More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5166 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_5166  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 		 457 aa  926    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4989  peptidase M16 domain-containing protein  70.38 
 
 		 456 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5116  peptidase M16 domain protein  68.37 
 
 		 456 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0349  peptidase M16 domain-containing protein  39.54 
 
 		 464 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4753  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  35.84 
 
 		 496 aa  263  4e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0542028 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4986  peptidase M16 domain-containing protein  36.53 
 
 		 496 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5113  peptidase M16 domain protein  36.07 
 
 		 496 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0352  peptidase M16 domain-containing protein  36.82 
 
 		 494 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5163  peptidase M16 domain-containing protein  35.84 
 
 		 496 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5339  peptidase M16-like  35.7 
 
 		 495 aa  253  7e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0425  hypothetical protein  34.78 
 
 		 497 aa  247  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03520  peptidase M16-like protein  37.65 
 
 		 494 aa  246  4.9999999999999997e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00585109  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0466  hypothetical protein  34.89 
 
 		 495 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4177  peptidase M16 domain-containing protein  34.78 
 
 		 486 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.733027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04870  hypothetical protein  34.43 
 
 		 495 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2106  M16 family peptidase  32.55 
 
 		 443 aa  211  2e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1932  peptidase M16-like  32.29 
 
 		 434 aa  209  1e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.166044  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0218  non-proteolytic protein, peptidase family M16  32.37 
 
 		 443 aa  208  1e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2986  hypothetical protein  32.93 
 
 		 438 aa  208  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0735  peptidase M16-like protein  31.37 
 
 		 446 aa  204  3e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.322228  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0064  hypothetical protein  31.59 
 
 		 441 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0378  insulinase family protein  31.62 
 
 		 435 aa  197  3e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.621778  hitchhiker  0.00954863 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1940  peptidase M16-like  29.76 
 
 		 437 aa  197  3e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2599  hypothetical protein  29.51 
 
 		 434 aa  194  3e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2726  hypothetical protein  29.51 
 
 		 434 aa  193  5e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2657  peptidase M16 domain-containing protein  34.05 
 
 		 481 aa  192  9e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235444 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2736  peptidase M16-like  28.85 
 
 		 436 aa  187  3e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1783  peptidase M16 domain-containing protein  29.56 
 
 		 504 aa  180  4.999999999999999e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3721  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  30.22 
 
 		 429 aa  176  5e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0690318 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0931  insulinase-like peptidase  29.98 
 
 		 528 aa  176  9e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0647883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2307  peptidase M16 domain-containing protein  30.26 
 
 		 451 aa  173  5e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0172  peptidase M16 domain protein  30.66 
 
 		 441 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0893  peptidase M16 domain-containing protein  30.21 
 
 		 451 aa  168  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0504062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1483  peptidase M16-like  29.26 
 
 		 515 aa  168  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0660842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1280  peptidase M16-like  29.15 
 
 		 461 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3618  peptidase M16 domain protein  31.46 
 
 		 467 aa  159  7e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0388  putative Zinc protease-like signal peptide protein  29.05 
 
 		 447 aa  159  9e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.886206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1801  peptidase M16 domain-containing protein  29.51 
 
 		 453 aa  159  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.36256  normal  0.940688 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0243  peptidase M16 domain protein  29.52 
 
 		 450 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0270  peptidase M16 domain protein  29.52 
 
 		 450 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.582885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0283  peptidase M16-like protein  27.27 
 
 		 454 aa  158  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0571104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3518  peptidase M16 domain-containing protein  28.48 
 
 		 460 aa  158  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2841  peptidase M16 domain protein  28.32 
 
 		 460 aa  155  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.279982  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0336  peptidase M16, C-terminal  29.05 
 
 		 453 aa  153  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.469062  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1926  peptidase M16 domain-containing protein  26.73 
 
 		 445 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3871  peptidase M16 domain-containing protein  30.44 
 
 		 453 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4372  peptidase M16 domain protein  27.86 
 
 		 448 aa  146  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1670  peptidase M16-like  27.84 
 
 		 471 aa  142  9e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3039  peptidase M16 domain-containing protein  27.38 
 
 		 451 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0296274  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  29.93 
 
 		 921 aa  137  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0188  zinc protease  25.78 
 
 		 454 aa  134  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4763  peptidase M16 domain-containing protein  27.45 
 
 		 448 aa  133  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1866  peptidase M16-like  26.79 
 
 		 439 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1973  peptidase M16 domain-containing protein  27.99 
 
 		 439 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1631  peptidase M16 domain protein  25.36 
 
 		 445 aa  132  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.368966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2714  peptidase M16 domain-containing protein  28.12 
 
 		 437 aa  130  6e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.80374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  25.84 
 
 		 943 aa  129  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1994  peptidase M16 domain protein  26.32 
 
 		 439 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2079  peptidase M16 domain protein  26.32 
 
 		 439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0178  peptidase M16 domain protein  26.23 
 
 		 421 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3129  peptidase M16 domain-containing protein  28.38 
 
 		 967 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1597  peptidase M16 domain-containing protein  28.99 
 
 		 466 aa  121  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.832035  normal  0.315453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4170  peptidase M16 domain protein  25.65 
 
 		 969 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.732695 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1712  putative Zn-dependent protease  26.65 
 
 		 460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0121  peptidase M16 domain protein  29.88 
 
 		 520 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0110  peptidase M16 domain protein  29.88 
 
 		 520 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.282099  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2546  peptidase M16  27.23 
 
 		 464 aa  117  6e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.774857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0103  peptidase M16-like  29.9 
 
 		 519 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.968685  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0095  peptidase M16-like  25.71 
 
 		 457 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.212806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3166  peptidase M16-like  26.97 
 
 		 465 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972339  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4857  peptidase M16 domain protein  26.26 
 
 		 477 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0362  peptidase M16 protein  25.97 
 
 		 437 aa  114  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0563461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4046  peptidase M16-like  26.57 
 
 		 444 aa  114  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2973  peptidase M16-like  25.78 
 
 		 447 aa  113  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0291  peptidase M16 domain-containing protein  25.06 
 
 		 464 aa  113  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2203  peptidase M16 domain-containing protein  27.4 
 
 		 457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.339907  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4178  peptidase M16-like  24.87 
 
 		 462 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3528  peptidase M16 domain protein  28.95 
 
 		 949 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146206  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3464  peptidase M16 domain protein  28.71 
 
 		 929 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.694105  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2273  peptidase M16 domain-containing protein  26.5 
 
 		 438 aa  111  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.359911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4631  peptidase M16 domain-containing protein  27.84 
 
 		 457 aa  110  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3381  peptidase M16-like  28.26 
 
 		 947 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.529886  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  27.47 
 
 		 896 aa  110  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1058  M16 family peptidase  24.32 
 
 		 451 aa  108  2e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3229  peptidase M16 domain-containing protein  26.1 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2143  peptidase M16 domain-containing protein  23.19 
 
 		 444 aa  108  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0006113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5911  peptidase M16-like protein, possible Zn-dependent  28.69 
 
 		 957 aa  107  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0304  peptidase M16 domain-containing protein  22.56 
 
 		 483 aa  107  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1955  peptidase M16 domain-containing protein  26.48 
 
 		 960 aa  106  8e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.384397  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5792  peptidase M16 domain protein  25.96 
 
 		 458 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.047663 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4034  peptidase M16-like  23.87 
 
 		 462 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0082  peptidase M16 domain-containing protein  25.98 
 
 		 477 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.281002 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3239  zinc protease  24.56 
 
 		 427 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00842119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0850  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  23.42 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.669926  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  24.66 
 
 		 954 aa  104  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2034  zinc protease  26.59 
 
 		 962 aa  103  5e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554182  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3939  DNA-directed RNA polymerase  24.73 
 
 		 487 aa  103  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5316  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  29.11 
 
 		 942 aa  103  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3008  peptidase M16 domain protein  25.65 
 
 		 918 aa  103  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3741  peptidase M16 domain-containing protein  24.73 
 
 		 486 aa  103  8e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>