More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0270 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0388  putative Zinc protease-like signal peptide protein  86.71 
 
 		 447 aa  741    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.886206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0243  peptidase M16 domain protein  97.78 
 
 		 450 aa  825    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0270  peptidase M16 domain protein  100 
 
 		 450 aa  899    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.582885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0283  peptidase M16-like protein  68.57 
 
 		 454 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0571104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0336  peptidase M16, C-terminal  65.88 
 
 		 453 aa  541  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.469062  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1280  peptidase M16-like  50 
 
 		 461 aa  443  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4372  peptidase M16 domain protein  52.94 
 
 		 448 aa  439  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1670  peptidase M16-like  52.21 
 
 		 471 aa  434  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0893  peptidase M16 domain-containing protein  51.54 
 
 		 451 aa  433  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0504062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1801  peptidase M16 domain-containing protein  49.45 
 
 		 453 aa  431  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.36256  normal  0.940688 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0378  insulinase family protein  48.85 
 
 		 435 aa  414  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.621778  hitchhiker  0.00954863 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3721  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  48 
 
 		 429 aa  410  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0690318 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0735  peptidase M16-like protein  47.01 
 
 		 446 aa  402  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.322228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3871  peptidase M16 domain-containing protein  49.76 
 
 		 453 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3518  peptidase M16 domain-containing protein  48.25 
 
 		 460 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3618  peptidase M16 domain protein  51.08 
 
 		 467 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2841  peptidase M16 domain protein  48.47 
 
 		 460 aa  398  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.279982  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1631  peptidase M16 domain protein  43.11 
 
 		 445 aa  385  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.368966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4763  peptidase M16 domain-containing protein  48.36 
 
 		 448 aa  388  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2736  peptidase M16-like  44.47 
 
 		 436 aa  385  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1926  peptidase M16 domain-containing protein  42.5 
 
 		 445 aa  375  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2986  hypothetical protein  42.45 
 
 		 438 aa  342  1e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1932  peptidase M16-like  40.36 
 
 		 434 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.166044  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0064  hypothetical protein  43.81 
 
 		 441 aa  324  2e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1940  peptidase M16-like  37.56 
 
 		 437 aa  311  2e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2599  hypothetical protein  37.71 
 
 		 434 aa  305  9.000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2726  hypothetical protein  37.71 
 
 		 434 aa  305  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2106  M16 family peptidase  39.91 
 
 		 443 aa  302  9e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0218  non-proteolytic protein, peptidase family M16  39.69 
 
 		 443 aa  301  1e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03520  peptidase M16-like protein  40.57 
 
 		 494 aa  298  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00585109  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4177  peptidase M16 domain-containing protein  40.24 
 
 		 486 aa  297  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.733027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0466  hypothetical protein  39.9 
 
 		 495 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04870  hypothetical protein  39.67 
 
 		 495 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0172  peptidase M16 domain protein  35.52 
 
 		 441 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5339  peptidase M16-like  39.19 
 
 		 495 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2657  peptidase M16 domain-containing protein  37.12 
 
 		 481 aa  281  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235444 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4753  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  38.57 
 
 		 496 aa  279  9e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0542028 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0352  peptidase M16 domain-containing protein  38.19 
 
 		 494 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4986  peptidase M16 domain-containing protein  38.19 
 
 		 496 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0425  hypothetical protein  37.86 
 
 		 497 aa  272  9e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5163  peptidase M16 domain-containing protein  37.8 
 
 		 496 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5113  peptidase M16 domain protein  37.8 
 
 		 496 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0931  insulinase-like peptidase  34.58 
 
 		 528 aa  244  3e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0647883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1483  peptidase M16-like  33.73 
 
 		 515 aa  244  3e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0660842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1783  peptidase M16 domain-containing protein  31.72 
 
 		 504 aa  235  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3039  peptidase M16 domain-containing protein  31.53 
 
 		 451 aa  223  7e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0296274  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0291  peptidase M16 domain-containing protein  32.47 
 
 		 464 aa  217  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0095  peptidase M16-like  32.43 
 
 		 457 aa  215  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.212806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0188  zinc protease  30.35 
 
 		 454 aa  211  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2307  peptidase M16 domain-containing protein  30.73 
 
 		 451 aa  209  6e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2932  peptidase M16 domain-containing protein  31.19 
 
 		 435 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00273902  normal  0.175117 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2973  peptidase M16-like  31.75 
 
 		 447 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2529  peptidase M16-like  30.62 
 
 		 479 aa  196  6e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657024 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3229  peptidase M16 domain-containing protein  28.84 
 
 		 449 aa  196  6e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0362  peptidase M16 protein  30.93 
 
 		 437 aa  194  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0563461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2143  peptidase M16 domain-containing protein  29.41 
 
 		 444 aa  191  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0006113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2714  peptidase M16 domain-containing protein  30.73 
 
 		 437 aa  191  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.80374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1096  putative zinc protease  30.86 
 
 		 435 aa  190  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0917813  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2759  peptidase M16 domain-containing protein  30.39 
 
 		 435 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.482454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2203  peptidase M16 domain-containing protein  30.94 
 
 		 457 aa  187  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.339907  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2079  peptidase M16 domain protein  30.86 
 
 		 439 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3630  peptidase M16 domain-containing protein  27.91 
 
 		 474 aa  184  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120244  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1980  peptidase, putative  27.79 
 
 		 479 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1994  peptidase M16 domain protein  30.63 
 
 		 439 aa  183  7e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2284  peptidase M16 domain protein  29.98 
 
 		 427 aa  182  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.538642 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3166  peptidase M16-like  29.09 
 
 		 465 aa  182  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972339  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1866  peptidase M16-like  31.02 
 
 		 439 aa  180  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1973  peptidase M16 domain-containing protein  30.65 
 
 		 439 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1802  peptidase M16 domain-containing protein  31.91 
 
 		 431 aa  177  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0228874 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2606  peptidase M16 domain protein  29.74 
 
 		 427 aa  176  5e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.36599  normal  0.289555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2329  peptidase M16 domain-containing protein  29.74 
 
 		 427 aa  176  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.504761  normal  0.793459 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2864  peptidase M16 domain protein  29.49 
 
 		 435 aa  176  8e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0431623 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2546  peptidase M16  29.11 
 
 		 464 aa  176  9e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.774857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0686  peptidase M16 domain protein  28.16 
 
 		 495 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000768524  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0698  peptidase M16 domain protein  27.67 
 
 		 495 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147325 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  28.57 
 
 		 896 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0497  peptidase M16 domain protein  27.68 
 
 		 471 aa  172  9e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0152628  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  30.31 
 
 		 954 aa  171  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4178  peptidase M16-like  29.63 
 
 		 462 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4857  peptidase M16 domain protein  28.92 
 
 		 477 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4989  peptidase M16 domain-containing protein  29.17 
 
 		 456 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0928  M16 family peptidase  28.37 
 
 		 478 aa  167  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2216  peptidase M16 domain-containing protein  29.36 
 
 		 433 aa  167  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.384434  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0091  peptidase M16 domain protein  28.4 
 
 		 767 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4046  peptidase M16-like  26.38 
 
 		 444 aa  166  9e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1712  putative Zn-dependent protease  29.31 
 
 		 460 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0395  peptidase M16 domain protein  29.1 
 
 		 437 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412071  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1391  peptidase M16-like  29.14 
 
 		 456 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4034  peptidase M16-like  28.6 
 
 		 462 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3216  peptidase M16 domain-containing protein  25.93 
 
 		 476 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5116  peptidase M16 domain protein  28.71 
 
 		 456 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4179  peptidase M16 domain-containing protein  27.79 
 
 		 430 aa  160  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4371  peptidase M16-like  28.32 
 
 		 512 aa  160  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.325226 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2774  peptidase M16-like  29.02 
 
 		 494 aa  159  9e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171699  normal  0.336498 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0431  peptidase M16-like  28.32 
 
 		 451 aa  158  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2345  peptidase M16 domain protein  28.24 
 
 		 490 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.854323 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5166  peptidase M16 domain-containing protein  29.52 
 
 		 457 aa  153  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1010  peptidase M16 domain-containing protein  28.67 
 
 		 426 aa  152  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.346738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  26.51 
 
 		 945 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  27.51 
 
 		 937 aa  152  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>