More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4179 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4179  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 
430 aa  853    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2216  peptidase M16 domain-containing protein  89.04 
 
 
433 aa  727    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.384434  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0395  peptidase M16 domain protein  92.89 
 
 
437 aa  741    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412071  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2606  peptidase M16 domain protein  72.36 
 
 
427 aa  611  9.999999999999999e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.36599  normal  0.289555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2329  peptidase M16 domain-containing protein  72.12 
 
 
427 aa  608  1e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.504761  normal  0.793459 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2284  peptidase M16 domain protein  72.6 
 
 
427 aa  609  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.538642 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1802  peptidase M16 domain-containing protein  72.37 
 
 
431 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0228874 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2864  peptidase M16 domain protein  48.14 
 
 
435 aa  389  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0431623 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1010  peptidase M16 domain-containing protein  51.89 
 
 
426 aa  391  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.346738  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2203  peptidase M16 domain-containing protein  47.97 
 
 
457 aa  372  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.339907  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0291  peptidase M16 domain-containing protein  45.56 
 
 
464 aa  357  2.9999999999999997e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1712  putative Zn-dependent protease  44.74 
 
 
460 aa  353  4e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3166  peptidase M16-like  46.19 
 
 
465 aa  350  3e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972339  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2546  peptidase M16  44.79 
 
 
464 aa  343  4e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.774857  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4178  peptidase M16-like  44.12 
 
 
462 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4034  peptidase M16-like  43.65 
 
 
462 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1391  peptidase M16-like  43.63 
 
 
456 aa  333  5e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3039  peptidase M16 domain-containing protein  42.57 
 
 
451 aa  332  6e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0296274  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0188  zinc protease  42.82 
 
 
454 aa  329  6e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4857  peptidase M16 domain protein  42.21 
 
 
477 aa  323  5e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0362  peptidase M16 protein  45.5 
 
 
437 aa  316  5e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0563461  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0200  peptidase M16 domain protein  43.63 
 
 
412 aa  301  1e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2932  peptidase M16 domain-containing protein  42.35 
 
 
435 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00273902  normal  0.175117 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2973  peptidase M16-like  41.43 
 
 
447 aa  293  3e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2714  peptidase M16 domain-containing protein  41.59 
 
 
437 aa  291  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.80374  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0095  peptidase M16-like  39.66 
 
 
457 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.212806  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1096  putative zinc protease  41.02 
 
 
435 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0917813  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2759  peptidase M16 domain-containing protein  41.02 
 
 
435 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.482454  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4046  peptidase M16-like  38.14 
 
 
444 aa  269  5.9999999999999995e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0431  peptidase M16-like  39.29 
 
 
451 aa  258  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7811  putative Zn-dependent protease  35.11 
 
 
439 aa  225  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0101927  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1932  peptidase M16-like  33.1 
 
 
434 aa  203  4e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.166044  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2143  peptidase M16 domain-containing protein  32.83 
 
 
444 aa  201  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0006113  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0064  hypothetical protein  32.09 
 
 
441 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3618  peptidase M16 domain protein  37.87 
 
 
467 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3721  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  32.92 
 
 
429 aa  196  5.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0690318 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0378  insulinase family protein  33.17 
 
 
435 aa  190  4e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.621778  hitchhiker  0.00954863 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1058  M16 family peptidase  26.02 
 
 
451 aa  190  4e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2986  hypothetical protein  32.3 
 
 
438 aa  189  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3518  peptidase M16 domain-containing protein  32.45 
 
 
460 aa  189  8e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2599  hypothetical protein  28.78 
 
 
434 aa  186  6e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2726  hypothetical protein  28.78 
 
 
434 aa  186  9e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2736  peptidase M16-like  30.39 
 
 
436 aa  184  3e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1980  peptidase, putative  32.54 
 
 
479 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0850  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  25.06 
 
 
451 aa  181  2e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.669926  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2841  peptidase M16 domain protein  32.29 
 
 
460 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.279982  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0283  peptidase M16-like protein  30.33 
 
 
454 aa  179  8e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0571104  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4763  peptidase M16 domain-containing protein  31.57 
 
 
448 aa  178  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0893  peptidase M16 domain-containing protein  30.18 
 
 
451 aa  179  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0504062  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0497  peptidase M16 domain protein  32.21 
 
 
471 aa  179  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0152628  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1801  peptidase M16 domain-containing protein  31.26 
 
 
453 aa  177  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.36256  normal  0.940688 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3871  peptidase M16 domain-containing protein  31.13 
 
 
453 aa  176  9e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0913  M16 family peptidase  28.19 
 
 
448 aa  175  9.999999999999999e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.226021  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2529  peptidase M16-like  31.26 
 
 
479 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657024 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0388  putative Zinc protease-like signal peptide protein  29.3 
 
 
447 aa  172  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.886206  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1866  peptidase M16-like  30.67 
 
 
439 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1670  peptidase M16-like  31.35 
 
 
471 aa  172  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3630  peptidase M16 domain-containing protein  30.5 
 
 
474 aa  172  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120244  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0762  M16 family peptidase putative  24.94 
 
 
439 aa  171  3e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.655264  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0243  peptidase M16 domain protein  29.23 
 
 
450 aa  169  9e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1280  peptidase M16-like  30.68 
 
 
461 aa  168  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0270  peptidase M16 domain protein  29.23 
 
 
450 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.582885  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0686  peptidase M16 domain protein  30.92 
 
 
495 aa  167  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000768524  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0336  peptidase M16, C-terminal  29.44 
 
 
453 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.469062  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1926  peptidase M16 domain-containing protein  27.87 
 
 
445 aa  166  9e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2079  peptidase M16 domain protein  30.15 
 
 
439 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3229  peptidase M16 domain-containing protein  29.74 
 
 
449 aa  164  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2273  peptidase M16 domain-containing protein  31.86 
 
 
438 aa  164  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.359911  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4372  peptidase M16 domain protein  31.35 
 
 
448 aa  163  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0698  peptidase M16 domain protein  30.99 
 
 
495 aa  163  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147325 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1994  peptidase M16 domain protein  29.9 
 
 
439 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1631  peptidase M16 domain protein  27.91 
 
 
445 aa  162  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.368966  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2657  peptidase M16 domain-containing protein  30.96 
 
 
481 aa  161  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235444 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3216  peptidase M16 domain-containing protein  29.2 
 
 
476 aa  161  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1783  peptidase M16 domain-containing protein  26.77 
 
 
504 aa  160  6e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0928  M16 family peptidase  30.79 
 
 
478 aa  157  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4177  peptidase M16 domain-containing protein  29.41 
 
 
486 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.733027  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1940  peptidase M16-like  25.49 
 
 
437 aa  156  6e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0172  peptidase M16 domain protein  29.62 
 
 
441 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04870  hypothetical protein  28.64 
 
 
495 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2307  peptidase M16 domain-containing protein  29.93 
 
 
451 aa  152  8.999999999999999e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0466  hypothetical protein  29.34 
 
 
495 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0735  peptidase M16-like protein  28.61 
 
 
446 aa  152  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.322228  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1973  peptidase M16 domain-containing protein  28.61 
 
 
439 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333258  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0425  hypothetical protein  26.44 
 
 
497 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4753  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  27.21 
 
 
496 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0542028 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4986  peptidase M16 domain-containing protein  28.22 
 
 
496 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1483  peptidase M16-like  26.37 
 
 
515 aa  145  9e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0660842  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5339  peptidase M16-like  27.52 
 
 
495 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5163  peptidase M16 domain-containing protein  28.11 
 
 
496 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  27.47 
 
 
954 aa  144  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0352  peptidase M16 domain-containing protein  27.86 
 
 
494 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1059  peptidase M16-like  29.13 
 
 
421 aa  143  7e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0076042  hitchhiker  0.00221195 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0931  insulinase-like peptidase  26.44 
 
 
528 aa  142  9e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0647883  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5113  peptidase M16 domain protein  27.86 
 
 
496 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0178  peptidase M16 domain protein  29.77 
 
 
421 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2106  M16 family peptidase  24.77 
 
 
443 aa  138  2e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0218  non-proteolytic protein, peptidase family M16  24.88 
 
 
443 aa  138  2e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0621  peptidase M16-like  26.53 
 
 
725 aa  136  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1839  processing peptidase  25.44 
 
 
432 aa  136  8e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.814022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>