More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0928 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0928  M16 family peptidase  100 
 
 
478 aa  968    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2529  peptidase M16-like  76.94 
 
 
479 aa  753    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657024 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3630  peptidase M16 domain-containing protein  70.29 
 
 
474 aa  695    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120244  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0698  peptidase M16 domain protein  61.55 
 
 
495 aa  598  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147325 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0686  peptidase M16 domain protein  60.5 
 
 
495 aa  589  1e-167  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000768524  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0497  peptidase M16 domain protein  57.08 
 
 
471 aa  534  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0152628  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3216  peptidase M16 domain-containing protein  52.74 
 
 
476 aa  513  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1980  peptidase, putative  43.02 
 
 
479 aa  355  1e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1597  peptidase M16 domain-containing protein  39.28 
 
 
466 aa  327  3e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.832035  normal  0.315453 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0678  peptidase M16 domain protein  37.55 
 
 
490 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0621  peptidase M16-like  38.91 
 
 
725 aa  318  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0658  peptidase M16 domain protein  37.34 
 
 
490 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2774  peptidase M16-like  36.9 
 
 
494 aa  316  6e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171699  normal  0.336498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4371  peptidase M16-like  39.95 
 
 
512 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.325226 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2345  peptidase M16 domain protein  36.97 
 
 
490 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.854323 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0738  peptidase M16 domain-containing protein  37.88 
 
 
506 aa  302  9e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2752  peptidase M16 domain protein  35.62 
 
 
494 aa  299  7e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0375  processing protease  33.61 
 
 
471 aa  253  4.0000000000000004e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3229  peptidase M16 domain-containing protein  34.2 
 
 
449 aa  232  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0110  peptidase M16 domain protein  34.38 
 
 
520 aa  216  9e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.282099  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0121  peptidase M16 domain protein  34.38 
 
 
520 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0103  peptidase M16-like  33.89 
 
 
519 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.968685  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  29.2 
 
 
945 aa  205  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  31.26 
 
 
896 aa  203  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1994  peptidase M16 domain protein  28.77 
 
 
439 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  28.99 
 
 
937 aa  191  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2079  peptidase M16 domain protein  28.54 
 
 
439 aa  190  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1866  peptidase M16-like  28.08 
 
 
439 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0091  peptidase M16 domain protein  29.21 
 
 
767 aa  188  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3721  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  30.31 
 
 
429 aa  187  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0690318 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02700  putative metallopeptidase, M16 family protein  30.38 
 
 
687 aa  187  4e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3485  peptidase M16-like protein  25.31 
 
 
502 aa  182  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.320343  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3947  peptidase M16 domain-containing protein  24.52 
 
 
481 aa  176  7e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  28.12 
 
 
943 aa  176  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0365  processing peptidase  28.12 
 
 
424 aa  174  3.9999999999999995e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0283  peptidase M16-like protein  30.12 
 
 
454 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0571104  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3580  peptidase M16 domain-containing protein  25.21 
 
 
482 aa  173  5e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0208  peptidase M16 domain-containing protein  25.8 
 
 
487 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0210  peptidase M16 domain protein  25.8 
 
 
497 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.481547 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3492  peptidase M16 domain-containing protein  25.4 
 
 
477 aa  171  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3443  peptidase M16-like protein  25.45 
 
 
473 aa  171  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3939  DNA-directed RNA polymerase  25.17 
 
 
487 aa  171  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4255  peptidase M16 domain-containing protein  25.8 
 
 
492 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4129  peptidase M16 domain-containing protein  25.57 
 
 
492 aa  171  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4310  peptidase M16-like  27.46 
 
 
427 aa  170  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914199  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3741  peptidase M16 domain-containing protein  25.17 
 
 
486 aa  170  6e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  29.62 
 
 
921 aa  169  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3814  peptidase M16 domain-containing protein  25.17 
 
 
487 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  27.19 
 
 
954 aa  168  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  27.46 
 
 
954 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0109  peptidase M16 domain protein  26.91 
 
 
456 aa  166  1.0000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0388  putative Zinc protease-like signal peptide protein  30.6 
 
 
447 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.886206  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1973  peptidase M16 domain-containing protein  27.97 
 
 
439 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333258  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5792  peptidase M16 domain protein  25.06 
 
 
458 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.047663 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  29.25 
 
 
945 aa  164  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0735  peptidase M16-like protein  28.27 
 
 
446 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.322228  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0064  hypothetical protein  29.58 
 
 
441 aa  163  8.000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1926  peptidase M16 domain-containing protein  27.56 
 
 
445 aa  161  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0262  peptidase M16 domain-containing protein  24.68 
 
 
480 aa  161  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000120782  normal  0.152415 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1631  peptidase M16 domain protein  27.53 
 
 
445 aa  161  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.368966  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2143  peptidase M16 domain-containing protein  26.48 
 
 
444 aa  160  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0006113  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0291  peptidase M16 domain-containing protein  27.63 
 
 
464 aa  160  7e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0261  peptidase M16 domain-containing protein  24.04 
 
 
481 aa  159  8e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3615  peptidase M16 domain protein  28.25 
 
 
421 aa  159  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785014 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0966  peptidase M16-like  27.07 
 
 
413 aa  159  9e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4177  peptidase M16 domain-containing protein  30.67 
 
 
486 aa  159  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.733027  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2273  peptidase M16 domain-containing protein  29.95 
 
 
438 aa  159  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.359911  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0304  peptidase M16 domain-containing protein  24.66 
 
 
483 aa  159  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0243  peptidase M16 domain protein  28.61 
 
 
450 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0270  peptidase M16 domain protein  28.02 
 
 
450 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.582885  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2284  peptidase M16 domain protein  29.47 
 
 
427 aa  157  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.538642 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2329  peptidase M16 domain-containing protein  29.22 
 
 
427 aa  156  8e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.504761  normal  0.793459 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2714  peptidase M16 domain-containing protein  29.63 
 
 
437 aa  155  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.80374  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0336  peptidase M16, C-terminal  31.03 
 
 
453 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.469062  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2606  peptidase M16 domain protein  29.22 
 
 
427 aa  155  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.36599  normal  0.289555 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2973  peptidase M16-like  29.46 
 
 
447 aa  154  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4197  peptidase M16 domain protein  27.45 
 
 
421 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4236  processing peptidase  27.45 
 
 
421 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00385925 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2736  peptidase M16-like  28.11 
 
 
436 aa  152  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1365  peptidase M16-like  26.27 
 
 
958 aa  152  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1058  M16 family peptidase  26.71 
 
 
451 aa  152  2e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1670  peptidase M16-like  27.83 
 
 
471 aa  152  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4170  peptidase M16 domain protein  27.95 
 
 
969 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.732695 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0178  peptidase M16 domain protein  28.47 
 
 
421 aa  152  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1328  peptidase M16 domain-containing protein  27.87 
 
 
944 aa  150  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.438205  normal  0.0130612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0395  peptidase M16 domain protein  31.52 
 
 
437 aa  151  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412071  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0425  hypothetical protein  30.19 
 
 
497 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4753  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  30.05 
 
 
496 aa  150  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0542028 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2704  peptidase M16 domain protein  24.55 
 
 
458 aa  150  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1226  peptidase M16 domain-containing protein  26.2 
 
 
944 aa  149  9e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1483  peptidase M16-like  28.1 
 
 
515 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0660842  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1802  peptidase M16 domain-containing protein  30.81 
 
 
431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0228874 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2726  hypothetical protein  27.12 
 
 
434 aa  148  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4179  peptidase M16 domain-containing protein  30.79 
 
 
430 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  25.51 
 
 
945 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2216  peptidase M16 domain-containing protein  32.17 
 
 
433 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.384434  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2599  hypothetical protein  26.42 
 
 
434 aa  146  8.000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1955  peptidase M16 domain-containing protein  26.21 
 
 
960 aa  142  9e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.384397  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3381  peptidase M16-like  28.41 
 
 
947 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.529886  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0095  peptidase M16-like  27.05 
 
 
457 aa  142  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.212806  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>