More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3939 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_4255  peptidase M16 domain-containing protein  91.77 
 
 
492 aa  895    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3580  peptidase M16 domain-containing protein  71.22 
 
 
482 aa  690    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3492  peptidase M16 domain-containing protein  91.31 
 
 
477 aa  894    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0262  peptidase M16 domain-containing protein  74.25 
 
 
480 aa  704    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000120782  normal  0.152415 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4129  peptidase M16 domain-containing protein  91.58 
 
 
492 aa  895    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0261  peptidase M16 domain-containing protein  72.73 
 
 
481 aa  695    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3485  peptidase M16-like protein  68.12 
 
 
502 aa  678    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.320343  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3947  peptidase M16 domain-containing protein  71.85 
 
 
481 aa  723    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0208  peptidase M16 domain-containing protein  91.79 
 
 
487 aa  895    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3741  peptidase M16 domain-containing protein  98.56 
 
 
486 aa  969    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3814  peptidase M16 domain-containing protein  98.56 
 
 
487 aa  972    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0304  peptidase M16 domain-containing protein  70.34 
 
 
483 aa  690    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0210  peptidase M16 domain protein  91.17 
 
 
497 aa  914    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.481547 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3443  peptidase M16-like protein  73.12 
 
 
473 aa  674    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3939  DNA-directed RNA polymerase  100 
 
 
487 aa  986    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2704  peptidase M16 domain protein  48.81 
 
 
458 aa  433  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5792  peptidase M16 domain protein  48.29 
 
 
458 aa  418  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.047663 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1994  peptidase M16 domain protein  32.33 
 
 
439 aa  243  5e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2079  peptidase M16 domain protein  32.1 
 
 
439 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1866  peptidase M16-like  31.72 
 
 
439 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1973  peptidase M16 domain-containing protein  33.26 
 
 
439 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333258  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  31.87 
 
 
943 aa  212  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0091  peptidase M16 domain protein  28.67 
 
 
767 aa  205  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0110  peptidase M16 domain protein  31.44 
 
 
520 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.282099  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0121  peptidase M16 domain protein  31.21 
 
 
520 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0103  peptidase M16-like  31.99 
 
 
519 aa  200  6e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.968685  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0698  peptidase M16 domain protein  27.71 
 
 
495 aa  196  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147325 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0497  peptidase M16 domain protein  27.79 
 
 
471 aa  192  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0152628  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0686  peptidase M16 domain protein  27.25 
 
 
495 aa  190  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000768524  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4371  peptidase M16-like  29.55 
 
 
512 aa  186  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.325226 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3216  peptidase M16 domain-containing protein  26.54 
 
 
476 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2345  peptidase M16 domain protein  27.03 
 
 
490 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.854323 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0738  peptidase M16 domain-containing protein  29.56 
 
 
506 aa  184  3e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0658  peptidase M16 domain protein  28.51 
 
 
490 aa  183  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0678  peptidase M16 domain protein  28.44 
 
 
490 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2529  peptidase M16-like  25.7 
 
 
479 aa  182  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657024 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3229  peptidase M16 domain-containing protein  27.25 
 
 
449 aa  177  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1932  peptidase M16-like  27.08 
 
 
434 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.166044  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5339  peptidase M16-like  29.78 
 
 
495 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2143  peptidase M16 domain-containing protein  27.7 
 
 
444 aa  175  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0006113  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0095  peptidase M16-like  27.35 
 
 
457 aa  171  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.212806  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  28.1 
 
 
921 aa  171  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0928  M16 family peptidase  25.17 
 
 
478 aa  171  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3464  peptidase M16 domain protein  28.51 
 
 
929 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.694105  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3528  peptidase M16 domain protein  28.51 
 
 
949 aa  170  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3630  peptidase M16 domain-containing protein  27 
 
 
474 aa  169  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120244  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3381  peptidase M16-like  27.71 
 
 
947 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.529886  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  28.92 
 
 
954 aa  167  5e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3166  peptidase M16-like  28.54 
 
 
465 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972339  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2774  peptidase M16-like  26.88 
 
 
494 aa  164  4.0000000000000004e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171699  normal  0.336498 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1096  putative zinc protease  28.54 
 
 
435 aa  162  9e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0917813  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  27.55 
 
 
945 aa  162  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0352  peptidase M16 domain-containing protein  28.41 
 
 
494 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2759  peptidase M16 domain-containing protein  28.29 
 
 
435 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.482454  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2986  hypothetical protein  28.19 
 
 
438 aa  161  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4986  peptidase M16 domain-containing protein  28.81 
 
 
496 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0425  hypothetical protein  28.03 
 
 
497 aa  161  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  27.34 
 
 
954 aa  160  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0466  hypothetical protein  29.82 
 
 
495 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0735  peptidase M16-like protein  28.29 
 
 
446 aa  160  7e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.322228  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0064  hypothetical protein  28.01 
 
 
441 aa  159  8e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04870  hypothetical protein  29.82 
 
 
495 aa  159  9e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2546  peptidase M16  28.61 
 
 
464 aa  159  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.774857  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2736  peptidase M16-like  27.74 
 
 
436 aa  159  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4753  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  27.64 
 
 
496 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0542028 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0089  insulinase family protease/insulinase family protease  26.98 
 
 
952 aa  157  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5113  peptidase M16 domain protein  28.99 
 
 
496 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2932  peptidase M16 domain-containing protein  27.88 
 
 
435 aa  156  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00273902  normal  0.175117 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4177  peptidase M16 domain-containing protein  28.41 
 
 
486 aa  156  7e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.733027  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4170  peptidase M16 domain protein  27.25 
 
 
969 aa  156  9e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.732695 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5163  peptidase M16 domain-containing protein  28.74 
 
 
496 aa  156  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2752  peptidase M16 domain protein  26.68 
 
 
494 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4079  M16 family metallopeptidase  25.68 
 
 
959 aa  154  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0642  exported pepdidase, putative zinc protease  27.13 
 
 
950 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0291  peptidase M16 domain-containing protein  26.2 
 
 
464 aa  154  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1980  peptidase, putative  24.15 
 
 
479 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1391  peptidase M16-like  27.7 
 
 
456 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02700  putative metallopeptidase, M16 family protein  27.51 
 
 
687 aa  152  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  27.85 
 
 
945 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4034  peptidase M16-like  27.83 
 
 
462 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0188  zinc protease  25.51 
 
 
454 aa  151  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1057  M16 family peptidase  26.22 
 
 
945 aa  150  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.867585 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0621  peptidase M16-like  25.87 
 
 
725 aa  150  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1483  peptidase M16-like  26.77 
 
 
515 aa  150  5e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0660842  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1365  peptidase M16-like  26.38 
 
 
958 aa  150  6e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03520  peptidase M16-like protein  28.01 
 
 
494 aa  149  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00585109  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4857  peptidase M16 domain protein  26.55 
 
 
477 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1712  putative Zn-dependent protease  27.48 
 
 
460 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  26.86 
 
 
945 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  26.97 
 
 
937 aa  148  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3795  peptidase M16-like  26.43 
 
 
448 aa  147  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.417189  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04156  zinc protease  25.17 
 
 
956 aa  147  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  27.4 
 
 
896 aa  147  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2599  hypothetical protein  27.86 
 
 
434 aa  146  6e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1940  peptidase M16-like  28.84 
 
 
437 aa  146  9e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0362  peptidase M16 protein  27.08 
 
 
437 aa  146  9e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0563461  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2726  hypothetical protein  27.71 
 
 
434 aa  145  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4178  peptidase M16-like  26.68 
 
 
462 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0931  insulinase-like peptidase  26.99 
 
 
528 aa  145  2e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0647883  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3721  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  29.44 
 
 
429 aa  145  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0690318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>