aa  548  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2841  peptidase M16 domain protein  63.11 
 
 		 460 aa  548  1e-155  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.279982  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3518  peptidase M16 domain-containing protein  62.89 
 
 		 460 aa  545  1e-154  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1801  peptidase M16 domain-containing protein  59.25 
 
 		 453 aa  533  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.36256  normal  0.940688 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4763  peptidase M16 domain-containing protein  63.84 
 
 		 448 aa  524  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3871  peptidase M16 domain-containing protein  62.67 
 
 		 453 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0243  peptidase M16 domain protein  51.44 
 
 		 450 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0270  peptidase M16 domain protein  51.44 
 
 		 450 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.582885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0283  peptidase M16-like protein  52.03 
 
 		 454 aa  414  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0571104  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0388  putative Zinc protease-like signal peptide protein  52.15 
 
 		 447 aa  411  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.886206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0336  peptidase M16, C-terminal  52.48 
 
 		 453 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.469062  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1926  peptidase M16 domain-containing protein  43.11 
 
 		 445 aa  362  6e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1631  peptidase M16 domain protein  44.85 
 
 		 445 aa  356  5e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.368966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3618  peptidase M16 domain protein  47.24 
 
 		 467 aa  338  9e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3721  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  42.59 
 
 		 429 aa  338  9.999999999999999e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0690318 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2736  peptidase M16-like  40.93 
 
 		 436 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0735  peptidase M16-like protein  41.72 
 
 		 446 aa  336  5.999999999999999e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.322228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0378  insulinase family protein  43.16 
 
 		 435 aa  332  9e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.621778  hitchhiker  0.00954863 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1932  peptidase M16-like  40.75 
 
 		 434 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.166044  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0064  hypothetical protein  43.46 
 
 		 441 aa  318  1e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2986  hypothetical protein  41.67 
 
 		 438 aa  313  4.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1940  peptidase M16-like  36.85 
 
 		 437 aa  288  1e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03520  peptidase M16-like protein  39.19 
 
 		 494 aa  280  4e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00585109  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4753  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  39.1 
 
 		 496 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0542028 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0425  hypothetical protein  39.34 
 
 		 497 aa  277  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2726  hypothetical protein  33.71 
 
 		 434 aa  267  2.9999999999999995e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4986  peptidase M16 domain-containing protein  37.47 
 
 		 496 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0352  peptidase M16 domain-containing protein  37.71 
 
 		 494 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2599  hypothetical protein  33.48 
 
 		 434 aa  265  1e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0466  hypothetical protein  37.03 
 
 		 495 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2106  M16 family peptidase  35.51 
 
 		 443 aa  265  2e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0218  non-proteolytic protein, peptidase family M16  35.06 
 
 		 443 aa  263  3e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04870  hypothetical protein  36.99 
 
 		 495 aa  263  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4177  peptidase M16 domain-containing protein  37.06 
 
 		 486 aa  258  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.733027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5163  peptidase M16 domain-containing protein  36.82 
 
 		 496 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5339  peptidase M16-like  36.64 
 
 		 495 aa  256  6e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5113  peptidase M16 domain protein  36.82 
 
 		 496 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0172  peptidase M16 domain protein  34.5 
 
 		 441 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2657  peptidase M16 domain-containing protein  36.75 
 
 		 481 aa  241  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235444 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0931  insulinase-like peptidase  34.11 
 
 		 528 aa  234  3e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0647883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1483  peptidase M16-like  34.11 
 
 		 515 aa  234  3e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0660842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1783  peptidase M16 domain-containing protein  32.41 
 
 		 504 aa  229  1e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2714  peptidase M16 domain-containing protein  34.24 
 
 		 437 aa  214  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.80374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0095  peptidase M16-like  32.44 
 
 		 457 aa  206  7e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.212806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0188  zinc protease  31.67 
 
 		 454 aa  204  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3039  peptidase M16 domain-containing protein  30.32 
 
 		 451 aa  200  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0296274  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2932  peptidase M16 domain-containing protein  34.27 
 
 		 435 aa  199  7e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00273902  normal  0.175117 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2307  peptidase M16 domain-containing protein  33.97 
 
 		 451 aa  199  7e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2606  peptidase M16 domain protein  32.63 
 
 		 427 aa  191  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.36599  normal  0.289555 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0362  peptidase M16 protein  31.76 
 
 		 437 aa  189  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0563461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2284  peptidase M16 domain protein  32.55 
 
 		 427 aa  188  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.538642 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2329  peptidase M16 domain-containing protein  32.39 
 
 		 427 aa  188  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.504761  normal  0.793459 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1096  putative zinc protease  32.62 
 
 		 435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0917813  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2759  peptidase M16 domain-containing protein  32.39 
 
 		 435 aa  183  7e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.482454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3166  peptidase M16-like  28.98 
 
 		 465 aa  181  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972339  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2546  peptidase M16  29.12 
 
 		 464 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.774857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4178  peptidase M16-like  29.77 
 
 		 462 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4046  peptidase M16-like  31.35 
 
 		 444 aa  178  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3229  peptidase M16 domain-containing protein  31.07 
 
 		 449 aa  178  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2203  peptidase M16 domain-containing protein  30.07 
 
 		 457 aa  176  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.339907  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0291  peptidase M16 domain-containing protein  28.11 
 
 		 464 aa  175  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4034  peptidase M16-like  29.74 
 
 		 462 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1802  peptidase M16 domain-containing protein  31.97 
 
 		 431 aa  172  9e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0228874 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4857  peptidase M16 domain protein  29.69 
 
 		 477 aa  172  9e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1010  peptidase M16 domain-containing protein  29.74 
 
 		 426 aa  169  7e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.346738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2864  peptidase M16 domain protein  29.51 
 
 		 435 aa  169  9e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0431623 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2973  peptidase M16-like  30.05 
 
 		 447 aa  168  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4989  peptidase M16 domain-containing protein  30.32 
 
 		 456 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1391  peptidase M16-like  30.39 
 
 		 456 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4179  peptidase M16 domain-containing protein  30.18 
 
 		 430 aa  167  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2216  peptidase M16 domain-containing protein  30.47 
 
 		 433 aa  166  8e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.384434  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2143  peptidase M16 domain-containing protein  29.07 
 
 		 444 aa  165  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0006113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1712  putative Zn-dependent protease  26.77 
 
 		 460 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1980  peptidase, putative  28.51 
 
 		 479 aa  159  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0431  peptidase M16-like  28 
 
 		 451 aa  158  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5166  peptidase M16 domain-containing protein  30.21 
 
 		 457 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1994  peptidase M16 domain protein  29.56 
 
 		 439 aa  156  6e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2079  peptidase M16 domain protein  29.56 
 
 		 439 aa  156  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0698  peptidase M16 domain protein  27.23 
 
 		 495 aa  156  8e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147325 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0395  peptidase M16 domain protein  29.9 
 
 		 437 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412071  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5116  peptidase M16 domain protein  28.64 
 
 		 456 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0686  peptidase M16 domain protein  27.23 
 
 		 495 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000768524  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1866  peptidase M16-like  29.44 
 
 		 439 aa  153  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1973  peptidase M16 domain-containing protein  30.75 
 
 		 439 aa  153  8e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0497  peptidase M16 domain protein  28.02 
 
 		 471 aa  149  8e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0152628  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3630  peptidase M16 domain-containing protein  27.17 
 
 		 474 aa  147  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120244  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2529  peptidase M16-like  27.03 
 
 		 479 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657024 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  29.81 
 
 		 954 aa  146  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  28.1 
 
 		 945 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2774  peptidase M16-like  26.85 
 
 		 494 aa  145  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171699  normal  0.336498 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0621  peptidase M16-like  27.1 
 
 		 725 aa  144  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2752  peptidase M16 domain protein  26.95 
 
 		 494 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0200  peptidase M16 domain protein  29.34 
 
 		 412 aa  137  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3492  peptidase M16 domain-containing protein  29.04 
 
 		 477 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0091  peptidase M16 domain protein  26.6 
 
 		 767 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5792  peptidase M16 domain protein  27.91 
 
 		 458 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.047663 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3580  peptidase M16 domain-containing protein  25.95 
 
 		 482 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>