More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1712 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1712  putative Zn-dependent protease  100 
 
 		 460 aa  936    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2546  peptidase M16  72.97 
 
 		 464 aa  651    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.774857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4178  peptidase M16-like  73.77 
 
 		 462 aa  666    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1391  peptidase M16-like  73.18 
 
 		 456 aa  653    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4034  peptidase M16-like  71.21 
 
 		 462 aa  656    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3166  peptidase M16-like  72.45 
 
 		 465 aa  657    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972339  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4857  peptidase M16 domain protein  68.86 
 
 		 477 aa  655    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2203  peptidase M16 domain-containing protein  49.77 
 
 		 457 aa  437  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.339907  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2864  peptidase M16 domain protein  49.17 
 
 		 435 aa  414  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0431623 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1010  peptidase M16 domain-containing protein  50.48 
 
 		 426 aa  412  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.346738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3039  peptidase M16 domain-containing protein  43.91 
 
 		 451 aa  378  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0296274  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0188  zinc protease  43.28 
 
 		 454 aa  377  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0291  peptidase M16 domain-containing protein  42.79 
 
 		 464 aa  370  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2216  peptidase M16 domain-containing protein  47.28 
 
 		 433 aa  365  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.384434  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1802  peptidase M16 domain-containing protein  46.25 
 
 		 431 aa  362  8e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0228874 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2284  peptidase M16 domain protein  44.79 
 
 		 427 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.538642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2606  peptidase M16 domain protein  44.31 
 
 		 427 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.36599  normal  0.289555 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0395  peptidase M16 domain protein  44.93 
 
 		 437 aa  355  6.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412071  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2329  peptidase M16 domain-containing protein  44.07 
 
 		 427 aa  354  2e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.504761  normal  0.793459 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4179  peptidase M16 domain-containing protein  44.39 
 
 		 430 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0362  peptidase M16 protein  41.22 
 
 		 437 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0563461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2973  peptidase M16-like  39.56 
 
 		 447 aa  319  7.999999999999999e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0095  peptidase M16-like  38.98 
 
 		 457 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.212806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2714  peptidase M16 domain-containing protein  40.88 
 
 		 437 aa  310  2.9999999999999997e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.80374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2932  peptidase M16 domain-containing protein  41.01 
 
 		 435 aa  310  5e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00273902  normal  0.175117 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4046  peptidase M16-like  39.86 
 
 		 444 aa  294  2e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1096  putative zinc protease  40.77 
 
 		 435 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0917813  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2759  peptidase M16 domain-containing protein  40.53 
 
 		 435 aa  282  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.482454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0200  peptidase M16 domain protein  37.93 
 
 		 412 aa  278  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0431  peptidase M16-like  39.24 
 
 		 451 aa  267  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7811  putative Zn-dependent protease  34.13 
 
 		 439 aa  225  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0101927  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0064  hypothetical protein  32.62 
 
 		 441 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3721  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  33.09 
 
 		 429 aa  213  9e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0690318 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1932  peptidase M16-like  31.42 
 
 		 434 aa  204  3e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.166044  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0735  peptidase M16-like protein  29.57 
 
 		 446 aa  201  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.322228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4177  peptidase M16 domain-containing protein  30.88 
 
 		 486 aa  201  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.733027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1801  peptidase M16 domain-containing protein  31.48 
 
 		 453 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.36256  normal  0.940688 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1058  M16 family peptidase  27.8 
 
 		 451 aa  197  3e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0762  M16 family peptidase putative  27.56 
 
 		 439 aa  194  4e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.655264  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0850  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  26.8 
 
 		 451 aa  192  7e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.669926  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0913  M16 family peptidase  27.59 
 
 		 448 aa  192  9e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.226021  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2986  hypothetical protein  29.88 
 
 		 438 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4763  peptidase M16 domain-containing protein  31.07 
 
 		 448 aa  190  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2143  peptidase M16 domain-containing protein  27.67 
 
 		 444 aa  189  5.999999999999999e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0006113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0378  insulinase family protein  28.6 
 
 		 435 aa  189  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.621778  hitchhiker  0.00954863 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3618  peptidase M16 domain protein  34.75 
 
 		 467 aa  188  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0172  peptidase M16 domain protein  29.68 
 
 		 441 aa  188  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0466  hypothetical protein  29.1 
 
 		 495 aa  186  6e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04870  hypothetical protein  29.33 
 
 		 495 aa  186  6e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0425  hypothetical protein  29.79 
 
 		 497 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0352  peptidase M16 domain-containing protein  29.09 
 
 		 494 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3518  peptidase M16 domain-containing protein  29.37 
 
 		 460 aa  179  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4986  peptidase M16 domain-containing protein  29.47 
 
 		 496 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4753  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  29.4 
 
 		 496 aa  177  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0542028 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5163  peptidase M16 domain-containing protein  29.67 
 
 		 496 aa  176  8e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2841  peptidase M16 domain protein  29.6 
 
 		 460 aa  176  9e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.279982  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1670  peptidase M16-like  29.23 
 
 		 471 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1280  peptidase M16-like  27.82 
 
 		 461 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2657  peptidase M16 domain-containing protein  30.79 
 
 		 481 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235444 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2726  hypothetical protein  27.43 
 
 		 434 aa  173  5.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2599  hypothetical protein  27.43 
 
 		 434 aa  173  5.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5113  peptidase M16 domain protein  29.44 
 
 		 496 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5339  peptidase M16-like  27.79 
 
 		 495 aa  172  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1980  peptidase, putative  29.17 
 
 		 479 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1926  peptidase M16 domain-containing protein  28.05 
 
 		 445 aa  171  3e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0893  peptidase M16 domain-containing protein  26.77 
 
 		 451 aa  170  5e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0504062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2273  peptidase M16 domain-containing protein  30.33 
 
 		 438 aa  169  8e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.359911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1631  peptidase M16 domain protein  26.92 
 
 		 445 aa  169  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.368966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3871  peptidase M16 domain-containing protein  30.79 
 
 		 453 aa  168  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03520  peptidase M16-like protein  28.51 
 
 		 494 aa  167  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00585109  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2736  peptidase M16-like  27.58 
 
 		 436 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2307  peptidase M16 domain-containing protein  29.45 
 
 		 451 aa  162  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0270  peptidase M16 domain protein  29.04 
 
 		 450 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.582885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1783  peptidase M16 domain-containing protein  27.21 
 
 		 504 aa  161  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0283  peptidase M16-like protein  27.05 
 
 		 454 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0571104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4372  peptidase M16 domain protein  29.84 
 
 		 448 aa  160  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0243  peptidase M16 domain protein  28.81 
 
 		 450 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3216  peptidase M16 domain-containing protein  27.74 
 
 		 476 aa  158  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  28.57 
 
 		 876 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1940  peptidase M16-like  25.87 
 
 		 437 aa  155  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0698  peptidase M16 domain protein  29.26 
 
 		 495 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147325 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0405  peptidase M16-like  27.35 
 
 		 427 aa  152  8.999999999999999e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3741  peptidase M16 domain-containing protein  27.79 
 
 		 486 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  27.68 
 
 		 945 aa  151  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4371  peptidase M16-like  27.65 
 
 		 512 aa  151  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.325226 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2529  peptidase M16-like  26.97 
 
 		 479 aa  151  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657024 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1866  peptidase M16-like  26.52 
 
 		 439 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  28.76 
 
 		 954 aa  150  5e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3814  peptidase M16 domain-containing protein  27.44 
 
 		 487 aa  150  6e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3939  DNA-directed RNA polymerase  27.21 
 
 		 487 aa  149  7e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2034  zinc protease  28.09 
 
 		 962 aa  149  9e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554182  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4255  peptidase M16 domain-containing protein  26.47 
 
 		 492 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3580  peptidase M16 domain-containing protein  26.41 
 
 		 482 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0686  peptidase M16 domain protein  28 
 
 		 495 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000768524  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2079  peptidase M16 domain protein  26.13 
 
 		 439 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0210  peptidase M16 domain protein  26.47 
 
 		 497 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.481547 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2345  peptidase M16 domain protein  26.03 
 
 		 490 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.854323 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0208  peptidase M16 domain-containing protein  26.47 
 
 		 487 aa  146  6e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4129  peptidase M16 domain-containing protein  26.47 
 
 		 492 aa  147  6e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  28.94 
 
 		 943 aa  146  7.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>