More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7811 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7811  putative Zn-dependent protease  100 
 
 
439 aa  892    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0101927  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0291  peptidase M16 domain-containing protein  34.52 
 
 
464 aa  254  3e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2932  peptidase M16 domain-containing protein  37.2 
 
 
435 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00273902  normal  0.175117 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2203  peptidase M16 domain-containing protein  37.14 
 
 
457 aa  246  4.9999999999999997e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.339907  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1391  peptidase M16-like  35.78 
 
 
456 aa  239  9e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2973  peptidase M16-like  34.52 
 
 
447 aa  231  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4178  peptidase M16-like  34.3 
 
 
462 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2546  peptidase M16  32.93 
 
 
464 aa  229  1e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.774857  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3166  peptidase M16-like  34.56 
 
 
465 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972339  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2714  peptidase M16 domain-containing protein  32.41 
 
 
437 aa  226  7e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.80374  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4034  peptidase M16-like  33.57 
 
 
462 aa  226  9e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2864  peptidase M16 domain protein  33.25 
 
 
435 aa  225  1e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0431623 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1712  putative Zn-dependent protease  34.62 
 
 
460 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2759  peptidase M16 domain-containing protein  34.3 
 
 
435 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.482454  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1096  putative zinc protease  34.3 
 
 
435 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0917813  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0362  peptidase M16 protein  33.49 
 
 
437 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0563461  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2216  peptidase M16 domain-containing protein  36.32 
 
 
433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.384434  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2284  peptidase M16 domain protein  35 
 
 
427 aa  219  5e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.538642 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4857  peptidase M16 domain protein  33.33 
 
 
477 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1802  peptidase M16 domain-containing protein  35.45 
 
 
431 aa  216  7e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0228874 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0395  peptidase M16 domain protein  34.93 
 
 
437 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412071  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2329  peptidase M16 domain-containing protein  34.52 
 
 
427 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.504761  normal  0.793459 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2606  peptidase M16 domain protein  34.52 
 
 
427 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.36599  normal  0.289555 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4046  peptidase M16-like  33.41 
 
 
444 aa  211  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4179  peptidase M16 domain-containing protein  35.11 
 
 
430 aa  211  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3039  peptidase M16 domain-containing protein  30.92 
 
 
451 aa  207  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0296274  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1010  peptidase M16 domain-containing protein  32.53 
 
 
426 aa  207  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.346738  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0188  zinc protease  31.23 
 
 
454 aa  207  4e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0095  peptidase M16-like  30.35 
 
 
457 aa  205  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.212806  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0200  peptidase M16 domain protein  32.44 
 
 
412 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1058  M16 family peptidase  27.66 
 
 
451 aa  177  3e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0431  peptidase M16-like  32.22 
 
 
451 aa  171  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3721  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  30 
 
 
429 aa  157  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0690318 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0913  M16 family peptidase  27.16 
 
 
448 aa  157  3e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.226021  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0850  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  25.4 
 
 
451 aa  149  9e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.669926  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1932  peptidase M16-like  25.97 
 
 
434 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.166044  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2307  peptidase M16 domain-containing protein  28.88 
 
 
451 aa  145  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0762  M16 family peptidase putative  26.15 
 
 
439 aa  143  6e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.655264  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0378  insulinase family protein  27.42 
 
 
435 aa  139  7e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.621778  hitchhiker  0.00954863 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0735  peptidase M16-like protein  27.25 
 
 
446 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.322228  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1980  peptidase, putative  26.62 
 
 
479 aa  139  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2143  peptidase M16 domain-containing protein  27.06 
 
 
444 aa  138  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0006113  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2736  peptidase M16-like  26.48 
 
 
436 aa  136  8e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0064  hypothetical protein  27.58 
 
 
441 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2726  hypothetical protein  25.87 
 
 
434 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2599  hypothetical protein  25.64 
 
 
434 aa  134  5e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2986  hypothetical protein  28.74 
 
 
438 aa  134  5e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2657  peptidase M16 domain-containing protein  29.16 
 
 
481 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235444 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0110  peptidase M16 domain protein  26.83 
 
 
520 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.282099  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0103  peptidase M16-like  27.95 
 
 
519 aa  126  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.968685  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1783  peptidase M16 domain-containing protein  25.23 
 
 
504 aa  126  8.000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1801  peptidase M16 domain-containing protein  27.29 
 
 
453 aa  125  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.36256  normal  0.940688 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0121  peptidase M16 domain protein  26.83 
 
 
520 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1926  peptidase M16 domain-containing protein  22.93 
 
 
445 aa  124  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0931  insulinase-like peptidase  26.17 
 
 
528 aa  124  5e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0647883  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1973  peptidase M16 domain-containing protein  27 
 
 
439 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333258  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04870  hypothetical protein  26.43 
 
 
495 aa  124  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0466  hypothetical protein  26.43 
 
 
495 aa  123  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  26.29 
 
 
876 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0283  peptidase M16-like protein  25.71 
 
 
454 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0571104  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  26.05 
 
 
943 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0270  peptidase M16 domain protein  26.78 
 
 
450 aa  121  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.582885  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3871  peptidase M16 domain-containing protein  28.71 
 
 
453 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5339  peptidase M16-like  25.72 
 
 
495 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2529  peptidase M16-like  25.67 
 
 
479 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657024 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1631  peptidase M16 domain protein  23.49 
 
 
445 aa  119  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.368966  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1483  peptidase M16-like  25 
 
 
515 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0660842  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0425  hypothetical protein  24.7 
 
 
497 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4753  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  24.22 
 
 
496 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0542028 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1940  peptidase M16-like  23.04 
 
 
437 aa  117  3e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3630  peptidase M16 domain-containing protein  24.69 
 
 
474 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120244  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3518  peptidase M16 domain-containing protein  29.14 
 
 
460 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1618  two-component response regulator family protein  29.76 
 
 
409 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0928  M16 family peptidase  26.94 
 
 
478 aa  114  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2841  peptidase M16 domain protein  28.44 
 
 
460 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.279982  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1866  peptidase M16-like  26.91 
 
 
439 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1706  peptidase M16 domain protein  23.71 
 
 
411 aa  113  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.425033  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0243  peptidase M16 domain protein  25.83 
 
 
450 aa  113  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1568  peptidase M16-like  23.7 
 
 
425 aa  113  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000011969  decreased coverage  0.00224891 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3618  peptidase M16 domain protein  27.37 
 
 
467 aa  112  9e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3615  peptidase M16 domain protein  24.15 
 
 
421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785014 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4986  peptidase M16 domain-containing protein  24.34 
 
 
496 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2273  peptidase M16 domain-containing protein  25.89 
 
 
438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.359911  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0388  putative Zinc protease-like signal peptide protein  26.3 
 
 
447 aa  111  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.886206  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5113  peptidase M16 domain protein  24.22 
 
 
496 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2056  peptidase M16 domain protein  24.53 
 
 
413 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3580  peptidase M16 domain-containing protein  25.18 
 
 
482 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3564  zinc protease  23.3 
 
 
413 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3656  zinc protease  23.3 
 
 
413 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.200109  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3546  zinc protease  23.3 
 
 
413 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3942  zinc protease  23.3 
 
 
413 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3816  zinc protease, insulinase family  23.3 
 
 
413 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3852  zinc protease, insulinase family  23.3 
 
 
413 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000305728  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3903  zinc protease, insulinase family  23.3 
 
 
413 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141801  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1419  processing peptidase  24.61 
 
 
424 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0419  peptidase M16-like protein  23.56 
 
 
419 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0405  peptidase M16-like  26.32 
 
 
427 aa  108  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1341  zinc protease, insulinase family  23.3 
 
 
399 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.411991 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3843  zinc protease  23.04 
 
 
413 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0352  peptidase M16 domain-containing protein  23.63 
 
 
494 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>